Séroconversion du SRAS-CoV-2 chez les enfants fréquentant une garderie par rapport aux adultes en Allemagne entre octobre 2020 et juin 2021

Les données utilisées pour cette analyse ont été dérivées de l’étude COALA et collectées entre octobre 2020 et juin 2021, lorsque l’ancêtre et la variante alpha du SRAS-CoV-2 étaient prédominants en Allemagne.

Étudier le design

Les méthodes de l’étude COALA sous-jacente sont décrites ailleurs¹⁵. En bref, l’étude COALA (« Corona-outbreak- Related Exams in Daycare Centres ») était une étude prospective et longitudinale examinant la dynamique de transmission du SRAS-CoV-2 dans 30 garderies et ménages connectés. Par conséquent, la sélection des participants était liée aux épidémies de SRAS-CoV-2 dans les garderies de toute l’Allemagne. Les trajectoires d’infection des enfants affectés et de leurs contacts ont été surveillées via des tests PCR répétés, un enregistrement des symptômes et un prélèvement de sang capillaire ainsi que via un questionnaire écrit sur les infections antérieures par le SRAS-CoV-2 et l’exposition à des personnes infectées par le SRAS-CoV-2. Le comité d’éthique de l’association médicale de Berlin a examiné l’étude COALA et a approuvé la mise en œuvre de l’étude (Eth-39/20). La participation à l’étude était volontaire et tous les participants ont été informés des objectifs et du contenu de l’étude ainsi que de la protection des données et ont donné leur consentement éclairé écrit. Chaque participant s’est vu attribuer un numéro d’étude séquentiel (ANR) afin d’assurer la pseudonymisation des documents et du matériel d’étude. COALA est enregistré dans le registre allemand des essais cliniques (DRKS-ID = DRKS00023501).

Caractéristiques des échantillons

Dans l’étude COALA, 114 personnes ont été testées positives pour le SRAS-CoV-2 par PCR (45 jeunes enfants de 1 à 6 ans, 69 adultes). Les résultats d’anticorps étaient disponibles pour 97 participants (38 jeunes enfants, 59 adultes). Pour 17 participants (sept jeunes enfants, dix adultes), aucune mesure des anticorps n’a été réalisée car aucun rendez-vous pour le prélèvement sanguin n’a pu être pris, le prélèvement sanguin a été refusé ou parce que la qualité de l’échantillon de sang était insuffisante. Les participants provenaient d’un milieu communautaire non clinique et étaient asymptomatiques ou présentaient de légers symptômes de COVID-19 (c’est-à-dire rhinite, maux de tête, mal de gorge, toux, mélangie et fièvre, voir aussi réf. ¹⁶).

Échantillonnage

Pour examiner les anticorps du SRAS-CoV-2, du sang capillaire a été prélevé à deux moments : le premier a été prélevé au début de la période d’étude lors de la première visite à domicile (= prélèvement de base), 4 à 6 jours après la date du test de le cas index. Le cas index a été défini comme le premier cas positif au sein du groupe de garderie qui a reçu un diagnostic de SRAS-CoV-2 via PCR et signalé aux autorités sanitaires locales. Le deuxième échantillon de sang (= prélèvement de suivi) a été prélevé environ cinq semaines après la visite d’échantillonnage de base selon le protocole de l’étude si la personne participante a été testée positive pour le SRAS-CoV-2 par PCR soit avant la période d’étude par les autorités sanitaires, soit dans les tests PCR pendant la période d’étude. (voir également la Fig. 1 supplémentaire).

Analyses de laboratoire

Des échantillons de sang séché (DBS) ont été analysés pour détecter les anticorps IgG du SRAS-CoV-2 à l’aide du test qualitatif commercial d’anticorps « Anti-SARS-CoV-2 ELISA (IgG) » (sensibilité 94,4 % – échantillon de sang prélevé > 10 jours après l’apparition des symptômes ; spécificité 99,6%) par le fabricant Euroimmun (Euroimmun Medizinische Labordiagnostik AG, Lübeck, Allemagne). Le test détecte les anticorps dirigés contre l’antigène Spike (antigène S1). Une étude de validation a été réalisée pour vérifier l’applicabilité du test aux échantillons de sang séché. Après évaluation des résultats, le seuil de ratio de séropositivité fourni par le fabricant (≥1,1) a été adapté à ≥0,94.¹⁷. Les résultats indéterminés ont été considérés comme négatifs. Les résultats des tests sont semi-quantitatifs, c’est-à-dire qu’ils ne peuvent être classés que comme positifs (rapport ≥0,94) ou négatifs (rapport <0,94) sans quantification en termes de détermination du titre.

