Une étude cartographie le réseau de gènes orchestrant le processus complexe de glycosylation des IgG au cours du vieillissement

Un nouveau document de recherche a été publié dans Vieillissement (répertorié par MEDLINE/PubMed comme « Aging (Albany NY) » et « Aging-US » par Web of Science) Volume 15, numéro 24, intitulé « Cartographie du réseau de gènes qui régule l’horloge glycane du vieillissement ».

Les glycanes sont un composant structurel essentiel de l’immunoglobuline G (IgG) qui module sa structure et sa fonction. Cependant, les mécanismes de régulation à l’origine de cette modification post-traductionnelle complexe ne sont pas bien connus. Des études d’association pangénomiques antérieures (GWAS) ont identifié 29 régions génomiques impliquées dans la régulation de la glycosylation des IgG, mais seules quelques-unes ont été fonctionnellement validées. L’une des principales caractéristiques fonctionnelles de la glycosylation des IgG est l’ajout de galactose (galactosylation), un trait qui s’est avéré associé au vieillissement.

Dans cette nouvelle étude, les chercheurs Azra Frkatović-Hodžić, Anika Mijakovac, Karlo Miškec, Arina Nostaeva, Sodbo Z. Sharapov, Arianna Landini, Toomas Haller, Erik van den Akker, Sapna Sharma, Rafael RC Cuadrat, Massimo Mangino, Yong Li, Toma Keser, Najda Rudman, Tamara Štambuk, Maja Pučić-Baković, Irena Trbojević-Akmačić, Ivan Gudelj, Jerko Štambuk, Tea Pribić, Barbara Radovani, Petra Tominac, Krista Fischer, Marian Beekman, Manfred Wuhrer, Christian Gieger, Matthias B. Schulze, Clemens Wittenbecher, Ozren Polasek, Caroline Hayward, James F. Wilson, Tim D. Spector, Anna Köttgen, Frano Vučković, Yurii S. Aulchenko, Aleksandar Vojta, Jasminka Krištić, Lucija Klarić, Vlatka Zoldoš, et Gordan Lauc du Laboratoire de recherche Genos Glycoscience, Université de Zagreb, Université d’État de Novossibirsk, Université d’État Lomonossov de Moscou, Université d’Édimbourg, Université de Tartu, Centre médical de l’Université de Leiden, Université de technologie de Delft, Helmholtz Zentrum Muenchen, Centre allemand de recherche sur le diabète (DZD), King’s College de Londres, Guy’s and St Thomas’ Foundation Trust, Université de Fribourg, Université de Rijeka, Institut allemand de nutrition humaine Potsdam-Rehbruecke, Université de Potsdam, Harvard TH Chan School of Public Health, Chalmers University of Technology, University of Split School de médecine, Algebra University College, Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health et Institute of Cytology and Genetics SB RAS a réalisé une GWAS de galactosylation des IgG (N = 13 705) et a identifié 16 loci significativement associés, indiquant que la galactosylation des IgG est régulée par un réseau complexe. de gènes qui s’étendent au-delà de l’enzyme galactosyltransférase qui ajoute du galactose aux glycanes IgG.

“Ici, nous avons mené une GWAS des phénotypes de galactosylation des IgG dans une étude qui double presque la taille de l’échantillon (N = 13 705) par rapport à la précédente GWAS des IgG N-glycome. [33] et s’est concentré sur les gènes avec in silico preuve de l’implication dans le processus de galactosylation des IgG.

La priorisation des gènes a identifié 37 gènes candidats. À l’aide d’un système CRISPR/dCas9 récemment développé, les chercheurs ont manipulé l’expression des gènes candidats dans le in vitro Système d’expression des IgG. La régulation positive de trois gènes, EEF1A1, MANBA et TNFRSF13B, a modifié la composition du glycome IgG, ce qui a confirmé que ces trois gènes sont impliqués dans la galactosylation des IgG dans ce cas. in vitro système d’expression.

“Des recherches supplémentaires sont nécessaires pour élucider pleinement [the] mécanisme fonctionnel derrière leur rôle dans le vieillissement et pour révéler le réseau complet d’interactions génétiques régulant le processus complexe de glycosylation des IgG.