Le profilage des métabolites fécaux prédit l’infection chez les receveurs de transplantation hépatique

Le profilage des métabolites fécaux pourrait être un outil viable pour prédire les infections postopératoires chez les patients ayant reçu une transplantation hépatique, selon les résultats d’une étude récente publiée dans Hôte cellulaire et microbe.

Les métabolites fécaux ont été quantifiés chez plus de 100 patients subissant une transplantation hépatique et corrélés à la composition du microbiome fécal, à l’expansion des pathobiontes et aux infections postopératoires, démontrant que les concentrations fécales réduites d’acides gras à chaîne courte et ramifiée, d’acides biliaires secondaires et de métabolites du tryptophane étaient associées à dysbiose compositionnelle du microbiome et risque relatif d’infection postopératoire.¹

La résistance aux antimicrobiens et le développement d’agents pathogènes résistants aux médicaments rendent les infections plus difficiles à traiter et rendent les autres procédures et traitements médicaux beaucoup plus risqués. L’infection est une complication majeure de la transplantation hépatique, avec un risque encore accru par l’utilisation de médicaments immunosuppresseurs anti-rejet. Compte tenu du risque accru d’infection chez cette population de patients, il est essentiel de comprendre le rôle du microbiome dans ce processus.^2,3

« La résistance aux antibiotiques augmente chaque année et s’aggrave. Sans antibiotiques efficaces, nous ne pouvons pas réaliser des opérations chirurgicales, protéger les prématurés ou traiter le cancer », a déclaré Christopher Lehmann, MD, professeur adjoint de médecine à l’Université de Chicago, dans un communiqué de presse.⁴ « Il s’avère que le microbiome humain, en particulier le microbiome intestinal, s’est adapté pour combattre les bactéries résistantes aux médicaments au cours de l’histoire. Nous devons essayer de comprendre comment cela fonctionne pour lutter contre ces infections résistantes aux médicaments.

Les métabolites produits par le microbiome intestinal jouent un rôle important dans la modulation des défenses immunitaires des muqueuses et dans l’optimisation de la fonction de barrière épithéliale. La perte de diversité du microbiome et l’expansion de la résistance aux antibiotiques sont signalées par des modifications des concentrations de métabolites fécaux et des infections systémiques plus fréquentes, mais les tests de laboratoire permettant de quantifier cette dybiose n’ont pas encore été mis en œuvre dans la pratique clinique, ni son impact sur les résultats cliniques de la transplantation hépatique. été explorée.¹

Pour corréler les concentrations de métabolites avec les compositions du microbiote fécal, l’expansion d’organismes multirésistants et les infections invasives, Lehmann et une équipe de chercheurs ont réalisé une étude de surveillance prospective chez des receveurs de transplantation hépatique admis au centre médical de l’Université de Chicago pour une transplantation hépatique. Parmi les 158 patients inscrits à l’étude, 107 ont subi une transplantation et ont fourni un échantillon fécal pour la quantification et la corrélation des métabolites.¹

Après analyse, les acides gras à chaîne courte, les acides biliaires secondaires, les vitamines B et d’autres concentrations de métabolites ont permis d’identifier les patients présentant une diversité de microbiome fécal préservée, une densité de colonisation réduite avec des pathobiontes et des taux réduits d’infection postopératoire. Les enquêteurs ont souligné des concentrations fécales réduites d’acides gras à chaîne courte et ramifiée, d’acides biliaires secondaires et de métabolites du tryptophane corrélés à la dysbiose compositionnelle du microbiome et au risque relatif d’infection postopératoire dans cette population de patients.¹

Plutôt que de séquencer les génomes pour identifier des espèces bactériennes spécifiques, les chercheurs ont examiné uniquement les métabolites fécaux pour voir si ces molécules offraient la même valeur prédictive. En plus de distinguer les microbiomes sains des microbiomes malsains, les chercheurs ont découvert que les métabolites pouvaient également prédire une infection future et ont noté que la quantité d’agents pathogènes résistants aux médicaments dans le microbiome prédisait les infections postopératoires avec une précision attendue d’un test clinique, soulignant la forte valeur prédictive des matières fécales. profilage des métabolites.¹

« Nous pouvons passer directement des métabolites à la prédiction d’un résultat clinique. Ceci est important car l’analyse métabolomique peut être réalisée très rapidement, alors que le séquençage est relativement lent », a conclu Lehmann.⁴ “La prochaine étape de ce processus de recherche consistera à déterminer si nous pouvons utiliser ces résultats pour corriger les microbiomes humains.”

Les références:

1. Lehmann CJ, Dylla NP, Odenwald M et al. Le profilage des métabolites fécaux identifie les receveurs de greffe du foie présentant un risque d’infection postopératoire. Hôte cellulaire et microbe. est ce que je:10.1016/j.chom.2023.11.016
2. Organisation Mondiale de la Santé. Résistance aux antimicrobiens. 21 novembre 2023. Consulté le 29 décembre 2023. https://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/antimicrobien-resistance
3. Clinique Mayo. Greffe du foie. Tests et procédures. 20 octobre 2022. Consulté le 29 décembre 2023. https://www.mayoclinic.org/tests-procedures/liver-transplant/about/pac-20384842
4. Centre médical de l’Université de Chicago. Les informations sur le microbiome trouvées dans les excréments aident à prédire les infections chez les patients transplantés hépatiques. EurêkAlerte ! 15 décembre 2023. Consulté le 29 décembre 2023.