Découverte du coronavirus du XVIe siècle en France

Dans une étude récente publiée dans le Journal international des maladies infectieuses, des chercheurs ont effectué des tests paléosérologiques sur des échantillons de pulpe dentaire de squelettes extraits de l’abbaye Saint-Pierre dans le village de Baume-Les-Messieurs en France. Ils ont découvert des preuves d’acides aminés d’un ancien bétacoronavirus du 16^e siècle.

Étude: Un ancien coronavirus de particuliers en France, vers le XVIe siècle. Crédit d’image : creativeneko/Shutterstock

Arrière-plan

Le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) qui a causé la pandémie de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) est le dernier de la lignée de plusieurs coronavirus qui ont déclenché des épidémies à divers moments et causé la mortalité, mais pas à l’échelle de mortalité associée à la COVID-19. Le coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV) et le coronavirus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS-CoV) sont survenus en 2002-2003 et 2012-2020, respectivement, faisant plus de 700 et 800 morts.

Des coronavirus ont été détectés dans des échantillons de culture cellulaire des voies respiratoires supérieures des années 1960, et plusieurs études ont découvert des coronavirus alpha et bêta associés à l’homme et des coronavirus associés à des animaux qui partagent un génome d’acide ribonucléique (ARN) similaire contenant des gènes pour coder la nucléocapside et la pointe protéines. Des anticorps anti-coronavirus ont également été détectés chez cinq soldats morts en France pendant la première guerre mondiale en 1914. Les squelettes exhumés de l’abbaye Saint-Pierre ont fourni une autre occasion de comprendre l’ancienneté des coronavirus humains (HCoV).

À propos de l’étude

Dans la présente étude, les chercheurs ont utilisé la pulpe dentaire des dents et des mandibules de 10 squelettes sur 12 trouvés sur le site de fouilles de Baume-Les-Messieurs. Les squelettes ont été identifiés comme étant des hommes âgés de 30 à 60 ans. La collecte, le stockage et la manipulation des échantillons de pulpe dentaire ont été effectués dans une installation qui n’avait pas auparavant travaillé avec des échantillons de SRAS-CoV, garantissant que les résultats étaient pas le résultat d’une contamination croisée.

Une datation au radiocarbone a également été effectuée sur les échantillons de dents des squelettes de deux individus. Les chercheurs se sont assurés que les mesures les plus strictes étaient suivies lors de la manipulation et du traitement des échantillons pour s’assurer que les échantillons anciens n’étaient pas contaminés par des matériaux provenant d’échantillons modernes. L’extraction des protéines a été réalisée pour des échantillons de pulpe dentaire regroupés de chaque individu afin d’obtenir une solution de paléosérum, qui a ensuite été utilisée pour un test de transfert afin de détecter des anticorps spécifiques à différents agents pathogènes.

Des lignées cellulaires telles que Vero E6, HCT-8 et MRCC-5 ont été inoculées avec les bétacoronavirus SARS-CoV-2 et HCoV-OC43 et l’alphacoronavirus (HCoV-229E) pour produire les antigènes spécifiques, qui ont ensuite été vérifiés par polymérase à transcription inverse -chaîne-réaction (RT-PCR) et Western immunoblot. Ces antigènes, ainsi que le lait écrémé comme témoin négatif et l’antigène de Staphylococcus aureus comme contrôle positif, ont été utilisés pour les tests de transfert. Les échantillons qui étaient séropositifs pour les anticorps contre les coronavirus ont été traités plus avant pour détecter d’anciens peptides à l’aide de la spectrométrie de masse et d’une approche métaprotéomique.

Résultats

Les résultats des analyses paléosérologiques et paléoprotéomiques ont révélé que les échantillons de pulpe dentaire prélevés sur deux des squelettes découverts à l’Abbaye Saint-Pierre contenaient trois séquences peptidiques comprenant au total 36 acides aminés indiquant la présence du coronavirus. De plus, les tests paléosérologiques ont également rapporté une réponse immunologique dans ces échantillons contre les antigènes de l’actuel SARS-CoV-2 et de l’alphacoronavirus HCoV-229E.

Ces personnes étaient d’environ le 16^e siècle, et l’analyse paléoanthropologique a suggéré qu’ils sont morts après l’âge de 30 ans. Les échantillons obtenus à partir des squelettes des huit autres individus n’ont pas été testés positifs pour les anticorps anti-coronavirus. Cependant, le manque de données pathologiques a rendu difficile de déterminer si le coronavirus avait causé une maladie grave ou une mortalité chez ces deux individus.

L’utilisation de pulpe dentaire, connue pour contenir des éléments sanguins conservés tels que des immunoglobulines et des peptides pathogènes, a permis la détection d’un ancien coronavirus qui n’a aucun représentant moderne connu et est très différent du SRAS-CoV-2 ou de l’un des autres. coronavirus humains modernes. En outre, l’analyse d’autres preuves fauniques du site de fouilles a indiqué que ces individus interagissaient étroitement avec des animaux tels que les porcs, les bovins, les cerfs, la volaille et les chiens, dont on pense qu’ils hébergent des coronavirus pouvant infecter les humains.

conclusion

Dans l’ensemble, les découvertes protéomiques et sérologiques de cette étude suggèrent que l’ancienneté des coronavirus humains s’étend encore sur trois siècles, avec des preuves paléoprotéomiques et archéozoologiques suggérant un ancien coronavirus zoonotique qui a infecté deux personnes qui étaient en contact étroit avec des mammifères et des volailles domestiques et sauvages.