Des chercheurs de l’Université de Virginie développent un outil en ligne flexible pour parcourir les informations utilisées dans la lutte visant à sauver les enfants des maladies diarrhéiques mortelles en identifiant les points chauds de transmission et en accélérant le déploiement de traitements et de nouveaux vaccins.
Non seulement la diarrhée tue des centaines de milliers d’enfants dans le monde chaque année, mais elle contribue également à la malnutrition qui peut empêcher les enfants de grandir et de se développer pleinement, tant physiquement que mentalement, les enfermant dans la pauvreté. Bien que des progrès significatifs aient été réalisés dans la lutte contre la maladie ces dernières années, les chercheurs de l’UVA affirment que l’ère moderne du « big data » offre une vaste opportunité inexploitée pour réagir avec plus d’agilité et aider davantage d’enfants.
Leur Observatoire planétaire de la santé infantile et de l’entérite (Plan-EO) rassemble l’expertise d’épidémiologistes, de climatologues, de bioinformaticiens et d’hydrologues (experts en approvisionnement en eau) pour fournir une vue d’ensemble sans précédent de la diarrhée dans le monde. Les informations et les prévisions élaborées par ces experts seront hébergées sur un portail en ligne basé sur des cartes, donnant aux experts en maladies infectieuses et aux dirigeants locaux des pays à revenu faible et intermédiaire les informations dont ils ont besoin pour prendre des décisions intelligentes, hiérarchiser les ressources et se déplacer. rapidement pour sauver des vies.
“La diarrhée constitue une menace inavouable pour la santé publique, souvent ignorée ou considérée comme une expérience inévitable de l’enfance. Nous voulons changer cela”, a déclaré l’épidémiologiste Josh M. Colston, PhD, professeur adjoint à la division de médecine de l’UVA School of Medicine. Maladies infectieuses et santé internationale, qui dirige l’initiative. “Alors que les tendances des maladies diarrhéiques infectieuses changent en raison du changement climatique, nous voulons que la communauté de la santé publique soit prête et dispose de toutes les estimations et prévisions épidémiologiques les plus récentes à portée de main.”
Lutter contre la diarrhée infantile
Pour créer le nouveau tableau de bord en ligne, Colston collabore avec des experts de la School of Engineering, de la School of Data Science et du Biocomplexity Institute de l’UVA, ainsi qu’avec des collègues de l’Université Johns Hopkins. Ils adoptent une approche multidisciplinaire face à un problème complexe, cherchant à capitaliser sur un vaste éventail d’expertises et à bâtir sur des relations de longue date avec des collaborateurs à l’étranger.
Les chercheurs affirment qu’à mesure que le changement climatique s’accélère, la nécessité de suivre la propagation de la diarrhée ne fait qu’augmenter. Les inondations, par exemple, peuvent contribuer à la propagation de dizaines de bactéries, virus et parasites responsables de la diarrhée, aggravant ainsi la situation dans des zones déjà ébranlées par les effets des intempéries. C’est pourquoi il est important que le projet de l’UVA inclue des hydrologues, des climatologues et des experts dans des domaines allant au-delà des maladies infectieuses, affirment les chercheurs.
On prend de plus en plus conscience du fait que les maladies comportent des facteurs de risque à multiples facettes qui englobent des éléments environnementaux, sociaux et comportementaux. Nous l’avons vu avec la pandémie, et nous le voyons certainement avec les maladies diarrhéiques. C’est pourquoi une approche collaborative est cruciale. Nous avons la chance ici à l’UVA d’avoir des experts sur tous ces aspects tous sur les mêmes terrains, ainsi que le soutien pour les rassembler.”
Margaret Kosek, MD, professeur de médecine et clinicienne en maladies infectieuses
Données vitales en un coup d’œil
Le nouveau tableau de bord en ligne, actuellement en construction, sera mis à jour continuellement pour fournir les dernières données sur la dynamique des agents pathogènes, semblable au précieux tableau de bord COVID-19 de John Hopkins pendant cette pandémie. Les visiteurs du site Plan-EO seront dirigés vers une interface basée sur une carte du monde où ils pourront sélectionner des données sur des agents pathogènes spécifiques responsables de la diarrhée, tels que la bactérie E. coli ou Shigella.
Le tableau de bord permettra aux chercheurs et aux dirigeants de comprendre l’ampleur du fardeau de la maladie et de prédire les implications potentielles pour les enfants vivant dans les zones d’endémie. Cela permettra également aux experts en maladies infectieuses et aux dirigeants locaux de coordonner les meilleures stratégies pour répondre et contenir les épidémies, sauvant ainsi des vies.
“Disons que vous êtes épidémiologiste en Afrique ou en Asie du Sud et que vous êtes intéressé par une communauté spécifique dans un pays particulier pour mener à bien un projet d’amélioration de l’eau ou un essai de vaccin”, a déclaré Venkat Lakshmi, hydrologue et professeur John L Newcomb de Ingénierie en génie civil et environnemental. “Grâce à l’interface Plan-EO, vous pourrez naviguer jusqu’à cet emplacement sur une carte et obtenir des prévisions robustes sur la prévalence d’agents pathogènes particuliers, ainsi que des informations publiées sur les études menées dans les zones environnantes. ça va changer la donne.”
Les chercheurs prévoient de lancer le tableau de bord plus tard cette année, avec l’aide d’étudiants de recherche de l’UVA School of Data Science.
Résultats publiés
Les chercheurs ont décrit leur projet ambitieux dans la revue scientifique PLOS Un. L’équipe de recherche est composée de Colston, Bin Fang, Eric Houpt, Pavel Chernyavskiy, Samarth Swarup, Lauren M. Gardner, Malena K. Nong, Hamada S. Badr, Benjamin F. Zaitchik, Lakshmi et Kosek. Les chercheurs n’ont aucun intérêt financier dans le projet.
Le travail est soutenu par l’Institut national des allergies et des maladies infectieuses des National Institutes of Health, accorde 1K01AI168493-01A1 et 1R03AI151564-01 ; la National Science Foundation, subvention Expeditions in Computing CCF-1918656 ; Programme de travail du Groupe sur l’observation de la Terre de la NASA, subvention 16-GEO16-0047 ; et le programme d’ingénierie en médecine de l’UVA, Département de médecine interne et Division des maladies infectieuses et de la santé internationale. Un financement supplémentaire a été fourni par la Fondation Bill & Melinda Gates, subvention OPP1066146.
Source:
Système de santé de l’Université de Virginie
Référence du journal :
Colston, JM, et coll. (2024) The Planetary Child Health & Enterics Observatory (Plan-EO) : Un protocole pour une initiative de recherche interdisciplinaire et un tableau de bord Web pour cartographier les maladies infectieuses entériques et leurs facteurs de risque et interventions dans les PRFI. PLOS UN. est ce que je.org/10.1371/journal.pone.0297775.
2024-03-25 22:13:00
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