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Explorer l’univers microscopique : le microbiote oral et son impact sur la santé

Explorer l’univers microscopique : le microbiote oral et son impact sur la santé

2023-12-12 12:00:19

QU’EST-CE QUE LE MICROBIOTE ?

Le terme microbiote fait référence à une communauté de micro-organismes qui habitent un environnement spécifique et sont répartis dans de nombreuses parties de notre corps. Son rapport avec les cellules humaines est de 1:1 et sa relation avec nous est mutualiste, ce qui signifie que les deux parties en bénéficient. Cependant, cette interaction peut être rompue, permettant à ces micro-organismes de provoquer de multiples pathologies dues à divers facteurs, principalement dus à des altérations du système immunitaire.

Cet ensemble de micro-organismes est réparti dans toute notre peau et nos muqueuses. Chacun de ces microenvironnements présente une composition différente de communautés, dans lesquelles prédominent divers genres microbiens selon les conditions physico-chimiques qui leur sont attribuées.

COMPOSITION DU MICROBIOTE ORAL

La cavité buccale abrite une grande diversité de micro-organismes qui coexistent harmonieusement entre eux et avec les cellules hôtes. En termes de microbiote, la bouche est la deuxième plus grande du corps humain, après l’intestin. Il englobe divers microécosystèmes comprenant des bactéries, des protozoaires, des virus et des levures(1). La base de données sur le microbiome oral humain, connue sous le nom de Base de données sur le microbiome oral humain eHOMD, rapporte qu’il existe un total de 774 espèces de bactéries buccales. Parmi ces espèces, 54 % sont des espèces identifiées, 14 % sont sans nom mais cultivables et 32 ​​% sont des phylotypes non cultivables.

La plupart de ces micro-organismes sont présents dans la salive, tandis que d’autres adhèrent dans différents microenvironnements de la cavité buccale, comme les dents, le palais, la langue, les joues, la muqueuse buccale et les prothèses dentaires. Les six principaux phylums représentant 96 % des taxons du microbiome oral sont les Firmicutes, les Bacteroidetes, les Proteobacteria, les Actinobacteria, les Spirochaetes et les Fusobacteria. Les 4 % restants des taxons sont constitués des phyla Euryarchaeota, Chlamydia, Chloroflexi, SR1, Synergistetes, Tenericutes et Saccharibacteria. Parmi les genres bactériens dominants figurent Streptocoque, Prévotelle oui Veillonella constituant 70% du microbiote oral.

Lorsque les bactéries adhèrent à une surface, elles ont la capacité de former des liaisons avec d’autres micro-organismes, formant ainsi un réseau appelé « biofilm ». Lorsqu’ils ne sont pas efficacement éliminés par des pratiques d’hygiène bucco-dentaire, ils restent et piègent les colonisateurs secondaires et tertiaires, notamment certaines bactéries pathogènes. Finalement, cela entraîne la formation d’une plaque solide et durcie, difficile à éliminer, qui les protège et peut provoquer mauvaise haleine, caries, plaque dentaire et maladies bucco-dentaires.

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MALADIES ASSOCIÉES AU MICROBIOTE ORAL

L’interaction entre le microbiote buccal et le système immunitaire est cruciale pour le maintien de la santé bucco-dentaire. Normalement, ces bactéries cohabitent en harmonie, mais certains facteurs peuvent perturber cet équilibre et provoquer une dysbiose, qui affecte par la suite l’activation des cellules immunitaires. Cela déclenche des pathologies buccales telles que caries, parodontites et gingivites.

De plus, les maladies bucco-dentaires peuvent déclencher des processus inflammatoires qui stimulent la libération de cytokines pro-inflammatoires. Ces cascades inflammatoires peuvent déclencher des maladies systémiques telles que la polyarthrite rhumatoïde, l’endocardite, la bactériémie, des maladies cardiovasculaires, pulmonaires, hépatiques et différents types de cancers (gastro-intestinaux, pancréatiques et du sein).

Certains mécanismes de défense du système immunitaire contribuent à contrôler la propagation de ces micro-organismes issus du microbiote buccal. Par exemple, les bactéries, lorsqu’elles sont ingérées lors de la digestion, doivent surmonter de multiples barrières telles que l’acidité gastrique, le péristaltisme, l’alcalinité de la bile et du suc pancréatique, ainsi que toutes les barrières chimiques des muqueuses. Ces facteurs régulent les concentrations bactériennes qui transitent, rendant difficile leur passage vers le reste du système digestif. Cependant, il a été rapporté qu’une partie du microbiote intestinal partage des caractéristiques avec le microbiote oral en raison du passage de certains micro-organismes qui échappent aux barrières de l’organisme. Par conséquent, il a également été rapporté que des déséquilibres dans le microbiote oral peuvent également provoquer des altérations du microbiote intestinal et provoquer d’autres pathologies associées.

