Effets différentiels des variants du SRAS-CoV-2 sur les enfants et les adolescents

La pandémie actuelle de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), causée par le syndrome respiratoire aigu sévère coronavirus-2 (SRAS-CoV-2), a massivement affecté le secteur mondial de la santé et l’économie. Bien que les adultes soient principalement touchés par le virus, plusieurs cas d’infection grave par le SRAS-CoV-2 chez des patients pédiatriques ont été signalés.

Étude: Différences dans les manifestations cliniques du SRAS-CoV-2 et la gravité de la maladie chez les enfants et les adolescents par la variante infectante. Crédit d’image : Morrowind/Shutterstock

Arrière plan

Un large éventail de symptômes cliniques, tels qu’une détresse asymptomatique et légère des voies respiratoires supérieures, une pneumonie et un syndrome inflammatoire multisystémique plus sévère chez les enfants (MIS-C), ont été signalés chez des enfants infectés par le SRAS-CoV-2. De plus, il a été observé que le MIS-C survenait principalement 2 à 6 semaines après une infection aiguë par le SRAS-CoV-2.

Depuis le début de la pandémie, l’évolution du SRAS-CoV-2 s’est produite en raison de mutations génomiques, qui ont conduit à l’émergence de nombreuses variantes. Ces variants ont été classés en variants d’intérêt (VOI) et variants préoccupants (VOC) en fonction de leur virulence, de leur capacité à échapper aux réponses immunitaires et de leur transmissibilité par rapport à la souche ancestrale.

Aux États-Unis, la variante SARS-CoV-2 Alpha a d’abord remplacé la souche ancestrale, qui a finalement été remplacée par la variante Delta. Puis, vers septembre 2021, la souche Delta a été remplacée par la variante Omicron, qui est devenue la souche SARS-CoV-2 à circulation dominante.

Les variantes Alpha, Delta et Omicron ont montré une transmissibilité nettement plus élevée et ont affecté de manière disproportionnée les individus non vaccinés et les groupes vulnérables, tels que les enfants. Ces variantes ont augmenté de manière significative l’hospitalisation pédiatrique de 5 à 10 fois, selon la variante et l’âge de l’enfant. Il y a un manque de données sur l’impact des variants spécifiques du SRAS-CoV-2 sur la gravité clinique de la maladie chez les adolescents et les enfants atteints de COVID-19.

Une récente Maladies infectieuses émergentes Une étude de journal a évalué si des variants spécifiques du SRAS-CoV-2 étaient liés à différentes manifestations cliniques chez les enfants et les adolescents.

À propos de l’étude

Des échantillons nasopharyngés (NP) ont été prélevés sur des enfants et des adolescents testés positifs entre le 1er janvier 2021 et le 15 janvier 2022, via des tests d’amplification des acides nucléiques (TAAN).

Tous les échantillons positifs au SARS-CoV-2 ont été conservés à -20°C ; cependant, ceux-ci ont été analysés dans la semaine suivant le stockage en fonction de la capacité de test du laboratoire clinique, des valeurs de seuil de cycle (Ct) et des volumes d’échantillons. Cette étude a utilisé les valeurs Ct comme approximation pour la quantification de la charge virale. La valeur Ct est inversement proportionnelle à la charge virale quantitative.

Les échantillons ont été analysés pour détecter la présence de mutations caractérisant Alpha, Beta, Gamma, Omicron et d’autres variantes. De plus, les auteurs ont développé un test T487K pour détecter la variante Delta.

Les caractéristiques démographiques, les comorbidités, le type de variant infectant et les valeurs SARS-CoV-2 Ct des patients hospitalisés et ambulatoires sélectionnés ont été obtenus. Les participants ont été regroupés en fonction de leurs conditions médicales sous-jacentes, notamment l’obésité/insuffisance pondérale, les troubles génétiques, gastro-intestinaux, rénaux, endocriniens, neurologiques immunodéprimés et les maladies hématologiques.

Résultats de l’étude

Au cours de la période d’étude, sur les 169 908 échantillons testés pour l’infection par le SRAS-CoV-2 chez les enfants et les adolescents, 9,02 % ont été testés positifs par un test NAAT testé positif. Des fluctuations dans les cas mensuels de COVID-19 ont été observées tout au long de la période d’étude.

Changements dans les variantes circulantes du SRAS-CoV-2 identifiées au Nationwide Children’s Hospital, Columbus, Ohio, États-Unis, en pourcentage du nombre total de cas, quel que soit l’âge du patient, janvier 2021-janvier 2022. La catégorie des autres comprend Beta (n = 12), Iota (n = 9), Zeta (n = 7), Eta (n = 2), Epsilon (n = 3) et Mu (n = 2), ainsi que les variantes à l’étude (n = 2). La ligne pointillée noire représente le taux de tests positifs par mois.

Le dépistage des variantes a révélé la présence de douze variantes du SRAS-CoV-2, qui comprenaient une souche non variante (11,34 %), Alpha (11,81 %), Delta (62,77 %) et Omicron (10,49 %). De plus, d’autres souches de SARS-CoV-2, telles que Beta, Zeta, Gamma, Mu, Epsilon et Eta, ont également été détectées. Cette découverte a également révélé que l’infection Delta était plus fréquente chez les patients hospitalisés et les patients externes. De même, les variantes d’infection Alpha et Omicron ont été principalement trouvées chez les patients ambulatoires et les patients hospitalisés.

L’âge médian des patients hospitalisés était de 6,6 ans et celui des patients externes de 9,4 ans. Fait intéressant, les deux contextes ont révélé que l’infection par le SRAS-CoV-2 était plus répandue dans le groupe des adolescents (12 à 21 ans) que chez les enfants plus jeunes. Néanmoins, les nourrissons étaient le deuxième groupe le plus courant avec COVID-19. Le taux de vaccination contre la COVID-19 était faible et ne différait pas entre les patients hospitalisés et les patients externes.

L’obésité/surpoids était la comorbidité sous-jacente la plus fréquente de la cohorte de l’étude. Des co-infections SRAS-CoV-2/virales ont été signalées chez 19,82 % de la cohorte de l’étude. Le virus le plus couramment co-infecté par la COVID-19 était le rhinovirus/entérovirus (RV/EV), suivi du virus respiratoire syncytial (VRS), du métapneumovirus humain, du coronavirus endémique, des virus parainfluenza, de l’adénovirus et des virus de la grippe. Fait important, une co-infection a été trouvée chez des enfants infectés par les variantes Delta et Omicron. La co-infection a également amélioré l’admission à l’hôpital.

Les enfants infectés par la variante Delta ont montré des valeurs de Ct plus faibles. Contrairement aux résultats documentés dans les études existantes, L’admission en unité de soins intensifs pédiatriques (USIP) était similaire entre les enfants infectés par Omicron et d’autres variantes.

Limites de l’étude

Une limitation clé de l’étude était que tous les échantillons testés positifs pour le SRAS-CoV-2 par TAAN n’ont pas été soumis à un dépistage de variantes. Le pourcentage de dépistage des échantillons pour l’identification des variantes était basé sur les volumes d’échantillons et la disponibilité de personnel qualifié au laboratoire clonal. Par conséquent, pendant les mois de cas élevés de SRAS-CoV-2, un plus petit nombre d’échantillons ont subi des tests de variantes. Une autre limite était la nature rétrospective de la collecte de données, qui a influencé les résultats de la cohorte de patients externes.