Les nouveaux traitements contre la tuberculose s’attaquent à la maladie sans détruire votre microbiome

Dans une étude récente publiée dans la revue Le microbe Lancetles chercheurs ont examiné l’impact de six schémas thérapeutiques expérimentaux et du traitement standard de la tuberculose sur le microbiome respiratoire obtenu à partir d’échantillons d’expectorations.

Arrière-plan

Ces dernières années ont été marquées par des recherches approfondies sur le rôle de divers microbiomes sur la santé globale, des études indiquant l’association entre la dysbiose du microbiome intestinal et de nombreuses maladies. Des recherches croissantes indiquent que les microbiomes respiratoires jouent également un rôle important dans la modulation de l’immunité de l’hôte et dans l’augmentation de la résistance aux agents pathogènes respiratoires. On sait que diverses maladies, ainsi que l’utilisation d’antibiotiques, provoquent une dysbiose du microbiome.

Bien que le traitement standard contre la tuberculose, qui comprend deux mois de traitement à l’isoniazide, au pyrazinamide, à la rifampicine et à l’éthambutol, suivis de quatre mois d’isoniazide et de rifampicine, ne perturbe pas entièrement la diversité du microbiome respiratoire, il provoque l’épuisement de bactéries commensales spécifiques. qui sont immunologiquement importants.

Dans le but de réduire la durée d’exposition du microbiome respiratoire aux antibiotiques, de nouveaux schémas thérapeutiques plus courts contre la tuberculose sont à l’étude.

Étant donné que le microbiome respiratoire est sensible à des facteurs tels que la maladie et l’alimentation, l’utilisation prolongée de certains antibiotiques peut aggraver la dysbiose du microbiome, soulignant la nécessité d’étudier l’impact de tels schémas thérapeutiques antibiotiques sur le microbiome respiratoire.

À propos de l’étude

Dans la présente étude, les chercheurs ont mené une analyse rétrospective de l’impact des schémas thérapeutiques contre la tuberculose sur le microbiome respiratoire en analysant des échantillons d’expectorations collectés longitudinalement et obtenus dans le cadre de deux essais cliniques évaluant l’efficacité de six schémas thérapeutiques expérimentaux contre la tuberculose par rapport à celle de la norme. schéma thérapeutique contre la tuberculose.

L’essai clinique PanACEA MAMS-TB a étudié l’efficacité de quatre traitements expérimentaux, qui comprenaient diverses combinaisons et dosages d’isoniazide, de pyrazinamide, de rifampicine et d’éthambutol. L’étude HIGHRIF2 a évalué la réponse bactériologique, la tolérabilité et la pharmacocinétique de différentes doses de rifampicine.

Des échantillons d’expectorations de patients ayant répondu positivement aux traitements et ayant signalé au moins une culture négative à la fin des essais cliniques ont été inclus dans l’analyse.

L’acide ribonucléique (ARN) total a été extrait des échantillons d’expectorations et la charge bacillaire de Mycobacterium tuberculosis a été mesurée à l’aide du test de charge bactérienne moléculaire de la tuberculose. L’ARN total a ensuite été converti en acide désoxyribonucléique complémentaire (ADNc) par transcription inverse, et la région V3 – V4 du gène de l’ARN ribosomal 16S a été ciblée pour amplification. La réaction en chaîne par polymérase indexée (une PCR avec des adaptateurs d’ADN variables a été utilisée pour la préparation de la bibliothèque et un séquençage d’amplicons à haut débit a été réalisé.

Les séquences obtenues ont été analysées pour les bactéries totales et séparément pour les cyanobactéries photosynthétiques. Une gamme d’indices de diversité et d’uniformité, tels que les mesures de diversité alpha, l’indice de diversité de Shannon, l’indice d’uniformité de Pielou et l’indice de diversité phylogénétique de Faith, ont été calculés pour les données obtenues.

De plus, les participants qui ont fourni les échantillons d’expectorations ont été regroupés en fonction de leur région d’origine, et le test de Mann-Whitney a été utilisé pour tester la différence dans la diversité de leur microbiome respiratoire. Le test de Mann-Whitney a également été utilisé pour évaluer les différences de diversité alpha avant et après traitement pour chaque schéma thérapeutique.

Résultats

Les résultats ont indiqué qu’un schéma thérapeutique composé de 5 mg/kg par jour d’isoniazide, 20 mg/kg par jour de rifampicine, 25 mg/kg par jour de pyrazinamide et 400 mg/kg par jour de moxifloxacine pendant trois mois avec de l’isoniazide à 5 mg/kg par jour et la rifampicine à 10 mg/kg par jour pendant les trois mois et demi suivants ont été efficaces pour contrôler la tuberculose sans avoir d’impact sur la récupération du microbiome respiratoire.

Les analyses du microbiome ont révélé que les microbiomes des crachats avant le traitement étaient dominés par les Firmicutes au niveau du phylum et Streptocoque au niveau du genre.

L’étude a révélé que l’abondance et la diversité du microbiome respiratoire subissaient un schéma de chute et de récupération similaire aux interactions prédateur-proie, indiquant la sensibilité initiale et le développement de la résistance du microbiome aux antibiotiques.

La diversité du microbiome a diminué de manière significative au cours des deux premières semaines de traitement, les schémas thérapeutiques contenant 35 mg/kg de rifampicine et de moxifloxacine étant responsables de la réduction la plus significative de la diversité microbienne.

De plus, alors que la plupart des niveaux de taxons du microbiome se sont rétablis au cours du suivi, le Mycobactérie les niveaux ne se sont pas rétablis, ce qui indique que M. tuberculose était particulièrement sensible à ces antibiotiques.

Conclusions

Les résultats ont montré que les schémas thérapeutiques standard contre la tuberculose, composés d’isoniazide, de pyrazinamide, de rifampicine et d’éthambutol, avaient un impact marginal sur le microbiome respiratoire et n’avaient pas d’impact significatif sur la diversité.

De plus, l’inclusion de la moxifloxacine dans le régime et l’augmentation de la dose de rifampicine ont eu un impact considérable sur le microbiome, en particulier sur le Mycobactérie les niveaux. Cependant, le régime comprenant 20 mg/kg de rifampicine a entraîné la récupération du microbiome en trois mois.

Les résultats mettent en évidence la possibilité d’améliorer le traitement de la tuberculose sans nuire aux bactéries commensales du microbiome respiratoire.