2021-02-11 14:42:41
Aujourd’hui, sur le podcast, je vais vous raconter une histoire. Une histoire qui a donné lieu au titre de mon premier ouvrage de vulgarisation scientifique que j’ai publié, aux éditions Hélice, et qui, comme l’histoire, s’intitulait : les mille et une bases de ADN et d’autres tests scientifiques. Avec cette histoire, j’ai essayé d’expliquer l’idée derrière l’une des premières technologies de séquençage. ADN, inventé par le scientifique Frédéric Sanger, et qui lui a valu son deuxième prix Nobel de chimie, en 1980. Il avait reçu le premier en 1958 pour sa contribution à la détermination de la séquence d’acides aminés des protéines. Sanger était sans aucun doute fasciné par la séquence des composants des molécules les plus importantes de la vie. Sa méthode a été utilisée pour obtenir la séquence du premier génome humain, publiée en 2000.
Il ADN Il est constitué de quatre petites molécules (appelées bases du ADN) réunies formant deux longues chaînes, enroulées l’une sur l’autre formant une double hélice. Ces quatre petites molécules, appelées adénine, thymine, cytosine et guanine, sont représentées par les lettres A, T, G et C et ont la propriété que le A d’une chaîne se lie uniquement au T de l’autre, et le C à G. Ainsi, une chaîne de séquences ACTGGG est lié à une autre séquence TGACCC. Pour cette raison, on dit que les deux chaînes de ADN Ils ont des séquences complémentaires. Connaître la séquence de l’une des chaînes connaît immédiatement celle de l’autre. De plus, cette complémentarité est le secret de la reproduction moléculaire des ADN, puisque, à partir de la séquence d’une chaîne, la cellule (et aussi un scientifique dans un tube) peut faire celle de l’autre. Chaque chaîne sert ainsi de gabarit pour fabriquer une autre chaîne égale à sa complémentaire, et à partir d’une molécule de ADN De cette façon, nous en avons deux.
Jusqu’ici, tout va bien. Mais comment connaître la séquence de As, Tes, Ces et Ges ? Je vous invite à écouter, dans le podcast, l’histoire de la princesse Abdiena (également vous pouvez lire le texte intégral ici )
L’histoire explique le principe de la méthode inventée par le scientifique Fredeck Sanger et son équipe et qui leur a valu le prix Nobel. Profitant de la capacité de ADN Pour se copier, ils ont créé des fragments à partir d’un point de départ se terminant par une lettre spécifique, par exemple A, et ont mesuré leur longueur avec une méthode simple. Ils le font avec les quatre lettres, afin de savoir où ils se trouvent à partir du point initial, réalisant ainsi la séquence complète des lettres. De cette façon, et en utilisant cette méthode avec de nombreux fragments de ADN Contrairement au génome humain, les scientifiques ont pu obtenir la séquence de ses milliards de lettres. Un travail herculéen.
Il en est ainsi de la technologie de séquençage du ADN dans la décennie 1990-2000. Depuis, les technologies de nouvelle génération permettent de séquencer des génomes entiers en un peu plus d’une journée. Les détails techniques sont compliqués, mais l’idée est similaire à la copie d’un livre de centaines de pages en une heure. Comment pouvons-nous le faire? Et une seule personne ne le pourrait pas, mais si nous donnions un exemplaire de ce livre à des milliers et des milliers de personnes et demandions à chacun de choisir une phrase au hasard et de copier la fin de la phrase qui la précède, la phrase choisie et le début de la phrase qui la suit, dans quelques minutes nous aurons des milliers et des milliers de phrases copiées qui peuvent en fait représenter, au total, plusieurs exemplaires du livre. Si ces phrases sont analysées sur un ordinateur avec l’algorithme approprié, elles peuvent être classées dans le même ordre dans lequel elles apparaissent dans le livre simplement en vérifiant les fins et les débuts des phrases qui entourent les phrases complètes.
Quelque chose de similaire est fait avec le génome humain et d’autres espèces. Les premières copies sont réalisées puis découpées en milliers et milliers de morceaux qui sont lus en même temps. L’ordre des lettres est extrait de ces informations en les analysant par ordinateur. Aujourd’hui, nous disposons de la technologie nécessaire pour séquencer et analyser les génomes à des vitesses littéralement astronomiques. J’en ai parlé à plusieurs reprises dans les programmes Quilo précédents. Le développement de l’intelligence artificielle et de nouveaux algorithmes permettront, je crois, d’extraire des informations encore cachées dans le génome des espèces qui amélioreront notre compréhension de leur fonctionnement et des raisons pour lesquelles elles sont telles qu’elles sont chez chacune d’elles.
Les références:
Œuvres de Jorge Laborda.
Vos défenses contre le coronavirus
Vos défenses contre le coronavirus
Kilo de volume scientifique XII eBook
Kilo de volume scientifique XII Papier
Quilo de Ciencia Tome I. Jorge Laborda
Quilo de Ciencia Tome II. Jorge Laborda
Kilo de volume scientifique III. Jorge Laborda
Quilo de Ciencia Tome IV. Jorge Laborda
Quilo de Ciencia Tome V. Jorge Laborda
Quilo de Ciencia Tome VI. Jorge Laborda
Kilo de volume scientifique VII. Jorge Laborda
Kilo de volume scientifique VIII. Jorge Laborda
Quilo de Ciencia Tome IX. Jorge Laborda
Quilo de Ciencia Tome X. Jorge Laborda
Quilo de Ciencia Tome XI. Jorge Laborda
Circonstances enchaînées. Éd. Lulu
Circonstances enchaînées. amazone
Une Lune, une civilisation. Pourquoi la Lune nous dit que nous sommes seuls dans l’Univers
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