Dans une étude récente publiée dans Le microbe lancetteles chercheurs ont effectué une revue systématique pour évaluer l’association entre la composition du microbiote intestinal du nourrisson et les troubles respiratoires de l’enfant.
Arrière plan
Les troubles respiratoires de l’enfance tels que l’asthme et la respiration sifflante récurrente ont causé une mortalité et une morbidité considérables chez les enfants. Des études antérieures utilisant des modèles animaux ont rapporté le rôle du microbiote intestinal du nourrisson dans le développement immunologique pulmonaire et dans l’établissement de la vulnérabilité à l’asthme et aux infections respiratoires chez l’être humain.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont systématiquement passé en revue la littérature existante pour explorer l’association entre la composition du microbiome intestinal dans la petite enfance (moins d’un an) mesurée par séquençage génomique et le développement de troubles respiratoires chez l’enfant tels que les infections respiratoires, l’asthme ou la respiration sifflante récurrente.
L’examen systématique a été effectué conformément aux directives PRISMA (éléments de rapport préférés pour les examens systématiques et les méta-analyses). Les données ont été obtenues à partir de bases de données telles que Cochrane, MEDLINE, Web of Science, Scopus et Embase pour les articles en texte intégral en anglais publiés entre le 1er janvier 2010 et le 27 avril 2021, en utilisant des termes de recherche tels que intestin, petite enfance, maladie respiratoire et microbiote.
Pour des études de dans in vitro type, s’ils comprenaient des recherches non primaires ou si l’exposition du résultat n’était pas pertinente pour la question de recherche principale, ils ont été exclus de l’examen systématique. Deux examinateurs ont indépendamment examiné et évalué de manière critique les données, et les désaccords ont été résolus par un troisième examinateur. La qualité méthodologique de toutes les études a été évaluée, la liste de contrôle STROBE (renforcement de la déclaration des études observationnelles en épidémiologie) a été utilisée pour les données métagénomiques et la NOS (échelle de Newcastle-Ottawa) a été utilisée pour l’évaluation des biais.
Résultats
Au total, 7347 études ont été initialement identifiées à partir des bases de données et une étude potentiellement éligible a été identifiée à partir d’autres sources, dont 2589 articles en double ont été exclus. Sur les 4759 titres et résumés restants examinés, 4648 ont été exclus sur la base des critères d’éligibilité. En conséquence, le texte intégral de 111 études a été évalué et 100 études ont été exclues.
Les raisons de l’exclusion étaient : (i) il ne s’agissait pas de recherches originales ou évaluées par des pairs (n = 42), (ii) in vitro études (n = 7), (iii) le microbiome intestinal de l’enfant n’était pas l’exposition (n = 17), (iv) le résultat n’était pas une maladie respiratoire (n = 17), (v) le microbiome intestinal n’a pas été évalué avant les maladies respiratoires ‘ (n = 7), (vi) le microbiome intestinal a été évalué pour la première fois après l’âge d’un an (n = 2), (vii) le microbiome n’a pas été évalué par séquençage de nouvelle génération ou (viii) un petit sous-ensemble de patients (n = 5 ), taille de l’échantillon inférieure à cinq participants (n=3).
Enfin, 11 études ont été prises en compte pour l’examen systématique comprenant des études de cohorte (n = 8) et des études cas-témoins (n = 3) et la taille médiane de l’échantillon parmi les études comprenait 319 personnes. Le séquençage de l’amplicon ciblant l’acide ribonucléique ribosomal (ARNr) 16S a été réalisé dans toutes les études pour déterminer le microbiome intestinal. Quatre études, une étude et six études étaient respectivement de mauvaise qualité, de qualité moyenne et de bonne qualité.
Deux études (sur sept) ont rapporté qu’une plus grande diversité α intestinale du microbiote au cours des 12 premiers mois était significativement associée à l’absence de respiration sifflante atopique à l’âge d’un an et à l’absence d’asthme à l’âge de cinq à six ans. Une étude a rapporté une association positive entre la maturité du microbiome intestinal à l’âge de cinq semaines et le risque d’asthme chez les enfants âgés de six à onze ans. En revanche, deux des études incluses ont rapporté qu’un microbiome intestinal immature à l’âge d’un an était associé à un risque d’asthme plus élevé à l’âge de cinq à six ans.
De plus, une association a été observée entre la plus faible Lachnospire abondance à l’âge de trois mois mais plus grande Lachnospire abondance à un an et respiration sifflante atopique et asthme entre un et six ans. Une étude a montré des associations similaires pour Veillonella espèce alors que deux études ont rapporté le contraire.
Une association a été observée entre une plus grande abondance de Rhodotorule et Candidose et plus bas Malassezia abondance à un mois et plus Pichia kudriavzevii abondance à l’âge de trois mois et respiration sifflante atopique et asthme à l’âge de quatre à cinq ans. Cependant, une autre étude n’a trouvé aucune telle association. Une étude a démontré une incidence plus élevée de troubles pulmonaires à l’âge d’un an en cas de Bifidobactérie abondance et plus Entérocoque et Klebsiella abondance à une semaine d’âge.
Les résultats de l’étude étaient hétérogènes ; cependant, dans l’ensemble, une plus faible abondance de Bifidobactérie espèces dans les échantillons de selles obtenus à l’âge de un mois à trois mois et une abondance plus faible de Faecalibactérie, Roseburiaet Ruminocoque espèces dans les échantillons de selles obtenus à l’âge de trois mois à un an étaient associées à une respiration sifflante atopique et à l’asthme à l’âge de un an à six ans.
Dans l’ensemble, les résultats de l’étude ont démontré une association entre une faible diversité α et l’abondance d’un microbiote intestinal spécifique (Faecalibactérie, Bifidobactérie, Roseburia et Ruminocoque) avec des maladies respiratoires dans l’enfance. Cependant, les résultats étaient incohérents et d’autres recherches avec des populations d’échantillons plus importantes et des résultats standardisés et uniformes, des périodes de suivi et des outils d’analyse sont justifiées pour identifier les cibles pour prévenir les maladies respiratoires de l’enfance.
