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Saisonnalité de l’infection par le virus respiratoire syncytial chez les enfants hospitalisés pour des infections aiguës des voies respiratoires inférieures dans le Hunan, Chine, 2013-2022 | Journal de virologie

Saisonnalité de l’infection par le virus respiratoire syncytial chez les enfants hospitalisés pour des infections aiguës des voies respiratoires inférieures dans le Hunan, Chine, 2013-2022 |  Journal de virologie

Caractéristiques des patients

Entre le 1er juillet 2013 et le 30 juin 2022, 49 658 enfants hospitalisés diagnostiqués avec une ALRTI ont été inclus dans l’étude (Fig. 1). Parmi eux, 30 413 étaient des hommes (61,2 %) et 19 245 étaient des femmes (38,8 %), avec un ratio hommes/femmes d’environ 1,6 : 1. La tranche d’âge des enfants était de 1 à 168 mois, avec un âge médian de 16 mois (écart interquartile [IQR]: 6-38 mois). Les enfants âgés de < 5 ans constituaient 90,2 % de l'échantillon de l'étude. La durée médiane du séjour à l'hôpital était de 6 jours (IQR : 5 à 8 jours) et le coût médian de l'hospitalisation était de 961 dollars (IQR : 770 à 1 318 dollars). Une baisse significative du nombre de patients ALRTI hospitalisés s'est produite après l'épidémie du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) en Chine en février 2020, couplée à la mise en œuvre d'interventions non pharmaceutiques (NPI). En février, mars et avril 2020, il y a eu 52, 56 et 39 hospitalisations liées à l’ALRTI, contre 659, 744 et 660 cas au cours des mois correspondants en 2019, respectivement. Cela représente une diminution de 92,1%, 92,4% et 94,1% respectivement. Au cours des années 2019-2020, 2020-2021 et 2021-2022, le nombre d’hospitalisations pour une ILART a diminué de manière significative (P < 0,01) par rapport à 2018-2019, avec des réductions de 36 %, 39 % et 43 %, respectivement (Tableau 1). .

Fig. 1

Organigramme pour le recrutement des patients pédiatriques hospitalisés ALRTI pour la détection du VRS dans l’étude du 1er juillet 2013 au 30 juin 2022. # : immunodéprimé était défini comme ayant reçu une greffe d’organe solide ou de cellules souches hématopoïétiques, subissant une chimiothérapie, ayant des antécédents de virus de l’immunodéficience humaine ou utilisant des stéroïdes pendant > 30 jours. Abréviation : ALRTI, infection aiguë des voies respiratoires inférieures ; VRS, virus respiratoire syncytial

Tableau 1 Caractéristiques démographiques des enfants hospitalisés atteints de pneumonie, Hunan, Chine, 1er juillet 2013-30 juin 2022

Caractéristiques cliniques et épidémiologiques des cas positifs au RSV

Le taux de positifs à l’antigène RSV était de 15,2 % (n = 7 566/49 658), avec 4 805 cas chez les garçons et 2 761 chez les filles. L’âge médian des patients positifs au RSV était de 9 mois (IQR : 4 à 20 mois), avec 33,8 % (n = 2 556/7 566) des patients âgés de < 6 mois, et le taux de patients positifs au RSV diminuait progressivement avec l'âge. Parmi les patients RSV-positifs, 16,3 % (n = 1 236/7 566) présentaient une maladie ou une affection concomitante à leur admission. Les affections les plus courantes étaient la prématurité (n = 523/7 566 ; 6,9 %), les cardiopathies congénitales (n = 356/7 566 ; 4,7 %), l'asthme (n = 220/7 566 ; 2,9 %), l'anémie (n = 97/7 566). ; 1,3 %), les maladies pulmonaires chroniques (n = 28/7 566 ; < 1 %) et la malnutrition (n = 12/7 566 ; < 1 %) (Tableau 2). Le taux de positivité au RSV a également diminué de manière significative après l'épidémie de SRAS-CoV-2 en Chine en février 2020. En février, mars et avril 2020, il y a eu 12, 3 et 0 cas positifs au RSV, contre 221 145, et 38 cas, en 2019, respectivement, marquant des diminutions de 94,6 %, 97,9 % et 100 %, respectivement (Tableau 2 ; Figs. 2 et 3). L'épidémiologie de l'autre infection virale chez les patients inscrits était présente dans le tableau supplémentaire 1. D'autres co-infections virales par le RSV étaient présentes dans le tableau supplémentaire 2.

