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Des chercheurs du Wellcome Sanger Institute de Cambridge, au Royaume-Uni, utilisant une analyse complète des écrans CRISPR, des données multiomiques et des réseaux d’interactions protéine-protéine, ont identifié 370 cibles médicamenteuses prioritaires dans 27 types de cancer.
Leurs conclusions, publiées dans Cellule cancéreuseont le potentiel de doubler au moins la proportion de patients pouvant être éligibles à une thérapie génique ciblée.
Le premier auteur, Clare Pacini, et ses collègues expliquent qu’à l’heure actuelle, seuls 14 % des patients atteints de cancer sont éligibles à un traitement avec une thérapie ciblée sur le génome approuvée. Cependant, ils ont estimé que 60 % des individus d’une cohorte de près de 7 000 patients atteints de 20 types de cancer différents présentaient au moins un marqueur associé à une cible prioritaire issue de leur analyse. Pour les cibles disposant déjà d’un médicament approuvé ou préclinique, la proportion était de 32 %.
Dans l’étude la plus complète du genre, le Wellcome Sanger Institute, Open Targets (une collaboration public-privé travaillant à l’amélioration de la découverte de médicaments) et d’autres collaborateurs ont réalisé des criblages CRISPR-Cas9 ciblant 17 647 gènes dans 930 lignées de cellules cancéreuses dérivées de 27 cancers. les types.
Ils ont ensuite utilisé des données multiomiques pour analyser les relations entre les biomarqueurs moléculaires et les dépendances au cancer, c’est-à-dire les faiblesses des différents types de cancer sur lesquelles les cellules cancéreuses comptent pour survivre. Enfin, ils ont examiné les interactions protéine-protéine pour explorer comment les paires de marqueurs de dépendance s’intègrent dans les réseaux connus d’interactions moléculaires au sein des cellules, fournissant ainsi des indices sur la manière dont la biologie cellulaire est perturbée par le cancer et sur les cibles susceptibles de donner lieu aux thérapies les plus efficaces.
Cela a abouti à 370 candidats médicaments anticancéreux prioritaires uniques pour les 27 types de cancer, dont 302 étaient spécifiques à un type de cancer.
Les travaux permettent de mieux comprendre quels types de cancer peuvent éventuellement être traités par les stratégies existantes de découverte de médicaments et d’identifier les domaines dans lesquels des approches nouvelles et innovantes sont nécessaires. Ceci est particulièrement important lorsque le développement de médicaments est connu pour ses coûts élevés et sa faible efficacité, avec des taux d’échec d’environ 90 %.
Pacini et autres écrivent que leur étude « met en valeur la valeur des ensembles de données multiomiques et fournit de nouvelles informations sur le paysage des dépendances au cancer ».
Ils poursuivent : « Grâce à une approche rigoureuse basée sur les données, nous intégrons une richesse sans précédent de données génomiques, expérimentales et cliniques pour désigner des cibles candidates en oncologie pour un examen plus approfondi afin d’atteindre l’objectif ultime de permettre des traitements personnalisés pour les patients en fonction de leur profil moléculaire tumoral. .»
Le Dr Francesco Iorio, co-auteur principal de l’étude du Centre de recherche en biologie computationnelle de Human Technopole, a déclaré : « En analysant le plus grand ensemble de données jamais réalisé sur la dépendance au cancer, nous présentons la carte la plus complète à ce jour des vulnérabilités des cancers humains – leur « talon d’Achille ». ‘. Nous identifions une nouvelle liste de cibles prioritaires pour des traitements potentiels, ainsi que des indices sur les patients qui pourraient en bénéficier le plus – le tout rendu possible grâce à la conception et à l’utilisation de méthodologies informatiques et d’intelligence artificielle innovantes.
Commentant les résultats, le Dr Marianne Baker, responsable de l’engagement scientifique chez Cancer Research UK, a ajouté : « Deux personnes peuvent avoir le même type de cancer, mais leurs maladies peuvent se comporter différemment. C’est pourquoi nous avons besoin d’une médecine de précision. Ce travail ambitieux est un exemple convaincant de recherche qui éclaire dès le départ la découverte de médicaments, ouvrant la voie à des thérapies de précision plus efficaces contre le cancer. Donner aux gens des traitements pour leur cancer unique peut améliorer les chances de succès et aider davantage de personnes touchées par le cancer à vivre plus longtemps et mieux.
2024-01-17 22:15:24
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