L’ADN de Néandertal dans la population humaine d’Amérique latine

Une enquête révèle la véritable étendue de l’héritage génétique des Néandertaliens dans la population humaine actuelle d’Amérique latine.

“Nous pensons que les Néandertaliens sont très différents de nous. Depuis la découverte des premiers fossiles de Néandertal en Europe au milieu du 19ème siècle jusqu’à relativement récemment, il y avait une idée répandue qu’il n’y avait pas grand-chose en commun entre les Néandertaliens et les humains. Cependant, la recherche scientifique a permis de vérifier que les humains modernes ont un apport génétique important des Néandertaliens. En d’autres termes, nous avons de l’ADN de Néandertal dans des proportions différentes », explique Miguel Delgado, chercheur au Conseil national de la recherche scientifique et technique (CONICET) en Argentine ainsi que professeur à la Faculté des sciences naturelles et au Musée de l’Université nationale. de La Plata (FCNyM, UNLP) en Argentine.

Delgado est membre d’un consortium international qui, sur la base des informations de plus de six mille personnes actuelles, a pu déterminer une empreinte génétique persistante significative de Néandertal dans les gènes responsables de la variation faciale dans divers groupes de la population latino-américaine actuelle. .

La comparaison avec les restes fossiles de plus d’une douzaine de Néandertaliens a corroboré le sens de l’effet génétique trouvé.

Rolando González-José, chercheur CONICET à l’Institut patagonien des sciences sociales et humaines (IPCSH, CONICET) et directeur du Centre national patagonien (CENPAT, CONICET), et Virginia Ramallo, chercheuse du Conseil à l’IPCSH ont également participé à l’étude.

Crâne de Néandertal, provenant de la collection du Museo de La Plata en Argentine, utilisé pour l’étude. (Photo: CONICET / R. Baridón)

L’étude est l’œuvre de près de 40 chercheurs, pour la plupart anthropologues et généticiens, d’Amérique latine et d’Europe qui composent le Consortium pour l’analyse de la diversité et de l’évolution en Amérique latine (CANDELA), orienté vers l’étude de l’architecture génétique de la physique variation des populations qui peuplent le continent. «Les caractéristiques morphologiques visibles, telles que la forme des dents, du visage et de la tête, ainsi que des données au niveau génomique, nous informent sur la diversité et l’évolution biologique qui se sont produites sur le continent américain. Émergé en 2010, notre consortium a été le premier à étudier ces questions au niveau régional », déclare Delgado.

L’équipe de recherche, dirigée par Qing Li de l’Université de Fudan en Chine, a basé ses travaux sur l’analyse des visages de près de 6 500 Latino-Américains/as – un échantillon large et diversifié – à partir de photographies traitées en deux dimensions à l’aide d’un logiciel automatique qui donne coordonnées ou points d’intérêt qui permettent l’identification et la mesure des caractéristiques morphologiques. « En même temps, nous avons fait différents types d’analyses génomiques pour relier la morphologie faciale de chaque individu à des gènes spécifiques. Ainsi, nous identifions les régions du visage et les gènes qui influencent la diversité morphologique », commente-t-il.

Les échantillons latino-américains ont été comparés à ceux de plus de 19 000 personnes d’Europe (10 115), d’Asie (5 298) et d’Afrique (3 631) pour voir la relation morphologique et génétique avec les ancêtres latino-américains les plus récents ; avec des données d’études antérieures ; et ils ont également été comparés aux archives fossiles de 12 Néandertaliens qui habitaient une grande partie de l’Europe et de l’Asie il y a entre 500 000 et 40 000 ans, et des Dénisoviens, une autre population d’humains archaïques qui vivaient en Asie il y a entre 500 000 et 30 000 ans. “Les archives fossiles de ce dernier sont très rares, il n’y a que quelques pièces dentaires, des fragments de crâne et quelques restes de membres. Dans un travail précédent de notre équipe, nous avons pu identifier un haplotype Denisovan (ensemble de marqueurs génétiques) qui influence la partie inférieure du visage chez les Latino-Américains actuels », souligne Delgado, ajoutant : « De même, la forme du nez dans l’échantillon latino-américain, il est également influencé par l’héritage néandertalien.