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Tableau 2 Caractéristiques démographiques des enfants positifs au VRS hospitalisés pour une infection aiguë des voies respiratoires inférieures dans le Hunan, en Chine, du 1er juillet 2013 au 30 juin 2022Fig. 2

Cas d’ALRTI chez des enfants hospitalisés âgés de 28 jours à 13 ans, par mois, Hunan, Chine, 1er juillet 2013 – 30 juin 2022. La ligne pointillée verticale grise marquait la séparation de deux années d’étude. Les graphiques linéaires indiquaient le taux de positivité du RSV par année. La ligne verticale continue rouge, comme ligne de démarcation, marquant la plus haute réponse d’urgence au COVID-19, a été lancée au Hunan. Abréviation : ALRTI, infection aiguë des voies respiratoires inférieures ; RSV, virus respiratoire syncytial ; NPI, interventions non pharmaceutiques

Figure 3

Distribution mensuelle des échantillons positifs au RSV chez les enfants atteints d’ALRTI dans le Hunan du 1er juillet 2013 au 30 juin 2022. Le nombre d’échantillons positifs au RSV est indiqué dans le diagramme en colonnes grises et les taux positifs de RSV sont indiqués en noir. graphique linéaire. Abréviation : ALRTI, infection aiguë des voies respiratoires inférieures ; VRS, virus respiratoire syncytial

L’incidence annuelle du VRS de 2013 à 2014 à 2021-2022 était de 15,8 % (n = 839/5 304), 12,5 % (n = 797/6 366), 11,3 % (n = 656/5 786), 12,3 % (n = 811). /6 617), 14,9 % (n = 831/5 595), 15,8 % (n = 1 121/7 104), 13,1 % (n = 596/4 561), 24,6 % (n = 1 060/4 305) et 21,3 % (n = 855/4 020), respectivement. Le taux le plus élevé s’est produit en 2020-2021, suivi de 2021-2022 (Fig. 2).

Le RSV peut être détecté tout au long de l’année. Au cours de la période d’étude, le taux de détection global était le plus élevé en hiver (26,7 %) et le plus faible en été (6,5 %). Des variations saisonnières étaient évidentes au cours des différentes années. Au cours des années 2016-2017, 2017-2018 et 2018-2019, le VRS a été détecté le plus fréquemment en hiver, suivi de l’automne, et le taux de détection était le plus faible en été. En février 2020, au début de la pandémie de COVID-19, le taux de détection du VRS a soudainement chuté. Seuls quatre cas ont été détectés au printemps 2020, soit le nombre le plus faible de ces dernières années (taux de positivité au RSV de 1,8 %). À partir de l’été 2020, le taux de détection du VRS est resté constamment élevé, atteignant un pic sans précédent à l’été 2021 qui a persisté jusqu’à la fin du printemps 2022 (Fig. 4).

L’âge des cas positifs au RSV (P = 0,025), la répartition par âge, la durée moyenne des séjours à l’hôpital, le taux d’admission en USIP, la proportion de cas de pneumonie grave et les frais d’hospitalisation présentaient des différences significatives entre les années d’étude (Tableau 2). Le pourcentage d’enfants nécessitant une PCIU et les cas de pneumonie grave présentent une tendance à la réduction pendant la pandémie. Il est intéressant de noter que la répartition par âge des enfants positifs au RSV différait entre 2020 et 2021 et 2021-2022, avec un nombre significativement plus élevé de cas positifs dans la tranche d’âge de 24 à 59 mois par rapport à la tranche d’âge < 6 mois. L’âge médian des enfants infectés était respectivement de 14 et 15 mois pour les périodes 2020-2021 et 2021-2022, l’âge médian étant nettement inférieur de 2013 à 2014 à 2019-2020.

