Les Centers for Disease Control and Prevention ont tiré la sonnette d’alarme sur la menace croissante posée par un champignon résistant aux médicaments et potentiellement mortel qui a déclenché les plus grandes épidémies du pays dans les hôpitaux et les établissements de soins de longue durée du sud du Nevada.
Le champignon Candida auris s’est propagé à un “taux alarmant” aux États-Unis, avec un triplement du nombre de cas résistants à l’antifongique le plus recommandé utilisé pour traiter les infections, a déclaré l’agence fédérale de santé publique le 20 mars. Ses données ont été incluses dans un nouvelle étude publiée le même jour dans les Annals of Internal Medicine.
L’éradication du champignon dans les endroits où il s’est installé est peu probable, a déclaré mercredi l’auteur principal de l’étude au Review-Journal.
“C’est plus difficile si vous détectez cette situation après qu’il y ait déjà eu une transmission non détectée pendant un certain temps”, a déclaré l’auteur de l’étude et épidémiologiste du CDC, le Dr Meghan Lyman.
Ce scénario s’est déroulé à plusieurs endroits, a-t-elle dit, y compris le sud du Nevada. L’année dernière, le Nevada a signalé le plus grand nombre de cas de tous les États, selon les données du CDC.
En avril de l’année dernière, le ministère de la Santé et des Services sociaux du Nevada a alerté les prestataires de soins de santé des épidémies de champignons dans le sud du Nevada, comme indiqué pour la première fois dans le Review-Journal. Les premiers cas ont été identifiés en août 2021.
En 2022, le Nevada a signalé 384 des 2 377 cas cliniques de C. auris du pays, selon les données du CDC. Au moins 27 États et le district de Columbia ont signalé des cas, les premières infections aux États-Unis ayant été signalées en 2013.
Depuis août 2021, plus de 1 000 personnes dans le sud du Nevada ont été infectées par le champignon, selon les données du Nevada State Public Health Laboratory de l’Université du Nevada, Reno’s School of Medicine. Il n’y a eu qu’un seul cas détecté dans le nord du Nevada, à Reno en 2019. Une centaine de patients atteints de C. auris sont décédés, selon les données du laboratoire.
Près de 500, soit près de la moitié, des habitants du sud du Nevada identifiés avec le champignon présentaient des cas cliniques, tels qu’une infection invasive du sang, du cœur ou du cerveau. Les autres étaient des cas de colonisation, dans lesquels le champignon a été détecté vivant sur la peau de la personne mais avait pas causé d’infection.
Le champignon ne constitue généralement pas une menace pour les personnes en bonne santé. Les patients les plus à risque d’infections sont les patients hospitalisés pendant de longues périodes, avec un cathéter veineux central – également appelé cathéter central – ou d’autres lignes ou tubes pénétrant dans leur corps, ou qui ont déjà reçu des antibiotiques ou des médicaments antifongiques, selon le CDC.
Le champignon peut se propager à partir d’individus colonisés qui ne savent pas qu’ils l’ont. Il peut également se propager à partir de surfaces, telles qu’une barrière de lit ou un équipement, où il peut survivre pendant de longues périodes.
Pas le nouveau COVID
Candida auris n’est pas considéré par les autorités sanitaires comme le prochain COVID-19, qui s’est largement propagé par le biais d’activités ordinaires et a infecté – et parfois tué – des personnes auparavant en bonne santé.
David Hess, un scientifique en génomique du laboratoire de santé publique de l’État, a déclaré que C. auris est plus comparable au SARM, une infection à staphylocoque résistant aux médicaments qui est également associée aux établissements de soins de santé.
En d’autres termes, c’est une menace sérieuse pour la santé publique. Pour mieux suivre la menace, le laboratoire, après avoir reçu une notification concernant les épidémies, a commencé il y a un an à effectuer le séquençage du génome entier, une technique avancée d’analyse génétique, sur des échantillons de chaque résultat de test positif pour C. auris.
Les scientifiques du laboratoire ont découvert que le champignon mute de manière à le rendre résistant au médicament antifongique préféré pour le traiter, un développement que le superviseur moléculaire du laboratoire, Andrew Gorzalski, a décrit comme alarmant.
