Panama, 26 août 2022 (OPS) – Des représentants de 17 laboratoires de santé publique de la région se sont réunis cette semaine pour la 26e édition du cours sur l’évolution virale et l’épidémiologie moléculaire (VEME) au Panama. La formation, organisée par l’Instituto Conmemorativo Gorgas de Estudios de la Salud (ICGES) au Panama, la Fondation Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) au Brésil et l’Organisation panaméricaine de la santé (OPS), vise à renforcer la surveillance génomique dans les Amériques. .
« L’étude de l’évolution des virus est essentielle pour détecter des mutations ou des variantes qui peuvent modifier le taux de transmission ou la gravité d’un agent pathogène et affecter l’efficacité des tests de diagnostic, des vaccins et des traitements », a déclaré Jairo Méndez, conseiller sur les maladies virales émergentes à l’OPS. “C’est quelque chose que nous avons vécu avec le SRAS-CoV-2, nous devons donc approfondir la surveillance génomique de tout virus émergent ou ré-émergent”, a-t-il ajouté.
Plus de 120 personnes du monde entier ont participé à la 26e édition de VEME, un cours qui a vu le jour à l’Université de Louvain, en Belgique, il y a plus de 25 ans. Une cinquantaine d’experts en bioinformatique issus d’institutions scientifiques renommées de 15 pays ont dispensé la formation qui s’est déroulée du 21 au 26 août au Panama. Les participants de la région ont été soutenus par l’OPS avec des fonds du gouvernement des États-Unis.
Le cours était composé de sessions théoriques et pratiques réparties en quatre modules, allant de la génération de données issues du séquençage génomique à l’analyse plus complexe de ces séquences. Pour la première fois, VEME comprenait également un module destiné aux managers et décideurs.
Le Dr Carlos Sáenz, secrétaire général du ministère nicaraguayen de la santé, a estimé que la formation était “extrêmement importante” tant pour les techniciens qui effectuent le séquençage génomique que pour les décideurs comme lui. “Le cours a fourni des outils pour relier la situation épigénétique, le séquençage génomique et les informations d’épidémiologie moléculaire à la prise de décision politique et stratégique au niveau de chaque pays”, a-t-il déclaré, soulignant la pertinence “d’intégrer des approches techniques avec une participation transdisciplinaire pour la résolution de problèmes complexes.”
Le séquençage et l’analyse génétiques permettent de mieux comprendre l’évolution d’un virus et de ses variantes, ainsi que sa dispersion géographique et temporelle. L’analyse opportune des données permet d’identifier des signes ou des changements pouvant avoir un impact sur le comportement du virus et sur les outils et mesures sanitaires. De plus, les informations obtenues peuvent être complémentaires pour orienter la réponse à une épidémie ou une pandémie.
“Ce type d’analyse bioinformatique n’est pas quelque chose qui se fait couramment dans les laboratoires de santé publique de la région car il nécessite une formation et une éducation”, a déclaré Alexander Martinez Caballero, directeur du département de recherche en génomique et protéomique à l’Institut Gorgas au Panama. “Désormais, de nombreux laboratoires seront en mesure d’effectuer ces analyses dans leurs installations en temps opportun et pour divers virus d’intérêt, comme le monkeypox et d’autres qui peuvent apparaître”, a-t-il déclaré.
Depuis le début de la pandémie COVID-19, la capacité de séquençage pour surveiller le SRAS-CoV-2 et ses variantes a été étendue dans la région avec le soutien de l’OPS et du Réseau régional de surveillance génomique COVID-19 (COVIGEN), qui comprend des laboratoires de plus de 20 pays des Amériques.
L’OPS a fourni une formation pour renforcer le séquençage génomique et l’intégrer dans la surveillance épidémiologique dans les pays. Depuis 2020, COVIGEN a réalisé plus de 426 000 séquences de SARS-CoV-2 en Amérique latine et dans les Caraïbes.
Le cours VEME est une action de plus pour renforcer la surveillance et est aligné sur la Stratégie régionale de surveillance génomique pour la préparation et la réponse aux épidémies et pandémies, qui sera discutée en septembre par les responsables de la santé des Amériques lors de la 30e Conférence sanitaire panaméricaine de l’OPS à Washington.