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Figure 4

Répartition saisonnière des échantillons positifs au RSV chez les enfants atteints d’ALRTI dans le Hunan du 1er juillet 2013 au 30 juin 2022. Abréviation : RSV, virus respiratoire syncytial

Figure 5

Calendrier des saisons épidémiques de RSV (bleu foncé) par semaine civile de 2013 à 2022 dans le Hunan, en Chine. La semaine de pointe est colorée en rouge. Les semaines de début et de décalage des saisons du RSV selon différentes méthodes de calcul. La saison épidémique du VRS a été définie comme les semaines consécutives au cours desquelles le pourcentage de tests positifs spécifiques au VRS par semaine dépassait un seuil de 10 %. Abréviation : RSV, virus respiratoire syncytial

Tendances des infections par le VRS

L’année de surveillance a été déterminée en fonction du creux du cycle du RSV. Entre 2013 et 2022, l’année de surveillance a débuté le 1er juillet (27e semaine d’épidémiologie) et s’est terminée le 30 juin (26e semaine) de l’année suivante. À l’aide de notre modèle, nous avons identifié neuf saisons distinctes du VRS au cours de la période d’étude. La valeur R2 de notre modèle d’ajustement de courbe, utilisant les données RSV, dépassait 0,95. Cela indique l’efficacité du modèle cosinus pour prédire et évaluer les caractéristiques saisonnières du RSV dans le Hunan. Sur la base d’un seuil de 10 % et de la courbe saisonnière ajustée, nous avons analysé différents paramètres pour chacune des 9 années : le début de la saison du VRS (les 2 premières semaines consécutives avec un taux positif au VRS > 10 %), le durée de la saison, la semaine de pointe, la fin de la saison et la proportion de cas positifs au RSV (Fig. 5 et 6).

La figure 5 présente les semaines des foyers épidémiques d’infection par le RSV détectés par saison. Au cours des années 2013-2014, 2014-2015 et 2015-2016, la saison du VRS a débuté à la fin de l’automne et a duré 24 à 25 semaines, pour se terminer à la fin du printemps de l’année suivante. En revanche, le début de la saison du VRS en 2016-2017 et 2017-2018 s’est produit 11 à 15 semaines plus tôt, commençant entre la fin de l’été et le début de l’automne et durant 32 à 34 semaines, se terminant à la fin du printemps suivant. Les foyers épidémiques des saisons 2018-2019 ont été observés entre la semaine 45 de 2018 et la semaine 12 de 2019 (du 4 novembre au 23 mars). Les épidémies de VRS au cours des 6 années de surveillance précédant la pandémie de COVID-19 (2013-2019) ont généralement commencé en octobre (semaine 44), ont culminé en décembre (semaine 53) et ont duré une durée médiane de 27 semaines avant de se terminer en avril (semaine 17). . Environ 81,7 % des cas positifs au VRS sont survenus pendant la saison officielle du VRS. La figure 6 démontre que la courbe d’ajustement était généralement cohérente avec la tendance réelle des cas de VRS.

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Cependant, les semaines de cluster au cours des saisons 2019-2020 ont été de courte durée. Sur la base du seuil épidémique de 10 %, aucune épidémie saisonnière de VRS n’a été observée au printemps 2020 en raison de la pandémie de COVID-19 et des NPI associés. En revanche, l’épidémie de 2020-21 a commencé 12 semaines plus tôt (le 4 août), a culminé en février (2021) et janvier (2022) et a duré 87 semaines avant de se terminer en mars 2022. Le pourcentage maximal de résultats positifs au RSV était plus élevé. que pendant les saisons pré-pandémiques (Fig. 3, 5 et 6). La pandémie de COVID-19 a influencé de manière significative la saison du VRS dans le Hunan, avec une brève baisse de l’incidence au printemps 2020, suivie d’une reprise rapide à l’été de la même année.

Figure 6

Les prévisions de l’effet de l’année sur le nombre de semaines du pourcentage moyen de tests d’antigène du virus respiratoire positifs pour le VRS par semaine en 2013-2022, telles qu’obtenues à partir du modèle de régression des moindres carrés ordinaires non linéaires. Le graphique commence à la semaine civile 27. Le début et le décalage de la saison sont indiqués par les 2 lignes verticales orange. Le modèle de régression des moindres carrés ordinaires non linéaire a indiqué que l’effet de l’année sur les semaines de foyers épidémiques était statistiquement significatif (valeur P < 0,001, Fig. 6). Ainsi, la saison épidémique a changé. L'activité du RSV en 2020-2021, résurgence au cours de l'été et de l'automne, a commencé plus tôt de 12 semaines par rapport aux prévisions de l'année, a culminé plus tard (la 7 semaine) et a duré plus longtemps. L'activité du VRS en 2021-2022, qui a commencé 18 semaines plus tôt que les prévisions de l'année, a culminé et s'est compensée dans la plage prévue

2024-03-07 22:41:32
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