Utilisation de l’épidémiologie basée sur les eaux usées pour surveiller le monkeypox

Monkeypox, un virus qui provoque des éruptions cutanées douloureuses et des symptômes pseudo-grippaux, se propage rapidement dans de nombreuses régions du monde, y compris aux États-Unis. Pour comprendre rapidement comment le virus se déplace dans les communautés, des chercheurs rapportent dans ACS ‘ Lettres sur la science et la technologie de l’environnement suggèrent de se tourner vers l’épidémiologie des eaux usées. Ils montrent comment la méthode – ; largement appliqué pour surveiller la transmission du SRAS-CoV-2 ; pourrait être optimisé pour le monkeypox, détectant potentiellement aussi peu que sept infections pour 100 000 personnes.

Comme le SRAS-CoV-2, le virus de la variole du singe peut être excrété par les personnes infectées par leurs excréments, leur urine et leur salive. Récemment, des chercheurs ont détecté son ADN dans les eaux usées à l’aide de tests de réaction en chaîne par polymérase (PCR). Cependant, la surveillance des flambées actuelles de monkeypox aux États-Unis avec une épidémiologie basée sur les eaux usées a été limitée, malgré son succès dans le suivi de la prévalence du SRAS-CoV-2 au niveau communautaire. Ainsi, Kyle Bibby et William Chen ont voulu évaluer la faisabilité de cette technique pour détecter l’ADN viral du monkeypox dans différents scénarios d’eaux usées.

Les chercheurs ont recueilli des informations provenant d’études scientifiques antérieures sur l’excrétion de l’ADN viral du monkeypox de la salive, des selles et de l’urine dans les eaux usées. Ils ont analysé ces données en combinaison avec l’utilisation quotidienne de l’eau par les gens, concluant que les personnes infectées peuvent éliminer quotidiennement de 13 000 à 208 milliards de copies du génome dans les égouts, la majeure partie de cette quantité provenant des selles. Ces résultats ont indiqué qu’un seul test PCR effectué au niveau de sensibilité le plus bas, soit 10 copies du génome par litre d’eaux usées, pourrait théoriquement détecter sept cas sur 100 000 personnes dans une usine de traitement des eaux usées américaine moyenne. De plus, des tests répétés pourraient probablement identifier des taux d’infection encore plus faibles.

Ensuite, l’équipe a développé une stratégie informatisée pour déterminer le nombre de tests PCR qui devraient être exécutés pour les échantillons d’eaux usées prélevés aux États-Unis et dans d’autres pays, en fonction des taux de cas attendus de monkeypox et du niveau de sensibilité souhaité. Pour les États-Unis, au taux de cas moyen au 15 juillet 2022, chaque échantillon aurait besoin de huit tests répétés utilisant un niveau de sensibilité modérément élevé pour détecter correctement la variole du singe dans les eaux usées, alors qu’à un taux de cas maximal suspecté (0,0012 %) seulement quatre répétitions à un niveau de sensibilité inférieur seraient nécessaires. Depuis la mi-juillet, les taux de cas ont probablement augmenté, de sorte que les chercheurs prédisent qu’un nombre inférieur de répliques pourrait être mis en œuvre aux États-Unis. leur modèle informatique peut encore être un cadre utile pour développer de solides programmes de surveillance communautaire.