Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur de préimpression, les chercheurs ont décrit des statistiques d’analyse arborescentes pour la longue maladie à coronavirus pédiatrique 2019 (COVID-19).
Arrière plan
Les National Institutes of Health (NIH) ont lancé l’initiative Researching COVID to Enhance Recovery (RECOVER) en 2021 afin d’utiliser les données des dossiers de santé électroniques (DSE) pour déterminer et classer les patients ayant des séquelles post-aiguës de COVID-19 (PASC), tel que décrit par le NIH comme une incapacité à se remettre d’une infection par le SRAS-CoV-2 ou d’une symptomatologie persistante pendant plus de 30 jours.
Selon la littérature, le PASC a été prédit chez les patients atteints de COVID-19 et son origine, ses facteurs de risque et ses résultats ont été décrits. Jusqu’à présent, seules quelques études ont décrit avec précision le PASC chez les enfants.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs visaient à découvrir les signaux PASC en utilisant l’exploration de données au lieu de l’expérience clinique.
Deux comparaisons dominaient les analyses présentées. Les cas de PASC ont été comparés aux patients infectés et non infectés par le coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2). Les preuves PASC comprenaient un code de diagnostic U09.9, un terme de terminologie d’interface DSE (IMO) contenant soit les chaînes (« post » et « aiguë » et « covid »), soit un code de diagnostic B94.8.
Les patients infectés avaient une réaction en chaîne par polymérase (PCR), un antigène ou un test sérologique positif pour le SRAS-COV-2. Les tests sérologiques pour l’infection comprenaient l’immunoglobuline (Ig)-M, les anticorps IgG anti-nucléocapside (N), les anticorps IgG anti-spike (S) ou de domaine de liaison au récepteur (RBD) et les anticorps indifférenciés IgA et IgG. Les patients atteints de COVID-19 à l’hôpital ou au service des urgences (ED) ont également été classés comme infectés par le SRAS-CoV-2.
Au cours de la période d’observation de l’étude, les tests de dépistage du virus étaient encore couramment effectués dans les établissements de santé. Les patients ont été considérés comme non infectés par le SRAS-CoV-2 si (1) tous les tests de diagnostic tels qu’un antigène, la PCR et la sérologie étaient négatifs pendant la période d’étude, et (2) le patient n’avait aucun code de diagnostic indiquant COVID-19, inflammatoire multisystémique syndrome de l’enfant (MIS-C) ou PASC.
La date d’entrée de la cohorte pour les infections PASC incidentes était la même que celle de l’antigène positif initial ou du test PCR, quatre semaines avant le test sérologique positif initial, ou quatre semaines avant le diagnostic PASC initial en l’absence de test de confirmation.
La date d’entrée des patients positifs au COVID-19 non PASC était basée sur le premier diagnostic ou la première rencontre avec le COVID-19. Pour les patients non infectés par le SRAS-CoV-2, des tests négatifs aléatoires ont été notés comme dates d’entrée dans la cohorte. A l’entrée de la cohorte, tous les patients cas et témoins étaient âgés de plus de 21 ans. Pour chaque code de diagnostic et chaque patient, l’équipe a construit un indicateur binaire pour la survenue d’un incident dans les 28 à 179 jours suivant l’admission de la cohorte.
L’équipe a utilisé le vocabulaire de la 10e révision de la Classification internationale des maladies (CIM-10) comme données d’entrée. La hiérarchie suivie comportait sept niveaux de nœuds correspondant à chaque niveau de l’arborescence. La hiérarchie était appelée alternativement un arbre tandis que le cluster contenant un nœud a avec ses descendants était appelé la branche d’un arbre ou une coupe.
Résultats
Au total, 13 750 patients ont été recrutés pour les trois cohortes entre le 1er mars 2020 et le 22 juin 2022, avec 1 250 cas d’infection PASC. Les garçons et les filles plus jeunes étaient moins susceptibles de faire partie de la cohorte PASC. La plupart des cohortes sont entrées à l’automne 2021.
De multiples indications statistiques sont apparues lors de la comparaison des personnes infectées par PASC et COVID-19. Au niveau le plus élevé de l’analyse arborescente, des réductions appréciables ont été notées avec les codes CIM-10 pour les signes, les symptômes et les résultats cliniques et de laboratoire qui n’étaient pas classés ailleurs, les maladies musculo-squelettiques et du tissu conjonctif, les troubles du système nerveux, les troubles respiratoires, les maladies mentales. et comportementales, les troubles nutritionnels, endocriniens et métaboliques, les maladies de l’appareil circulatoire, les variables ayant un impact sur l’état de santé et les services de santé, les maladies sous-cutanées et cutanées ; et les maladies du système digestif.
Au sein de la branche décrivant les signes et symptômes non catégorisés, les trois principales coupures correspondaient aux symptômes respiratoires et circulatoires, aux symptômes généraux et aux symptômes cognitifs, perceptuels, émotionnels et comportementaux.
Conclusion
Les résultats de l’étude ont montré plusieurs troubles et systèmes corporels liés au PASC. Étant donné que l’étude a utilisé des méthodes basées sur les données, l’équipe a identifié plusieurs maladies et symptômes nouveaux ou sous-déclarés.
Les chercheurs pensent qu’une approche plus axée sur les données pour la découverte des connaissances est nécessaire en raison de la nature en évolution rapide de la pandémie et du manque d’accord sur les symptômes précis qui caractérisent le PASC chez les enfants. Cette analyse complète des diagnostics dans une cohorte d’enfants atteints de PASC ajoute beaucoup aux connaissances de la communauté médicale sur les symptômes complexes de ce trouble.
Les résultats de l’étude peuvent guider la conception de futures études prospectives pour explorer plus en profondeur les modèles trouvés ici, améliorer la pratique thérapeutique et concentrer la recherche sur les fondements biochimiques du PASC.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