Seules trois classes de médicaments antifongiques sont utilisées, ont déclaré les scientifiques. La plupart des cas de C. auris sont naturellement résistants à un type, les azoles. Un deuxième type, les polyènes, peut provoquer de la fièvre et des tremblements chez les patients, ce qui lui donne le malheureux surnom de « secouer et cuire ».
Dans 2 à 3% des cas, C. auris montre une résistance accrue au traitement préféré, les échinocandines, selon des analyses de laboratoire.
“Nous voyons cette résistance évoluer dans l’épidémie du Nevada où nous ne l’avions pas vue auparavant, et c’est quelque chose que nous sommes encore en train de mettre la main dessus”, a déclaré Hess.
Le Nevada effectue le dépistage le plus en temps réel de la résistance aux champignons fongiques de tous les États touchés par une épidémie, a-t-il déclaré. En identifiant rapidement les cas résistants aux médicaments, les autorités peuvent travailler avec les médecins et les établissements de santé pour se concentrer sur l’arrêt de leur propagation.
“Nous pensons que ce sera l’une des meilleures stratégies pour l’avenir”, a déclaré Hess.
Lyman du CDC a noté que de nouveaux antifongiques sont en cours de développement et que le gouvernement fédéral envisagera d’autoriser les antifongiques existants approuvés par la FDA pour d’autres conditions afin de traiter les cas invasifs de C. auris.
Retracer le cheminement d’un agent pathogène
Grâce à son analyse génétique, le laboratoire d’État a également pu retracer le chemin du champignon. Il a initialement trouvé trois clades ou souches distinctes dans le sud du Nevada. L’un s’est rapidement éteint. Les deux autres se sont répartis entre les établissements médicaux.
Les deux autres souches ont été initialement identifiées dans des cas au Sunrise Hospital and Medical Center et au Centennial Hills Hospital Medical Center, a déclaré Shannon Litz, porte-parole du ministère de la Santé et des Services sociaux du Nevada, l’année dernière.
Deux souches supplémentaires ont été identifiées plus récemment, dont une du Texas. L’analyse indique que des patients du Nevada ont introduit des souches en Arizona et en Utah, a déclaré Gorzalski.
Le champignon a été identifié dans plus de 30 hôpitaux et établissements de soins de longue durée du sud du Nevada, selon les données de l’année dernière de la Division de la santé publique et comportementale du Nevada. Le ministère n’a pas fourni la mise à jour demandée sur les données.
Candida auris est en hausse partout à travers le pays et dans le monde, pas seulement au Nevada. “Nous avons eu la plus grande épidémie, elle s’est en quelque sorte établie, mais c’est quelque chose qui se voit partout”, a déclaré Hess.
Pour aider à arrêter la transmission, le laboratoire propose des tests gratuits et rapides pour dépister les patients à haut risque de C. auris, tels que ceux admis dans un établissement de soins de longue durée après un transfert d’un hôpital. L’identification d’un cas à l’admission permet de prendre des précautions avant que d’autres personnes ne soient infectées.
Parlant de manière générale des cas aux États-Unis, Lyman a déclaré: «Je pense qu’il existe certainement des possibilités d’amélioration avec l’identification des cas, soit par le biais d’échantillons cliniques, soit par le dépistage. Souvent, les cas sont identifiés tardivement, ou après avoir été dans un établissement pendant un certain temps, et ont eu l’occasion de se propager à d’autres.
Elle a déclaré qu’il y avait également place à l’amélioration des pratiques de contrôle des infections dans les établissements de santé.
“Beaucoup de travailleurs de la santé et de services de santé y travaillent très dur, et il n’est pas facile d’avoir une bonne observance et une bonne observance”, a-t-elle déclaré.
La mise en évidence des domaines à améliorer avec Candida auris “aidera pour le prochain pathogène émergent, qu’il s’agisse d’un virus, d’une bactérie ou d’un champignon”, a-t-elle déclaré. “Peut-être qu’en abordant Candida auris, nous sommes un peu en avance pour le prochain.”
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