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- MIDAS (spectrométrie de masse intégrée à la dialyse à l’équilibre pour la découverte systématique de l’allosterie), sous licence et industrialisé par Atavistik Bio comme base d’AMPS, est la première plateforme technologique permettant d’identifier systématiquement les interactions protéine-métabolite
- Dans le Science article, MIDAS a identifié plus de 800 interactions protéine-métabolite, y compris de nombreuses interactions connues et jusque-là inconnues provenant de diverses voies métaboliques
- S’appuyant sur la technologie d’origine, Atavistik Bio a intégré l’analyse de données avancée et l’IA dans ses plates-formes de conception de médicaments AMPS et basées sur la structure pour révéler de nouveaux sites de liaison allostériques pertinents pour la maladie et concevoir des médicaments hautement spécifiques
CAMBRIDGE, Mass., 13 mars 2023 (GLOBE NEWSWIRE) — Atavistik Bio, une société de biotechnologie axée sur le développement de petites molécules thérapeutiques transformatrices en révolutionnant la découverte et l’interrogation de nouvelles interactions protéine-métabolite allostérique avec sa plateforme AMPS, a annoncé aujourd’hui une nouvelle parution dans la revue Science par le co-fondateur d’Atavistik Bio, Jared Rutter, Ph.D. décrivant la technologie fondamentale sur laquelle repose la plateforme propriétaire Atavistik Metabolite-Protein Screening (AMPS) de la société.
Au cours de millions d’années, les métabolites ont évolué pour devenir d’importants régulateurs de la fonction des protéines. Ils peuvent activer, stabiliser ou inhiber des protéines cibles, souvent de manière allostérique, et peuvent également dicter des interactions à travers des réseaux complexes pour influencer divers processus cellulaires. Ces interactions protéine-métabolite hautement conservées contiennent de vastes informations pertinentes pour la maladie et exploitables sur le plan thérapeutique ; cependant, ils sont souvent de faible affinité et se sont historiquement avérés difficiles à découvrir systématiquement.
Le Science L’article intitulé “L’interaction protéine-métabolite du métabolisme des glucides révèle la régulation de la lactate déshydrogénase” (Hicks et al.) décrit le développement et la capacité de MIDAS à identifier ces interactions. En collaboration avec un boursier postdoctoral, Kevin Hicks, Ph.D., le Dr Rutter, professeur émérite de biochimie et chercheur HHMI à l’Université de l’Utah, a développé la technologie MIDAS.
« Nous savons depuis longtemps que les interactions protéine-métabolite sont à l’origine de processus cellulaires critiques et, par conséquent, pourraient détenir un potentiel thérapeutique important. Cependant, les outils pour identifier ou interroger efficacement et systématiquement ces interactions ont été limités », a déclaré le Dr Rutter. “Nous sommes heureux de décrire pour la première fois dans ce Science manuscrit la capacité de la technologie MIDAS à identifier et caractériser systématiquement le réseau complexe d’interactions protéine-métabolite et leur importance réglementaire. Déverrouiller la façon dont ces interactions permettent l’homéostasie cellulaire peut aider à éclairer les approches thérapeutiques basées sur les données pour lutter contre la dérégulation cellulaire qui entraîne un large éventail de maladies.
Marion Dorsch, Ph.D., présidente et directrice scientifique d’Atavistik Bio, a déclaré : « C’est très excitant de partager les détails de notre technologie fondamentale avec la communauté scientifique au sens large, car nous pensons qu’elle a le potentiel de révolutionner la découverte de médicaments à base de petites molécules. Les idées puissantes décrites dans le Science document ne présentent qu’une première compréhension du potentiel ultime de cette technologie. Avec nos plateformes AMPS et de conception de médicaments basés sur la structure, nous avons superposé de puissantes analyses de données et d’IA pour augmenter considérablement l’application systématique et évolutive de cette technologie de criblage de métabolites protéiques afin d’identifier de nouveaux sites de liaison allostériques et de concevoir de nouveaux modulateurs de petites molécules hautement spécifiques. Nous pensons que notre approche nous permettra de faire progresser les thérapies transformatrices pour les patients dans un large éventail de maladies, à commencer par les médicaments de précision contre le cancer et les erreurs innées du métabolisme.
Dans le Science publication, les Drs. L’analyse de Rutter, Hicks et leurs collègues de 33 enzymes du métabolisme des glucides humains via MIDAS a identifié plus de 800 interactions protéine-métabolite, y compris des interactions connues ainsi que de nombreuses interactions jusque-là inconnues de diverses voies métaboliques. Les chercheurs ont ensuite validé fonctionnellement un sous-ensemble d’interactions, y compris l’inhibition spécifique à l’isoforme de la lactate déshydrogénase (LDH) par l’acyl-coenzyme A (CoA) à longue chaîne (LC), révélant une nouvelle régulation intervoies entre le métabolisme des acides gras et des glucides et pointant à de nouvelles façons d’identifier les inhibiteurs sélectifs d’isoformes pour la LDH. Ces découvertes sont un exemple des nombreuses interactions protéines-métabolites hautement conservées qui renforcent régulièrement l’homéostasie dans tout le corps, ce qui pourrait, à son tour, conduire à des approches thérapeutiques pour corriger la dérégulation liée à la maladie.
À propos d’Atavistik Bio
Atavistik Bio, située à Cambridge, MA, est à l’avant-garde d’une approche systématique et évolutive pour identifier et exploiter les interactions protéines-métabolites hautement conservées afin de révolutionner la découverte de médicaments à petites molécules. Combinées, nos plateformes AMPS et de conception de médicaments basés sur la structure exploitent l’analyse de données avancée et l’IA pour débloquer des sites de liaison allostériques fonctionnels et concevoir de nouveaux médicaments à petites molécules hautement spécifiques pour activer, inhiber ou stabiliser des cibles. Notre approche révolutionnaire a le potentiel de fournir des médicaments transformateurs aux patients dans un large éventail de maladies, avec un développement interne initial axé sur les médicaments de précision contre le cancer et les erreurs innées du métabolisme.
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Personne-ressource pour les médias :
Liz Melon
[email protected]
