<div data-thumb="https://scx1.b-cdn.net/csz/news/tmb/2022/are-bacteriophages-the.jpg" data-src="https://scx2.b-cdn.net/gfx/news/hires/2022/are-bacteriophages-the.jpg" data-sub-html="Pentamer arrangement in the capsid of ϕKp24. a Top view of a pentameric capsomere. Five gp372 structures were fitted into the density map and colored differently. Compared with the hexamer, the pentamer lacks a structured pore at the center. Each C-terminal loop is flexible, and it tends to move to the area closer to another gp372’s hand. b Structural comparison between the MCP (cyan) in a hexamer and MCP (gray) in a pentamer. There are some differences, such as the C-terminal loop, the N-terminal α helix, and the pendulum angle (upper red arrow) of two triangular bodies (aligned hand and arm), or the pendulum angle (lower red arrow) of two hands (aligned triangular body). The right image in b shows the comparison after rotation of the left structure by 90°. c Pentamer-hexamer interactions. The interactions between a pentamer (gray) and a neighboring hexamer (cyan) are similar to the interactions between two hexamers. The upper left panel shows that the hand (gray) from the clockwise (CW) neighbor can interact with the triangular body (purple) in the same pentamer using salt bridges (residue E220 and K380, E163, and R558). In the pentamer MCP, residues R501 and R583 in the triangular body interact with residues D448 and E442 (the enlarged rectangular box, upper right panel). The gp372 from a hexamer and the gp372 from a pentamer are highlighted by different colors according to the structural units. The triangular body, arm, and hand of the gp372 in hexamer are colored black, deep blue, and orange. The triangular body, arm, and hand of the gp372 in pentamer are colored purple, green, and pink. d Side view of pentamer-hexamer interactions after rotation of the upper image by 90°. Credit: Communication Nature (2022). DOI : 10.1038/s41467-022-34972-5″>
Les bactériophages, des virus qui infectent les bactéries, peuvent être utilisés comme option de traitement alternative lorsque les antibiotiques échouent. Les chercheurs de Leiden ont étudié la structure et la fonction d’un nouveau bactériophage qui pourrait être utilisé pour traiter l’une des souches bactériennes préoccupantes de l’OMS où de nouveaux traitements sont nécessaires de toute urgence.
Une équipe de scientifiques de Leiden a recherché un bactériophage capable de combattre une bactérie spécifique. La bactérie en question réside normalement dans notre tube digestif et peut causer des dommages s’il se propage à d’autres parties de notre corps. Il peut alors provoquer diverses infections, comme la pneumonie et les infections urinaires.
La phagothérapie comme alternative aux antibiotiques
Ariane Briegel (Institute Biology Leiden) et Daan Pelt (Leiden Institute of Advanced Computer Sciences) en disent plus sur la recherche. “Selon l’OMS, la bactérie suscite des inquiétudes, car elle est de plus en plus résistante aux antibiotiques. La phagothérapie est une alternative potentielle pour lutter contre les infections bactériennes lorsque les antibiotiques ne sont pas efficaces”, explique Briegel.
C’est pourquoi il était important pour l’équipe d’étudier le bactériophage. Briegel dit: “Nous en avons découvert plus sur la structure et la fonction du bactériophage, ce qui nous donne un meilleur aperçu de la façon dont le bactériophage peut infecter l’agent pathogène.”
Pelt a cartographié une partie du bactériophage à l’aide d’un réseau neuronal, un algorithme qui apprend à partir d’exemples. “A l’extrémité du bactériophage se trouve un réseau complexe de queues qui jouent un rôle dans l’infection du bactéries. Pour l’instant, on sait peu de choses sur l’apparence de ces queues, car il existe une grande variété dans leurs structures. doctorat l’étudiant Ruochen Ouyang a cartographié manuellement sept de ces queue structures. Nous avons ensuite formé un réseau de neurones sur les sept exemples, afin de pouvoir également distinguer les structures de queue d’autres phages », explique Pelt.
“Travailler ensemble nous a donné des idées uniques”
“La collaboration de différentes disciplines nous a permis d’avoir un bon aperçu de divers sujets”, explique Briegel. “Par exemple, nous avons examiné de quels composants structurels le bactériophage est composé. Nous avons été soutenus par une équipe d’experts sur les fibres de queue de bactériophage. Parce que nous avons collaboré avec des scientifiques d’horizons différents, nous avons obtenu des informations uniques sur le bactériophage. aidez-nous à répondre à un large éventail de questions biologiques à l’avenir.”
Les chercheurs sont enthousiasmés par ce bactériophage spécifique. Briegel déclare : « Le problème avec phagothérapie est que les bactériophages n’agissent pas sur toutes les bactéries, même de la même espèce. Contrairement à de nombreux bactériophages connus, celui-ci est spécial car il agit sur de nombreux sous-types différents. Cela en fait un bon candidat pour phage thérapie. En apprenant davantage sur le fonctionnement du bactériophage, nous pouvons, espérons-le, traiter les personnes atteintes à l’avenir.”
L’article “Reconstruction haute résolution d’un Jumbo bactériophage infectant des bactéries capsulées à l’aide de fibres de queue hyperramifiées », est publié dans Communication Nature.
Plus d’information:
Ruochen Ouyang et al, Reconstruction haute résolution d’un Jumbo-bactériophage infectant des bactéries capsulées à l’aide de fibres de queue hyperramifiées, Communication Nature (2022). DOI : 10.1038/s41467-022-34972-5
Fourni par
Université de Leyde
Citation: Les bactériophages sont-ils les nouveaux antibiotiques ? (2022, 19 décembre) récupéré le 19 décembre 2022 sur https://phys.org/news/2022-12-bacteriophages-antibiotics.html
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