Afin d’assurer une alerte précoce et de mieux comprendre et suivre les variantes virales et leurs modifications et caractéristiques génétiques spécifiques, l’OMS a mis en place un forum intégratif et un cadre mondial de surveillance des risques basés sur une approche multidisciplinaire qui utilise des données in silico, virologiques, cliniques et épidémiologiques. .
Étant donné que tous les agents pathogènes respiratoires mortels n’entraînent pas de pandémies et que le fardeau et la mortalité liés à la pneumonie restent à un niveau inacceptable, les informations tirées de la COVID-19 soulignent la nécessité d’une surveillance améliorée et intégrée des maladies pour les principales causes de mortalité liée à la pneumonie dans le monde. , y compris Streptococcus pneumoniae et le virus respiratoire syncytial. La surveillance intégrée qui intègre les tests des patients, le séquençage génomique des agents pathogènes, la sérosurveillance de la population et le suivi de la mortalité est essentielle pour la préparation aux épidémies et devrait devenir une routine, y compris pour les agents pathogènes les plus courants à l’origine de la pneumonie.
L’utilisation de la surveillance génomique pourrait également être étendue plus largement aux agents pathogènes respiratoires infectieux, y compris ceux pour lesquels la fuite vaccinale représente un risque considérable.
L’application de la génomique à S pneumoniae la surveillance a été cruciale dans l’identification du remplacement du sérotype pneumococcique causé par des événements de recombinaison homologue dans les gènes du locus capsulaire qui peuvent permettre l’émergence de sérotypes qui ne peuvent pas être prévenus par les vaccins conjugués antipneumococciques existants.
Ces types de données, en particulier lorsqu’elles sont liées à des systèmes de mesure de l’efficacité des vaccins, sont essentielles pour éclairer les décisions politiques liées aux vaccins.
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La séroépidémiologie a donc considérablement amélioré notre compréhension de l’épidémie de COVID-19 dans le contexte africain. En ce qui concerne les autres agents pathogènes, l’évaluation longitudinale des anticorps spécifiques du sérotype capsulaire du pneumocoque a été utilisée pour détecter le portage pneumococcique spécifique du sérotype et pour dériver des corrélats de protection pour chaque sérotype, et, de même, la sérosurveillance longitudinale des anticorps capsulaires Vi a été utilisée pour estimer exposition à la fièvre typhoïde.
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Pour lutter contre la mortalité liée à la pneumonie, les agents pathogènes de la pneumonie considérés comme courants ou habituels nécessiteront une surveillance renforcée et intégrée, y compris la sérosurveillance sentinelle, la surveillance de la mortalité et la surveillance génomique. Le même sentiment d’urgence devrait être apporté aux agents pathogènes respiratoires autres que le SRAS-CoV-2, en particulier pour les enfants vivant dans les pays à faible revenu et à revenu intermédiaire. À leur tour, les plateformes de surveillance peuvent ensuite être exploitées pour une meilleure préparation à la pandémie. L’amélioration des capacités mondiales de séquençage, le ciblage d’une couverture accrue, en particulier sur les angles morts géographiques et démographiques, et l’établissement d’un consensus en faveur d’une surveillance intégrée et coordonnée sont essentiels pour garantir que nous sommes préparés à la pandémie actuelle et en évolution de COVID-19, à tout futur virus respiratoire de pandémie potentiel, et, peut-être le plus important, pour nos épidémies respiratoires mortelles en cours.
