Wiro Niessen est professeur d’analyse d’images biomédicales à Erasmus MC et TU Delft, entrepreneur et directeur technique à Health-RI. Son travail en tant que CTO chez Health-RI est né d’une motivation personnelle et d’une nécessité qu’il voit se refléter dans son travail. “L’organisation d’une infrastructure de données de santé peut conduire à des recherches de haut niveau, mais c’est plus difficile à expliquer que du matériel brillant ou un accélérateur de particules.”
Wiro Niessen est professeur d’analyse d’images biomédicales à Erasmus MC, Rotterdam, où il dirige le groupe d’imagerie biomédicale de Rotterdam (BIMG) et à l’Université de technologie de Delft. Il a commencé sa recherche doctorale en analyse d’images biomédicales et en apprentissage automatique.
Il est également co-fondateur de Société d’IA Quantib, qui est à l’origine une spin-off du groupe d’imagerie biomédicale de Rotterdam et fabrique des applications logicielles intelligentes artificielles qui analysent des images médicales pour soutenir le diagnostic des troubles neurodégénératifs et du cancer de la prostate. La société a été acquise au début de cette année par le Le fournisseur de soins de santé américain Radnet.
Accès aux données
Depuis début 2020, il est impliqué en tant que membre du conseil d’administration et directeur technique de Santé-IRune initiative publique-privée qui développe une infrastructure nationale de santé pour stocker, combiner, réutiliser et – tout en garantissant la confidentialité et le contrôle des patients et des chercheurs – rendre les données médicales accessibles pour la recherche et l’innovation.
“Ma participation à Health-RI est en fait venue d’une nécessité que je voyais dans mon travail”, explique Niessen. “J’ai d’abord fait mes propres recherches, puis supervisé des chercheurs et créé une société d’IA pour apporter des connaissances scientifiques et des algorithmes aux patients. . Dans tout ce travail, l’accès aux données est une condition préalable cruciale.
une infrastructure nationale de données pour trouver, rendre accessible, combiner et réutiliser les données de santé
Depuis le groupe d’imagerie biomédicale de Rotterdam, qu’il dirige, Niessen a vu dans la pratique le besoin d’une infrastructure de données partagée pour la recherche et l’innovation. Les Pays-Bas disposent de grandes quantités de données de santé de haute qualité, mais ne disposent pas d’une infrastructure de données unique pour trouver, rendre accessibles, combiner et réutiliser ces données pour les professionnels de la santé, les décideurs, les chercheurs et les entreprises. « Si les chercheurs de mon groupe de recherche veulent pouvoir travailler au mieux, l’accès aux données est indispensable. Health-RI s’attaquera systématiquement à l’accès et à la réutilisation des données. »
« La vision de Health-RI est une infrastructure de données nationale pour trouver, rendre accessible, combiner et réutiliser ces données. Cette vision existe depuis un certain temps, mais a pris de l’ampleur avec l’attribution de la candidature au Fonds de croissance en 2021 », déclare Niessen. Avec le Fonds national de croissance, le gouvernement investira 20 milliards d’euros au cours des sept prochaines années dans des projets qui garantissent une croissance économique à long terme. subvention de 69 millions d’euros décerné est Santé-RI.
facteurs mous
Selon le scientifique, il est difficile de libérer de l’argent dans les pays de recherche pour rendre les données trouvables, accessibles, interopérables et réutilisables. « Il est encore trop souvent perçu comme mou, tendre les facteurs liés aux processus tels que le contrôle, les cadres juridiques et l’harmonisation. Ou c’est vu comme un problème technique. Et cela alors que la réutilisation des données est indispensable et demande beaucoup d’efforts.”
« L’organisation d’une infrastructure de données de santé peut conduire à des recherches de haut niveau, mais c’est plus difficile à expliquer que du matériel brillant ou un accélérateur de particules. Mais l’importance d’une infrastructure de données nationale unique est très claire et la crise de Covid-19 a de nouveau souligné cette importance”, a déclaré Niessen. “Pendant la pandémie de Covid-19, nous avons soudainement vu concrètement ce que signifie bien apprendre des données, au bénéfice de la santé des citoyens et des patients.”
Coordination nationale sur un paysage de données complexe
Qu’est-ce qui a attiré Niessen au poste de directeur de la technologie de Health-RI ? « Health-RI a été fondée pour faciliter la réutilisation des données pour la recherche et l’innovation et ainsi améliorer notre santé publique. Les données provenant du processus de soins habituels, de la recherche ou des données recueillies par les patients eux-mêmes sont très importantes à cet égard. Coordination nationale à ce sujet paysage de données complexe est une condition préalable à la réutilisation des données.
« Il est essentiel pour les entreprises, les start-up et les chercheurs que les données de santé puissent être trouvées, consultées, combinées et réutilisées, selon les principes FAIR et tout en garantissant la confidentialité des patients. Rendre les données réutilisables est plus facile si les données sont collectées, enregistrées et stockées correctement dans le processus primaire – c’est-à-dire chez un prestataire de soins en médecine générale, à l’hôpital ou chez le patient via un environnement de santé personnel.
