Une analyse de plus de 100 000 cas de cancer colorectal et de 154 000 témoins sains publiée dans Génétique naturelle découvert des centaines de signaux qui pourraient servir de nouvelles cibles de traitement et de prévention.
Cette étude est deux fois plus importante que les précédentes études d’association à l’échelle du génome, selon l’article. La collaboration comprenait des chercheurs affiliés à des centaines d’études et d’institutions à travers l’Europe, l’Amérique du Nord et l’Asie, dont Stephanie Schmit, PhD, MPH, vice-présidente du Genomic Medicine Institute de la Cleveland Clinic. Les études d’association à l’échelle du génome à cette échelle aident les chercheurs à identifier les gènes associés au cancer colorectal ainsi que les voies biologiques affectées par ces gènes.
“Il s’agit d’une avancée majeure dans la compréhension de la complexité de la susceptibilité génétique au cancer colorectal”, déclare le Dr Schmit, qui a commencé à travailler sur une partie de cet effort pendant sa formation doctorale il y a environ une décennie. “Les données ont révélé certaines voies qui pourraient avoir un potentiel de prévention et de traitement de la maladie, et fournir un renforcement continu des mécanismes d’exploration en dehors du côlon, tels que le système immunitaire.”
Le Dr Schmit faisait partie du groupe partageant la première paternité de cette étude, représentant l’étude transdisciplinaire colorectale (CORECT) financée par la subvention U19CA148107 des National Institutes of Health.
Le cancer colorectal se développe à partir d’excroissances, appelées polypes, dans la paroi interne du côlon. La maladie touche chaque année plus de 1,9 million de personnes dans le monde. Bien que certaines mutations rares transmises par les familles soient associées à un risque très élevé de cancer colorectal, la plupart des variants génétiques contribuant au cancer colorectal sont courants dans la population et chacun confère à lui seul un très faible risque accru. Combinée aux facteurs environnementaux et de style de vie et aux comportements de dépistage du cancer, la génétique est une pièce importante du puzzle pour cette maladie complexe.
Les chercheurs ont comparé les données génomiques de personnes avec et sans cancer colorectal pour identifier les associations génétiques avec la maladie. L’étude a identifié 250 associations de risque indépendantes, dont 50 n’avaient pas été découvertes auparavant, grâce à l’analyse de données génomiques, transcriptomiques et méthylomiques. Les analyses ont également trouvé 155 gènes effecteurs de haute confiance, qui codent pour des molécules qui affectent l’activité biologique.
Comprendre le « tableau complet » du cancer colorectal
Après avoir identifié les gènes, les chercheurs pourraient alors examiner quels gènes associés au risque provoquent des changements dans d’autres tissus en dehors de la muqueuse colique, le tissu tapissant le côlon où se développent les polypes cancéreux. Les résultats ont montré que plus d’un tiers des gènes effecteurs agissent très probablement en dehors de la muqueuse colique.
L’étude a également révélé que le risque de cancer colorectal découle de la variation de la fonction colorectale normale au niveau moléculaire : homéostasie, prolifération, adhésion cellulaire, migration, immunité et interactions microbiennes.
Les résultats révèlent que les gènes identifiés pourraient affecter plusieurs systèmes, y compris les fonctions cardiovasculaires, nerveuses et immunitaires. Le microbiote intestinal est également un domaine d’intérêt potentiel pour les recherches futures, selon l’article.
La nouvelle analyse et la poursuite de la collaboration sont un « tremplin » pour les efforts de recherche qui pourraient se traduire en pratique clinique, explique le Dr Schmit.
Ces efforts de découverte aident à confirmer les pistes à explorer dans la recherche sur le cancer colorectal à l’avenir. Les données supplémentaires sur les voies biologiques fournissent des informations pour discerner le risque génétique de cancer colorectal et comment ces informations pourraient potentiellement être exploitées pour le dépistage stratifié par risque et pour le développement de nouvelles approches de prévention et de traitement.
Dr Stephanie Schmit, PhD, MPH, vice-présidente de l’Institut de médecine génomique de la Cleveland Clinic
Source:
Référence de la revue :
Fernandez-Rozadilla, C., et al. (2022) Décryptage de la génétique du cancer colorectal grâce à une analyse multi-omique de 100 204 cas et 154 587 témoins d’ascendance européenne et est-asiatique. Génétique naturelle. doi.org/10.1038/s41588-022-01222-9.