FONCTIONS DU MICROBIOTE ORAL

Le microbiote buccal joue divers rôles dans le maintien de la santé bucco-dentaire. L’un d’eux consiste à empêcher la colonisation d’agents pathogènes externes. Ceci est obtenu grâce à l’adhésion des micro-organismes du microbiote à la surface de la dent ou de la langue, créant ainsi une barrière qui inhibe l’invasion des bactéries pathogènes. Le processus d’adhésion repose sur des structures spécifiques présentes dans l’enveloppe des micro-organismes, qui se lient aux molécules du tissu dentaire ou de la muqueuse buccale. En occupant cet espace, le microbiote peut profiter de conditions environnementales favorables, comme la disponibilité de nutriments et de facteurs physico-chimiques favorisant sa croissance et sa prolifération.

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De plus, certains micro-organismes du microbiote ont la capacité de produire des substances antimicrobiennes. Lorsqu’ils consomment les nutriments disponibles dans la bouche, ils sécrètent des substances acides ou nocives qui peuvent affecter les structures d’autres bactéries, parmi lesquelles les bactériocines, qui ont des propriétés bactéricides.

D’autre part, le microbiote oral joue un rôle crucial dans le métabolisme des glucides et des composés alimentaires. Il a la capacité de métaboliser ces substances, facilitant ainsi leur absorption par l’hôte. Cette fonction métabolique est importante pour garantir une bonne utilisation des nutriments et une bonne santé globale.

Enfin, le microbiote a un impact sur le système immunitaire. Les micro-organismes sont constitués de molécules que le système immunitaire reconnaît comme des antigènes. En conséquence, ils stimulent notre système immunitaire, ce qui conduit à entraîner les cellules immunitaires à faire la différence entre elles et les agents étrangers. Cette modulation immunitaire est essentielle pour que l’organisme puisse répondre efficacement aux agents externes pouvant constituer une menace pour la santé bucco-dentaire.

COMMENT ETUDIER LE MICROBIOTE ORAL ?

De nombreux micro-organismes qui composent le microbiote oral sont difficiles à isoler en cultures de laboratoire pour leur caractérisation, car ils sont exigeants en termes de besoins nutritionnels ou de facteurs physico-chimiques, il est parfois difficile de simuler leurs conditions optimales et ils perdent facilement leur viabilité. faute d’exigences, c’est pourquoi grâce au développement de la biologie moléculaire, il a été poussé à extraire le matériel génétique de l’ensemble de la communauté microbienne, permettant de caractériser la diversité et la richesse des micro-organismes qui la composent.

Parmi les techniques utilisées figurent le séquençage des acides nucléiques, la technologie de l’ADN recombinant, l’étude du génome, la métagénomique (étudie à la fois le génome bactérien et le génome de l’hôte). Cela permet la classification phylogénétique des bactéries, conduisant à l’étude de ce que l’on appelle le microbiome, défini comme le contenu génomique complet de la communauté de micro-organismes commensaux, symbiotiques et pathogènes qui habitent un endroit particulier du corps humain.

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Si vous souhaitez en savoir plus, vous pouvez accéder au Human Microbiome Project (HMP) développé par le NIH depuis 2007, après avoir réalisé le projet sur le génome humain. Son objectif est de séquencer complètement le génome des micro-organismes qui se développent à l’intérieur du corps humain. Cela a permis la création de bases de données qui préservent les informations de tous ces micro-organismes découverts et permettent la caractérisation de tous les microbiomes humains.

CONCLUSION

Le microbiote buccal est une communauté de micro-organismes qui habitent notre cavité buccale et jouent un rôle fondamental dans la santé générale de l’hôte. Leur relation est mutualiste et leurs fonctions clés, telles que prévenir la colonisation d’agents pathogènes, produire des substances antimicrobiennes, faciliter l’absorption des nutriments et moduler le système immunitaire, soulignent leur importance. Cependant, le déséquilibre des interactions entre le microbiote buccal et l’hôte génère une dysbiose et déclenche de multiples pathologies buccales et systémiques. L’étude continue du microbiote oral, soutenue par les progrès de la biologie moléculaire et des techniques de séquençage, fournit des connaissances essentielles pour comprendre sa diversité, sa fonction et son impact sur la santé humaine, ouvrant de nouvelles perspectives dans la prévention et le traitement de diverses maladies.

***

Cet article nous est envoyé Laura Ospina Mateusbactériologiste, Master en Microbiologie et professeur à l’Universidad del Sinú Sectional Cartagena (Colombie)

Références scientifiques et plus d’informations :

  1. de Heredia, CB (2017). Microbiote indigène. Pharmacie professionnelle, 31(2), 17-21.
  2. Morrison, AG, Sarkar, S., Umar, S., Lee, ST et Thomas, SM (2023). La contribution du microbiome oral humain aux maladies bucco-dentaires : une revue. Microorganismes, 11(2), 318.
  3. Tan, X., Wang, Y. et Gong, T. (2023). L’interaction entre le microbiote oral, le microbiote intestinal et les maladies systématiques. Journal de microbiologie orale, 15(1), 2213112.
  4. Morrison, AG, Sarkar, S., Umar, S., Lee, ST et Thomas, SM (2023). La contribution du microbiome oral humain aux maladies bucco-dentaires : une revue. Microorganismes, 11(2), 318.



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