Selon Delgado, ces travaux montrent que, dans les populations latino-américaines actuelles, différents traits morphologiques – en particulier dans la région médiane du visage – sont directement liés à l’héritage génétique des humains archaïques en raison de leur croisement avec des humains anatomiquement modernes il y a des millénaires.

« Ce type d’étude est un exemple de la façon dont la constitution de biobanques qui stockent la diversité humaine valorise tous les types de recherche qui nous aident à mieux comprendre les bases génétiques et non génétiques de phénotypes complexes. Sa mise en œuvre est stratégique non seulement pour le cas des traits physiques étudiés dans cette recherche, mais aussi pour les traits biomédicaux spécifiques de la population argentine, principal argument pour la création du programme PoblAr », explique González-José.

Delgado postule qu’il y a entre 200 000 et 40 000 ans, les populations de Néandertal et de Denisovan se sont croisées avec des humains anatomiquement modernes à diverses époques, et que le pool génétique s’est poursuivi à partir de là. Par la suite, cet héritage a été transmis aux ancêtres des actuels Amérindiens et Européens, ces derniers étant les ancêtres des actuels Latino-Américains.

“L’héritage de Denisovan chez les Latino-Américains d’aujourd’hui est venu des Amérindiens, tandis que les Néandertaliens l’ont fait à travers la composante européenne. Cependant, il est encore difficile de connaître le moment exact auquel ces échanges génétiques se sont produits, bien qu’il soit très possible qu’ils se soient produits au cours des 50 000 dernières années », souligne Delgado, ajoutant : « Cet héritage génétique nous a donné des avantages et des inconvénients. au niveau évolutif. Les Dénisoviens, par exemple, se sont développés dans un contexte environnemental très compliqué dans la région sibérienne. La composante Denisovan a donc permis à nos ancêtres d’avoir la capacité de s’adapter à des environnements très froids et secs. D’autre part, il existe des preuves de la relation importante de la composante néandertalienne par rapport à certaines maladies ».

Un aspect notable du travail est qu’il a été reproduit dans d’autres populations humaines actuelles et même dans d’autres espèces (par exemple, les souris), et dans tous les cas, de nombreux gènes qui influencent la variation faciale ont été trouvés. “Cela nous donne le schéma selon lequel, en réalité, l’influence génétique est beaucoup plus large : essentiellement, chez les vertébrés, mais surtout pour les espèces génétiquement proches de l’homme comme les grands singes, c’est-à-dire les chimpanzés, les orangs-outans et les gorilles, et les hominines archaïques” .

Pour Delgado, ce type d’études revêt une importance supplémentaire sur le plan social : « Elles sont très utiles pour renverser les discours xénophobes ou racistes. Nos différences en tant qu’espèce sont morphologiques et non génétiques. Le racisme structurel qui stigmatise l’autre n’a aucune base génétique.

De son côté, Ramallo conclut : « Il est toujours intéressant de suivre la répercussion d’études comme celle-ci, au-delà des conclusions et des nouvelles recherches qui peuvent être menées par la suite. Je souligne la valeur du travail en commun, car la construction des connaissances est toujours une tâche commune. En 2010, lorsque les appels à volontaires ont commencé au Mexique, en Colombie, au Chili, au Pérou et au Brésil, nous ne pensions pas que nous pourrions finir par observer le passé de notre genre Homo. Afin de développer plus d’études à l’avenir, nous devons nous engager solidement et éthiquement dans les projets d’aujourd’hui. Les banques d’ADN et les informations associées, comme le Consortium CANDELA, permettent d’étudier la variabilité de nos populations et de comprendre les processus qui l’ont engendrée. Nous devons célébrer cette diversité.

L’étude s’intitule “Le repère automatique identifie de nouveaux locus associés à la morphologie du visage et implique l’introgression de Néandertal dans la forme nasale humaine.” Elle a été publiée dans la revue académique Communications Biology, du groupe Nature. (Source : Marcelo Gisande / CONICET. CC PAR 2.5 AR)