« Health-RI n’est pas un dossier patient électronique, un PBL ou un système d’information sur les médecins généralistes. Health-RI sera le portail national de la réutilisation des données de santé, également appelée utilisation secondaire des données de santé. En collaboration avec les parties prenantes et les parties impliquées, nous élaborons une carte et des accords nationaux : c’est de cela qu’il s’agit et c’est de cela que parlent les autres”, a déclaré Niessen, qui s’est exprimé lors de la conférence annuelle Congrès Santé-IR le 6 octobre parle de la feuille de route et des plans futurs.
Jalons
Niessen est positif à propos du processus de suppression des obstacles élaboré par Health-RI, les ministères et d’autres parties, un processus dans lequel les barrières et les obstacles à la réutilisation des données ont été identifiés et supprimés dans les années à venir, en collaboration avec les parties prenantes impliquées. “Chaque obstacle qui est structurellement supprimé est une étape importante et apporte la recherche et l’innovation, en si meilleurs soins pour les citoyens dans les patients aux Pays-Bas, plus loin.
Il mentionne deux exemples concrets d’activités d’IR-Santé qui contribuent à une meilleure santé et à davantage de connaissances scientifiques. «Au nom de ZonMw et en collaboration avec la NFU, les meilleurs hôpitaux cliniques et hôpitaux régionaux collaborateurs, nous avons Portail de données COVID-19 développé. Cette infrastructure pour trouver et réutiliser les données d’observation liées à Covid-19 était indispensable pour de nouvelles connaissances scientifiques sur Covid-19.
“Le portail de données avec des données d’observation liées au Covid-19 était indispensable pour de nouvelles connaissances scientifiques sur le Covid-19”
« La recherche médicale sur le coronavirus bénéficie de beaucoup d’informations et de données. De nombreuses informations étaient disponibles au sein des hôpitaux sur les facteurs de risque, les médicaments et les traitements et l’évolution de la maladie, mais un portail national néerlandais unique de données de santé – via lequel les médecins et les chercheurs peuvent accéder aux données dans le respect des conditions légales et de la confidentialité des données les données des patients – manquaient toujours. Le fait que les données de sept centres médicaux universitaires soient maintenant harmonisées, ce qui facilite la recherche de données sur les patients, est également une étape importante dont nous, en tant que Health-RI, sommes fiers.
Apprentissage fédéré
En tant que professeur d’analyse d’images biomédicales et expert en IA, Niessen est également enthousiasmé par les possibilités d’analyse et d’apprentissage fédérés, ou apprentissage fédéré, des offres. Un modèle de données fédérées, qui fait également partie de l’infrastructure Health-RI, se compose de métadonnées qui décrivent le contenu des collections de données, le type de données et la politique d’accès à ces données. Ces métadonnées sont accessibles au public dans le portail, tandis que les données sous-jacentes restent à la source, et l’analyse peut être effectuée par un logiciel méchant pour envoyer les données.
Niessen espère que le concept d’apprentissage fédéré pourra être testé sur le terrain et mis en œuvre dans un proche avenir dans le cadre de l’infrastructure Health-RI. « J’espère que d’ici deux ans nous aurons un preuve de concept différentes régions des Pays-Bas mettent à disposition des algorithmes des données cliniques, des images médicales et d’autres ensembles de données via un modèle de données fédéré. Alors un Algorithmes d’IA formés et optimisés sur ces différents ensembles de données et dans plusieurs hôpitaux. Ce faisant, nous montrons non seulement le cas d’utilisation de l’apprentissage fédéré et accélérons les applications d’IA, mais nous espérons également montrer que cette technologie est évolutive et donc utilisable pour de nombreuses applications.
Changement culturel
Avec une infrastructure de données de santé intégrée, les Pays-Bas peuvent utiliser de manière optimale les données médicales, les échantillons et les connaissances pour de meilleurs soins et de nouvelles solutions de diagnostic, de traitement et de prévention. « En tant que scientifique et fondateur de Quantib, j’ai toujours été impressionné de voir à quel point vous obtenez davantage de données lorsque vous ouvrez des ensembles de données à des tiers. Précisément en partageant des ensembles de données avec la communauté scientifique et collaboration avec les entreprises de nouvelles perspectives émergent », déclare Niessen.
« Santé-IR contribue au changement de culture et science ouverte mouvement qui a émergé ces dernières années. Dans le domaine de la santé, un monopole sur les données, tel que nous le connaissons des entreprises de technologie et de médias sociaux, n’est pas souhaitable. En plus d’être en partie une propriété personnelle, nos données de santé sont également une propriété publique et doivent donc être disponibles de manière transparente et ouverte pour les soins, les politiques, la recherche et l’innovation.
« Il sera plus facile pour les chercheurs, les startups et les entreprises de demander des données et d’y accéder, dans les bonnes conditions. “Précisément en construisant une infrastructure nationale de données en tant qu’installation publique, promouvoir nous innovons au bénéfice de notre santé et nous réduisons la concurrence sur les données. De cette façon, nous créons des règles du jeu équitables, les entreprises néerlandaises peuvent jouer un rôle dans un marché mondial et, en fin de compte, le patient est mieux aidé par un traitement plus efficace, de meilleurs diagnostics ou une nouvelle thérapie.
En tant que directeur technique, Wiro Niessen fournit une mise à jour sur les activités de Health-RI au cours de l’année Congrès Santé-IR le 6 octobre. L’inscription à cette conférence est gratuite et peut se faire via le site de l’événement. La langue de la conférence est l’anglais.
