Des chercheurs découvrent de nouveaux traitements contre le cancer dans la “matière noire” du génome humain : The Tribune India

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Washington, le 7 octobre

Les chercheurs ont développé une méthode de criblage pour découvrir de nouvelles cibles médicamenteuses pour le traitement du cancer dans la soi-disant « matière noire » du génome. Ils ont appliqué leur méthode au cancer du poumon non à petites cellules (NSCLC), le plus grand tueur de cancer pour lequel des thérapies efficaces sont recherchées de toute urgence. Ils pourraient montrer que l’inhibition de cibles identifiées pourrait fortement ralentir la croissance du cancer, et leur méthode est adaptable à d’autres cancers.

Pour de nouvelles cibles, ils se sont penchés sur la classe de gènes mal connue appelée « longs ARN non codants (acides ribonucléiques) » (lncARN). Les LncRNA existent en abondance dans la soi-disant «matière noire» ou ADN non codant pour les protéines qui constitue la grande majorité de notre génome. Le génome humain contient environ 20 000 gènes “classiques” codant pour les protéines, mais ce nombre est éclipsé par 100 000 lncRNAs. De 99% des lncRNAs les fonctions biologiques sont inconnues.

Comme leur nom l’indique, les ARN longs non codants, contrairement aux ARN messagers (ARNm), ne codent pas les plans de construction des protéines. Comme pour les ARNm, les instructions de construction des lncARN sont contenues dans l’ADN de la cellule.

Pour étudier le rôle des lncRNA dans le NSCLC, les chercheurs ont commencé par analyser des ensembles de données accessibles au public pour voir quels lncRNA sont présents dans le NSCLC. Cette analyse a conduit à une liste de plus de 800 ARNln, dont les chercheurs ont souhaité étudier l’importance pour les cellules NSCLC. Pour cette enquête, ils ont développé un système de criblage qui empêche la production des lncRNA sélectionnés en supprimant une partie de leurs instructions de construction dans l’ADN.

Ils ont appliqué leur système de criblage à deux lignées cellulaires NSCLC dérivées de patients et ont examiné comment l’inhibition des lncRNA sélectionnés affectait les soi-disant « caractéristiques » des cellules cancéreuses. Les caractéristiques sont des comportements cellulaires qui contribuent à la progression de la maladie : prolifération, formation de métastases et résistance au traitement. “L’avantage d’évaluer trois caractéristiques différentes du cancer est que nous avons une vue d’ensemble, mais également des quantités substantielles de données provenant de différentes expériences, à partir desquelles nous devions dériver une seule liste de longs ARN non codants qui sont importants pour le cancer du poumon non à petites cellules. “, déclare Rory Johnson, professeur assistant à l’Université de Berne, qui a dirigé le projet financé par le NCCR RNA & Disease. L’analyse a finalement abouti à une liste de 80 ARNlnc candidats de haute confiance importants pour le NSCLC sur les plus de 800 étudiés. Parmi ces 80, les chercheurs ont sélectionné plusieurs ARNlnc pour des expériences de suivi.

Pour ces expériences de suivi, une approche a été utilisée, qui ne fonctionne pas au niveau de l’ADN mais cible les lncARN après leur production. Pour cela, les chercheurs ont utilisé de petits ARN synthétisés chimiquement appelés Antisens Oligonucleotides (ASOs), qui se lient aux lncRNAs qu’ils ciblent et conduisent à leur dégradation. Il convient de noter que plusieurs ASO sont approuvés pour le traitement de maladies humaines, mais aucun pour le moment pour le cancer.

Ces expériences de suivi ont montré que, pour la majorité des ARNl sélectionnés, leur destruction par un ASO inhibait la division des cellules cancéreuses en culture cellulaire. Fait important, le même traitement a produit peu ou pas d’effet sur les cellules pulmonaires non cancéreuses, qui ne devraient pas être lésées par le traitement du cancer. Dans un modèle tridimensionnel de NSCLC, qui ressemble plus à la tumeur qu’à la culture cellulaire, l’inhibition d’un seul lncRNA avec un ASO a réduit la croissance tumorale de plus de moitié. “Nous avons été positivement surpris de voir à quel point les oligonucléotides antisens pouvaient freiner la croissance tumorale dans différents modèles”, déclare Taisia ​​Polidori, co-première auteure, qui a travaillé sur le projet dans le cadre de sa thèse de doctorat à l’Université de Berne.

Les chercheurs poursuivent leurs recherches sur des modèles précliniques de cancer et envisagent de collaborer avec des entreprises existantes ou de créer une startup afin de développer un médicament pour soigner les patients. Concernant les autres cancers, Roberta Esposito, co-première auteure et post-doctorante à l’Université de Berne : “Comme un télescope qui peut être assez facilement repositionné pour étudier une autre partie de l’espace, notre approche devrait être facilement adaptable pour révéler de nouveaux types de traitement potentiels pour d’autres types de cancer.” Le Dr Esposito va maintenant utiliser le « télescope » pour identifier de nouvelles cibles pour le cancer colorectal. À cette fin, elle a reçu un financement de la Faculté de médecine de l’Université de Berne offert par la fondation Beactrice Ederer-Weber.