Les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) ont classé Candida auris (C. auris) comme une menace publique urgente en raison de son rôle dans l’augmentation de la mortalité, de sa capacité à persister dans les environnements hospitaliers et de la possibilité élevée de développer une résistance pan-médicamenteuse.
Notamment, une étude récente publiée dans la revue Forum ouvert sur les maladies infectieuses a souligné que les surfaces à proximité des patients atteints C. oreille se recontaminent rapidement après le nettoyage.
Les recherches existantes n’ont pas suffisamment élucidé les réservoirs environnementaux de C. auris. De plus, peu d’études ont rapporté des liens épidémiologiques associés à C. oreille infection.
Étude: L’émergence et la persistance de Candida auris dans l’ouest de New York sans lien épidémiologique : un échec de la gestion ? Crédit d’image : Kateryna Kon/Shutterstock
Arrière-plan
C. oreille est une espèce de champignon qui pousse sous forme de levure. C’est l’une des rares espèces du genre Candidose qui causent la candidose chez l’homme. Dans le passé, C. oreille l’infection a été principalement trouvée chez les patients cancéreux ou ceux soumis à des sondes d’alimentation.
Aux États-Unis (US), l’émergence de C. oreille a été retracée à New York, et la surveillance de cette infection fongique s’est concentrée principalement sur la ville de New York pour détecter les épidémies. Récemment, des scientifiques ont étudié l’association entre l’épidémiologie génomique et C. oreille infection dans l’ouest de New York.
Une étude de cas
L’étude décrit l’émergence de C. oreille chez un patient hospitalisé dans un petit hôpital communautaire du comté de Genesee, New York (NY). En janvier 2022, C. oreille a été isolé à partir de la culture d’urine d’un homme de 68 ans au 51e jour d’hospitalisation.
Ce patient n’avait aucun lien épidémiologique connu en dehors de sa communauté immédiate. Avant son hospitalisation, il n’a pas été exposé à d’autres patients ou à des membres de sa famille associés à C. oreille infection.
Ce patient n’avait aucun antécédent de transplantation d’organe, d’ulcère de décubitus, d’hémodialyse, de sonde d’alimentation ou de séjour en maison de retraite. Il menait une vie active avec des antécédents de démence vasculaire légère. Il a été hospitalisé en raison d’une pneumonie et s’est vu prescrire un traitement à l’azithromycine.
Après son hospitalisation, il a été testé positif au coronavirus-2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) et a été traité avec de la dexaméthasone (6 mg) par jour pendant 10 jours et du remdesivir (200 mg) une fois, suivi de 100 mg par jour pendant cinq jours .
Étant donné que la radiographie thoracique du patient montrait une consolidation lobaire gauche, il a ensuite été traité empiriquement avec de la ceftriaxone et de l’azithromycine. Alors que les symptômes respiratoires se détérioraient, il a reçu une ventilation à pression positive non invasive, suivie d’une intubation endotrachéale pendant huit jours. Il a été extubé avec succès. Il a développé de la fièvre et a reçu un traitement antimicrobien pendant 73 jours. Le patient a eu une sonde urinaire et un cathéter central à insertion périphérique dans le bras pendant 35 jours.
Le test de culture microbiologique et les taux de procalcitonine sérique sont restés négatifs et dans les limites de la normale. Au 22ème jour d’hospitalisation, Candida albicans ont été isolés à partir d’échantillons respiratoires. Au 51e jour, la culture d’urine a révélé la présence de C. oreille.
Les isolés C. oreille (MRSN101498) a été transmis au Réseau de stockage et de surveillance des organismes multirésistants (MRSN), où le séquençage génomique a été effectué. Après la sortie du patient, la chambre d’hôpital a été nettoyée à l’aide de peroxyde d’hydrogène et d’acide peracétique, suivis de lumière ultraviolette-C. Les autres patients qui partageaient la chambre du patient avec C. oreille ont été testés pour l’infection.
Résultats de l’étude
C. auris n’a pas été détecté à l’hôpital communautaire Western NY au cours de la dernière année. Les médecins ont déclaré que le patient avait reçu un traitement antibiotique excessif pendant une période prolongée. Des études génomiques ont révélé que la séquence du génome MRSN101498 était étroitement liée à la souche indienne 2013 avec des différences génomiques mineures. Fait intéressant, la mutation K143R dans ERG11 a été trouvée dans MRSN101498, qui est associée à la résistance au triazole chez Candida albicans.
L’analyse du polymorphisme mononucléotidique (SNP) du génome entier a également mis en évidence que MRSN101498 était fortement lié génétiquement à quatre autres isolats, avec des différences marginales.
Ces isolats étaient liés à une épidémie en mars 2017 dans un hôpital à 47 miles au nord-est de Rochester, NY. Sur la base des découvertes actuelles, il est fort probable que les isolats de l’ouest de New York partagent un ancêtre commun récent.
Importance de l’étude
Cette étude de cas est importante pour plusieurs raisons, notamment l’absence de liens épidémiologiques avec C. oreille infection. Étant donné que les rapports provenant des secteurs ruraux sont rares, cette étude porte sur un « angle mort » essentiel de la surveillance.
Cependant, l’étude actuelle n’a pas réussi à identifier les réservoirs potentiels de MRSN101498 dans l’ouest de New York. Les désinfectants sporicides étaient inefficaces pour les deux Clostridioides difficile et C. oreille. Cependant, les protocoles de nettoyage terminal qui comprenaient une irradiation UV et des agents de nettoyage sporicides ont pu éradiquer C. oreille effectivement.
La présente étude met en évidence le rôle d’une exposition excessive aux antibiotiques dans l’émergence de C auris. Il indique également les défis liés à l’élimination des champignons en milieu hospitalier. Les auteurs recommandent un traitement antibiotique et des procédures de nettoyage appropriés pour les agents pathogènes résistants aux médicaments.