La qualité des tests PCR a été assurée en mesurant le c-myc humain¹⁸.

Détermination des taux de séroconversion

Pour établir la comparabilité entre les taux de séroconversion chez les jeunes enfants et les adultes, nous avons déterminé la date probable de l’infection pour chaque participant, en tenant compte des informations sur l’exposition et l’apparition des symptômes (le cas échéant), du statut en anticorps lors de la première prise de sang et de la date du premier test PCR positif. (pour plus d’informations, voir réf. ¹⁹). En raison de la conception de notre étude, le moment de la première PCR positive au cours de l’infection variait selon les participants à l’étude. Comme décrit dans d’autres publications, les symptômes et leur apparition ne constituent pas des paramètres fiables pour l’apparition d’infections par le SRAS-CoV-2 chez les enfants.^20,21. C’est pourquoi nous avons décidé de déterminer les dates probables d’infection comme points de départ pour l’analyse des évolutions individuelles de l’infection.

Pour évaluer une association potentielle entre la séroconversion et la charge virale, nous avons sélectionné les résultats de PCR avec la charge virale la plus élevée (c’est-à-dire la valeur Ct la plus basse ; pour plus de détails, voir la réf. ²²) de chaque participant pour les analyses.

Statistiques et reproductibilité

Les caractéristiques des participants sont présentées sous forme de moyenne/médiane, ± SD (écart type) pour les variables continues et en % pour les variables catégorielles.

Une approche de régression logistique étape par étape en arrière a été utilisée pour identifier les prédicteurs possibles du résultat de la séroconversion lors des tests de suivi. Les variables suivantes ont été prises en compte : le sexe, une variable indiquant si la personne testée était un adulte ou un enfant, la charge virale (valeur Ct la plus basse), la présence de symptômes et l’intervalle de temps entre la date probable de l’infection et la recherche d’anticorps à suivi.

Quel que soit le critère utilisé pour déterminer les variables à exclure, la charge virale (valeur Ct la plus faible), l’intervalle de temps entre la date probable de l’infection et le test d’anticorps lors du suivi et une variable indiquant que la personne testée est un adulte ont été sélectionnés pour une analyse plus approfondie, tandis que le sexe et les symptômes ont été écartés.

Le modèle final présenté dans le texte a été réexécuté avec la correction du biais de Firth²³. Cette correction a été utilisée pour tenir compte de la petite taille de l’échantillon dans certaines catégories (un seul cas séronégatif dans le groupe des jeunes enfants). Cette petite taille d’échantillon est également la raison pour laquelle les résultats sont présentés sous forme de rapports de cotes, basés sur un modèle de régression logistique, et non sous forme de risques relatifs, puisque l’estimation du rapport de cotes est moins sujette au biais d’un petit échantillon que l’estimation du risque relatif.

De plus, l’analyse de régression logistique multivariée a été corrigée pour tenir compte de la répartition inégale des individus séropositifs chez les jeunes enfants et les adultes. A cet effet, la variable indicatrice indiquant si la personne testée est un adulte a été insérée.

Les analyses ont été effectuées à l’aide de STATA/SE 17 (StataCorp LLC, College Station TX, USA), ainsi que de la version R 4.1.2 (2021-11-01) « Bird Hippie » Copyright (C) 2021 pour le package de régression logistique étape par étape vers l’arrière. MASS’ version 7.3-58.3 et pour l’analyse de régression avec le package de correction de biais Firth ‘logistf’ version 1.24.1.

Résumé du rapport

De plus amples informations sur la conception de la recherche sont disponibles dans le résumé du rapport Nature Portfolio lié à cet article.