Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur de préimpression, des chercheurs du Royaume-Uni ont évalué l’aérobiologie du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) dans les hôpitaux du Royaume-Uni (Royaume-Uni) et l’impact des procédures générant des aérosols (AGP).
Le SRAS-CoV-2 a été détecté dans l’air dans plusieurs établissements de santé impliqués dans la prise en charge des patients atteints de COVID-19 avec une transmission nosocomiale du SRAS-CoV-2 signalée parmi les travailleurs de la santé (TS) et les patients tout au long de la pandémie de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) . En conséquence, les AGP ont semblé risquées, et des mesures ont donc été appliquées pour limiter leurs applications dans les établissements de santé ; cependant, les facteurs qui facilitent la transmission nosocomiale du SRAS-CoV-2 n’ont pas été complètement compris.
Étude: L’aérobiologie du SRAS-CoV-2 dans les hôpitaux britanniques et l’impact des procédures générant des aérosols. Crédit d’image : Naeblys/Shutterstock
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont évalué la prévalence du SRAS-CoV-2 en aérosol dans les chambres des patients positifs au SRAS-CoV-2 nécessitant une supplémentation en AGP ou en oxygène par rapport à ceux à l’air ambiant.
Des échantillons d’air ont été prélevés de manière prospective dans les chambres de patients hospitalisés COVID-19 dans deux hôpitaux de soins tertiaires au Royaume-Uni entre novembre 2020 et octobre 2021, et les variantes du SRAS-CoV-2 dominantes au cours de cette période étaient les variantes Alpha et Delta. Les échantillons ont été divisés en trois catégories : (i) échantillons de pièce ; Patients COVID-19 ne subissant pas de thérapie respiratoire, (ii) oxygène ; les patients qui ont reçu une supplémentation en oxygène à des débits <15 L/min via un masque nasal/des canules, et (iii) l'AGP ; Patients COVID-19 subissant des procédures AGP.
Un échantillonneur d’air portable a été utilisé pour prélever des échantillons d’air à une distance minimale de 1,5 mètre des patients COVID-19 afin de s’assurer que les aérosols étaient capturés et de minimiser la collecte de grosses gouttelettes. Par la suite, l’ARN a été extrait des échantillons à l’aide d’une réaction quantitative en chaîne de polymérase-transcription révérée (RT-qPCR) et des expériences de culture cellulaire ont été réalisées à l’aide de cellules Vero E6. La modélisation linéaire généralisée binomiale (GLM) a été utilisée pour l’analyse.
De plus, des bases de données telles que Medline, Pubmed, Embase et Web of Science ont été consultées pour des études d’échantillonnage de l’air publiées entre janvier 2020 et novembre 2021. Les termes de recherche utilisés étaient “SARS-CoV-2”, “COVID-19″, ” qualité de l’air intérieur », « échantillonneur d’air », « aéroporté intérieur » et « bioaérosol », à la suite desquels 326 études ont été initialement obtenues ; cependant, après la sélection des résumés, seuls 37 articles de recherche en texte intégral ont été pris en compte pour l’examen.
Résultats
Au total, l’équipe a obtenu 219 échantillons des chambres des patients COVID-19, dont 67, 65 et 67 appartenaient respectivement au groupe d’air ambiant, au groupe de supplémentation en oxygène et au groupe de procédure AGP. L’ARN du SRAS-CoV-2 a été identifié dans 25 % (n = 54) des échantillons, dont la prévalence la plus importante dans les chambres des patients avec air ambiant, supplémentation en oxygène et procédures AGP était (22 %, n = 15), ( 32 %, n = 21) et (21 %, n = 18), respectivement.
La probabilité qu’un échantillon d’air soit positif pour le SRAS-CoV-2 n’a pas été affectée par les procédures, et il n’y avait aucune différence dans les valeurs de Ct (seuil de cycle) pour les échantillons de COVID-19 entre les procédures. Cependant, une réduction du gène SARS-CoV-2 spike (S), qui indiquait la présence d’Alpha, a été observée par rapport à d’autres cibles des cibles du génome du SARS-CoV-2 [nucleocapsid (N) gene and open reading frame 1 (ORF1) gene] dans l’analyse RT-qPCR.
Les valeurs moyennes de Ct obtenues pour les échantillons d’air ambiant, d’AGP et de supplémentation en oxygène étaient de 34, 32 et 33, respectivement, et les cultures observées pour chaque échantillon étaient négatives. Aucun effet n’a été observé dans les jours écoulés depuis l’apparition des symptômes et les valeurs Ct ou les fréquences de détection de l’ARN du SRAS-CoV-2. De plus, aucune corrélation n’a été observée entre les rapports de RT-qPCR et le lieu d’échantillonnage [e.g., critical care units or emergency departments (ED)].
Notamment, aucune différence significative n’a été observée dans les rapports positifs entre le groupe oxygène et le groupe air ambiant lors de l’échantillonnage dans des sites de ventilation régulière au lieu de sites de ventilation améliorée. [relative risk (RR) for the oxygen supplementation group and the room air patient group was 1.2 and 1.1, respectively]. De plus, l’ARN du SRAS-CoV-2 a été identifié dans cinq des 16 échantillons d’air supplémentaires prélevés sur des sites occupés ou utilisés par des patients atteints de COVID-19 [such as nursing stations and bathrooms] ou ceux adjacents à ces sites.
Pour les échantillons supplémentaires, des cultures négatives et une prolifération de champignons ont été observées parmi les échantillons de salle de bain. Deux échantillons prélevés dans les salles de bain et les postes de soins infirmiers étaient positifs pour l’ARN du SRAS-CoV-2. L’échantillon d’air restant positif pour l’ARN du SRAS-CoV-2 a été obtenu à partir d’une baie ITU (unité de thérapie intensive). Parmi les échantillons, cinq ont été prélevés dans des postes de soins infirmiers situés dans des zones rouges, un dans une zone adjacente à une zone rouge et deux dans des postes de soins infirmiers situés à plus de 3 mètres des chambres des patients positifs au SRAS-CoV-2.
Les valeurs Ct parmi les cinq échantillons variaient entre 22 (gène de pointe) dans un poste de soins infirmiers où les échantillons étaient positifs pour tous les gènes du SRAS-CoV-2 testés et 35 (pour un seul gène) parmi les échantillons positifs pour l’ARN du SRAS-CoV-2 obtenus à partir de postes de soins infirmiers et salles de bain partagées. De plus, l’échantillon positif pour l’ARN du SARS-CoV-2 obtenu à partir de la baie de l’ITU a montré une positivité du gène SARS-CoV-2 ORF1 et N.
Dans l’ensemble, les résultats de l’étude ont montré que l’ARN du SRAS-CoV-2 était présent dans l’air des chambres des patients hospitalisés COVID-19, qui n’était pas influencé par les AGP. Les résultats indiquent que le risque de transmission du SRAS-CoV-2 via les aérosols est probablement tout aussi important pour toutes les chambres incluses dans la prise en charge des patients COVID-19, et des mesures appropriées de prévention et de contrôle des infections doivent être recommandées.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
