Construire une “bibliothèque de vaccins” pour prévenir l’avenir

Les bouleversements sociaux tels que la mondialisation, l’urbanisation et le changement climatique favorisent et augmentent la probabilité et la fréquence des épidémies virales qui pourraient conduire à de nouvelles pandémies. Avec l’épidémie et la propagation du virus SARS-CoV-2, le monde a connu l’impact existentiel et durable que la mutation virale peut avoir. Pour être mieux préparé à une future pandémie, le CEPI investit dans un projet de recherche visant à développer de nouvelles conceptions d’antigènes à l’Institut de découverte de médicaments de la Faculté de médecine. L’équipe, dirigée par le directeur et professeur Humboldt Jens Meiler, se concentre sur dix familles de virus connues pour construire la «bibliothèque de vaccins» et utilise la plate-forme informatique Rosetta pour ses recherches. « Rosetta est un système logiciel dynamique et évolutif qui traite de la prédiction et de la conception de structures biomoléculaires. Nous utilisons Rosetta pour concevoir des composés qui n’existent pas dans la nature. C’est très créatif », explique le professeur Meiler, qui poursuit : « Nous construisons une bibliothèque de vaccins dans laquelle les développeurs cliniques pourront ensuite puiser.

Pour le parrain CEPI, une approche égalitaire est un préalable à ce projet : les partenaires et les développeurs apportent leurs connaissances dans une « bibliothèque de vaccins » et peuvent prendre les connaissances d’une autre. « Dans ce projet de recherche, nous apprenons essentiellement ce que nous pouvons améliorer dans la conception des vaccins afin de développer des vaccins mieux et, surtout, plus rapidement à l’avenir. Pour ce faire, nous utilisons la conception assistée par ordinateur, y compris l’apprentissage automatique, pour optimiser la conception des protéines. Cela signifie que nous nous entraînons avec le programme et apprenons ce que nous pouvons déjà bien concevoir et où nous devons encore adapter nos programmes », explique le chef de projet, le Dr Clara T. Schoeder, qui occupera une chaire de professeur junior dans le développement de l’immunothérapie à l’Université de Leipzig. Faculté de médecine le 1er juillet 2023.

Le projet de recherche devrait durer cinq ans. Un groupe de travail du Houston Methodist Hospital au Texas est également partenaire du projet et est en contact avec le groupe de recherche du Dr Schoeder. Les résultats préliminaires sont attendus fin 2023 ou début 2024. Dans une interview approfondie, le Dr Schoeder parle de ses recherches et de l’impact de l’intelligence artificielle sur le développement de vaccins.

En outre, le professeur Meiler et le Dr Schoeder sont récemment devenus membres de ScaDS.AI, le Center for Scalable Data Analysis and Artificial Intelligence, qui est un centre de recherche pour la science des données, l’intelligence artificielle et le big data avec des sites à Leipzig et à Dresde.

Commanditaire CEPI est un partenariat mondial innovant qui travaille à accélérer le développement de vaccins contre les menaces épidémiques et pandémiques.

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