Les recherches de la SFU suggèrent que comprendre l’évolution des souches grippales facilitera le développement futur de vaccins.

Newswise — Des chercheurs de l’Université Simon Fraser étudiant l’histoire évolutive des virus de la grippe ont découvert qu’une nouvelle analyse quantitative de leur évolution pourrait aider à prédire les futures souches. La recherche s’appuie sur un domaine connu sous le nom de phylogénétique, qui se concentre sur la façon dont les groupes d’organismes sont liés au cours de l’évolution, et est publiée dans la revue Avancées scientifiques.

Les chercheurs ont utilisé de grands « arbres » phylogénétiques pour prédire quelles souches sont les plus susceptibles de se développer au cours de la prochaine saison grippale, et ont déterminé que cette approche était modérément efficace pour détecter les futures souches du virus de la grippe et pourrait constituer un autre outil dans la boîte à outils pour guider les changements saisonniers. développement d’un vaccin contre la grippe.

« La pandémie de COVID-19 a provoqué un changement important dans la dynamique de transmission de la grippe », explique Caroline Colijn, professeure de mathématiques et titulaire de la Chaire de recherche du Canada. « Nous avons exploré comment l’apprentissage automatique peut identifier les séquences du virus de la grippe qui sont potentiellement de bons candidats à inclure dans les vaccins contre la grippe saisonnière. »

Pour que la vaccination réussisse, les virus spécifiques inclus dans les vaccins contre la grippe saisonnière doivent être similaires à ceux de la grippe qui circuleront au cours de la saison à venir, explique Colijn. L’efficacité des vaccins contre la grippe saisonnière varie (par exemple, allant de 25 à 75 pour cent chez les enfants) et dépend de la question de savoir si les souches qui circulent correspondent à celles projetées et incluses dans le vaccin.

Les chercheurs ont étudié les arbres phylogénétiques, essentiellement l’arbre généalogique du virus de la grippe, avec les informations de l’Initiative mondiale sur le partage des données sur la grippe aviaire (GISAID). Après avoir créé des phylogénies à l’aide de plus de 65 000 séquences d’ARN provenant des protéines de surface de la grippe, collectées entre 1970 et 2020, ils ont utilisé les caractéristiques de ces arbres pour identifier les souches susceptibles d’augmenter en nombre au cours de la saison à venir.

Le vaccin contre la grippe saisonnière est conçu pour protéger contre les virus grippaux courants, notamment H3N2, H1N1 et B. Leur étude s’est concentrée spécifiquement sur le sous-type H3N2 du virus grippal.

« Nous avons pu identifier des souches candidates similaires à celles proposées par l’Organisation mondiale de la santé, ce qui suggère que cette approche d’apprentissage automatique peut aider à éclairer la sélection des souches vaccinales », explique Colijn.