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Répartition spatio-temporelle des incidences des maladies sensibles au climat en Éthiopie : une analyse rétrospective longitudinale du paludisme, de la méningite, du choléra, de la dysenterie, de la leishmaniose et de la dengue entre 2010 et 2022/2023 | Santé publique BMC

Répartition spatio-temporelle des incidences des maladies sensibles au climat en Éthiopie : une analyse rétrospective longitudinale du paludisme, de la méningite, du choléra, de la dysenterie, de la leishmaniose et de la dengue entre 2010 et 2022/2023 |  Santé publique BMC

Considérations éthiques

L’approbation de la recherche a été accordée par le comité d’examen éthique du Jimma Institute of Technology, sous le numéro de référence RPD/JIT/172/15.

La source de données

La principale source de l’étude était une source de données secondaires collectées auprès de l’Institut éthiopien de santé publique (EPHI) : gestion des urgences de santé publique (PHEM) et ministère de la Santé (MoH). L’ensemble de données EPHI contient quatre maladies, dont le paludisme, la méningite, la dysenterie et le choléra/diarrhée aqueuse aiguë (AWD). L’ensemble de données couvre les incidences de maladies dans 12 régions d’Éthiopie, englobant l’Oromia, la région des nations, nationalités et peuples du Sud (SNNPR : qui est maintenant divisée en région sud, région sud-ouest et région centrale de l’Éthiopie), Amhara, Somali, Addis-Abeba, Tigré. , Afar, Benishangul Gumuz, Gambella, Sidama, Dire Dawa et Harari. L’ensemble de données sur l’incidence de la maladie comprenait des attributs tels que le nom de la région, le nom de la zone, le nom du Woreda, l’année, la semaine épidémique, le mois, le total du paludisme confirmé et clinique, le total des cas de paludisme ambulatoires, le total des cas de paludisme hospitalisés, le total des décès de patients hospitalisés pour le paludisme, le total des cas de fièvre suspectée de paludisme examinés, tests de diagnostic rapide (TDR) post-paludisme ou cas ambulatoires de plasmodium falciparum (PF) en microscopie, tests de diagnostic rapide post-paludisme ou cas ambulatoires de plasmodium vivax (PV) en microscopie, cas totaux de méningite, cas ambulatoires de méningite, cas de méningite hospitalisée, décès de patients hospitalisés par méningite, dysenterie nombre total de cas, cas de dysenterie ambulatoire, cas de dysenterie hospitalisés, décès de patients hospitalisés pour dysenterie, cas de choléra/AWD, décès de choléra/AWD. Les données sur la dengue et la leishmaniose couvrant la période 2018 à 2023 ont été collectées auprès du ministère de la Santé. L’ensemble de données couvre l’incidence de la maladie dans trois régions d’Éthiopie, à savoir l’Amhara, la Somalie et Dire Dawa. L’ensemble de données comprend six attributs, notamment la religion, la maladie, la zone, l’année, le mois et les valeurs totales.

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Cadre et conception de l’étude

Utilisant une conception rétrospective longitudinale, cette étude examine la prévalence et la diffusion d’une gamme de maladies, notamment le paludisme, la méningite, le choléra, la dysenterie, la leishmaniose et la dengue, dans diverses régions éthiopiennes, intégrant l’analyse longitudinale à la cartographie géospatiale et à l’évaluation des tendances temporelles. l’enquête synthétise les données épidémiologiques pour révéler des modèles complexes.

Prétraitement et analyse des données

Le prétraitement des données, l’inspection visuelle et l’analyse des ensembles de données sur l’incidence des maladies ont été réalisés à l’aide de Python. Une analyse des valeurs manquantes, des valeurs aberrantes et des données bruitées a été réalisée. La qualité des données sur l’incidence de la maladie a été examinée à l’aide de l’examen de la qualité des données de l’OMS. [22]. L’ensemble de données sur l’incidence de la maladie a été examiné pour en vérifier l’exhaustivité, l’actualité, la cohérence, l’exactitude et la validité.

Un traitement plus approfondi a été effectué sur les colonnes des ensembles de données sur l’incidence de la maladie de l’EPHI, y compris le total des cas de paludisme confirmés et cliniques, le total des cas de paludisme ambulatoires, le total des cas de paludisme hospitalisés, le total des décès de patients hospitalisés pour le paludisme, le total des fièvres suspectées de paludisme examinées, les TDR post-paludisme ou les cas ambulatoires de PF en microscopie, les colonnes post-paludisme. tests de diagnostic rapide du paludisme ou microscopie PV cas ambulatoires, cas totaux de méningite, cas ambulatoires, cas hospitaliers, décès de patients hospitalisés, cas totaux de dysenterie, cas ambulatoires de dysenterie, cas hospitaliers de dysenterie, décès de patients hospitalisés pour dysenterie, cas de choléra/AWD, décès choléra/AWD étaient ultérieurement traité. De plus, les incidences de maladies présentant des valeurs nulles ont été éliminées de l’ensemble de données. Alors que soixante-quinze attributs ont été observés dans l’ensemble de données initial sur l’incidence de la dengue et de la leishmaniose du ministère de la Santé, et six attributs subsistent après le prétraitement.

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L’ensemble de données final sur l’incidence de la maladie utilisé pour l’analyse comprenait les noms de la région, le nom de la zone, le nom du Woreda, l’année, la semaine épidémique, le mois, la semaine épidémique, la maladie, la catégorie, le type et la valeur totale. Ensuite, l’apparition et la propagation de chaque maladie dans différentes régions d’Éthiopie ont été examinées. En outre, la cartographie spatiale et l’analyse de séries chronologiques ont été utilisées pour identifier les points chauds, les tendances et les variations saisonnières de l’incidence de la maladie. Les ensembles de données des deux sources, telles que EPHI et MoH, ont été intégrés après le prétraitement des données sur la base des attributs religion, maladie, zone, année, mois et valeurs totales.

2024-03-04 23:05:03
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