Des chercheurs de l’UCSD aident à développer des bactéries capables de détecter l’ADN tumoral

Des scientifiques de l’UC San Diego et des collègues australiens ont conçu des bactéries capables de détecter la présence d’ADN tumoral dans un organisme vivant, a-t-on annoncé jeudi.

L’innovation, publiée dans l’édition de jeudi de la revue Science, a détecté un cancer dans le côlon de souris et pourrait ouvrir la voie à de nouveaux biocapteurs capables d’identifier diverses infections, cancers et autres maladies, ont déclaré les chercheurs.

Les bactéries étaient auparavant conçues pour remplir diverses fonctions diagnostiques et thérapeutiques, mais n’avaient pas la capacité d’identifier des séquences d’ADN et des mutations spécifiques en dehors des cellules, ont-ils écrit. Le nouveau “Test cellulaire pour le transfert de gène horizontal ciblé CRISPR-discriminant”, ou “CATCH”, a été conçu pour faire exactement cela.

“Lorsque nous avons commencé ce projet il y a quatre ans, nous ne savions même pas si l’utilisation de bactéries comme capteur d’ADN de mammifère était même possible”, a déclaré le chef de l’équipe scientifique Jeff Hasty, professeur à l’UCSD School of Biological Sciences et Jacobs School of Ingénierie. “La détection des cancers gastro-intestinaux et des lésions précancéreuses est une opportunité clinique attrayante pour appliquer cette invention.”

Les tumeurs dispersent ou libèrent souvent leur ADN dans les environnements qui les entourent. Dans le cadre de la stratégie CATCH, les chercheurs ont conçu des bactéries pour tester des séquences d’ADN flottantes et comparer ces échantillons avec des séquences cancéreuses prédéterminées.

Ils ont commencé à formuler la possibilité de concevoir des bactéries, qui sont déjà répandues dans le côlon, comme de nouveaux biocapteurs qui pourraient être déployés à l’intérieur de l’intestin pour détecter l’ADN libéré par les tumeurs colorectales, ont écrit les chercheurs.

Selon l’UCSD, en collaboration avec leurs collègues australiens Susan Woods et Josephine Wright, les chercheurs ont conçu, construit et testé des bactéries comme capteur pour identifier l’ADN d’un gène muté dans de nombreux cancers. Ils ont programmé la bactérie avec un système conçu pour discriminer le mutant des copies normales du gène. Cela signifie que seules les bactéries qui avaient adopté des formes mutantes du gène, comme on en trouve dans les polypes et les cancers précancéreux, par exemple, survivraient pour signaler ou répondre à la maladie.

Les chercheurs adaptent maintenant leur stratégie de biocapteur de bactéries avec de nouveaux circuits et différents types de bactéries pour détecter et traiter les cancers et les infections humaines, selon un communiqué de l’université.

Alors que les chercheurs ont déclaré que l’invention nécessite un développement et un raffinement supplémentaires, l’équipe de biologie synthétique de l’UCSD continue d’optimiser la stratégie de biocapteur avancée.