Une équipe dirigée par un chercheur d’origine indienne a découvert une vulnérabilité clé dans toutes les principales variantes du SRAS-CoV-2, le virus qui cause le Covid-19, y compris les sous-variantes BA.1 et BA.2 omicron récemment apparues.
La faiblesse peut être ciblée par des anticorps neutralisants, ouvrant potentiellement la voie à des traitements qui seraient universellement efficaces sur toutes les variantes, ont déclaré les chercheurs.
L’étude, publiée jeudi dans la revue Nature Communications, a utilisé la cryo-microscopie électronique (cryo-EM) pour révéler la structure au niveau atomique de la tache vulnérable sur la protéine de pointe du virus, connue sous le nom d’épitope – ou partie à laquelle un l’anticorps se fixe.
La protéine Spike est utilisée par le virus SARS-CoV-2 pour pénétrer et infecter les cellules humaines. Les chercheurs ont également décrit un fragment d’anticorps appelé VH Ab6 qui est capable de se fixer à ce site et de neutraliser chaque variante majeure.
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“Il s’agit d’un virus hautement adaptable qui a évolué pour échapper à la plupart des traitements par anticorps existants, ainsi qu’à une grande partie de l’immunité conférée par les vaccins et les infections naturelles”, a déclaré Sriram Subramaniam, professeur à l’Université de la Colombie-Britannique et auteur principal de l’étude. .
“Cette étude révèle un point faible qui est en grande partie inchangé d’une variante à l’autre et peut être neutralisé par un fragment d’anticorps. Elle ouvre la voie à la conception de traitements pan-variants qui pourraient potentiellement aider de nombreuses personnes vulnérables”, a déclaré Subramaniam.
Les anticorps sont produits naturellement par notre corps pour combattre les infections, mais peuvent également être fabriqués en laboratoire et administrés aux patients en tant que traitement.
Alors que plusieurs traitements par anticorps ont été développés pour Covid-19, leur efficacité a diminué face à des variantes hautement mutées comme Omicron.
“Les anticorps se fixent à un virus d’une manière très spécifique, comme une clé entrant dans une serrure. Mais lorsque le virus mute, la clé ne rentre plus”, a déclaré Subramaniam.
“Nous recherchions des clés maîtresses – des anticorps qui continuent de neutraliser le virus même après de nombreuses mutations”, a-t-il ajouté.
La « clé maîtresse » identifiée par les chercheurs est le fragment d’anticorps VH Ab6, qui s’est avéré efficace contre les variantes Alpha, Beta, Gamma, Delta, Kappa, Epsilon et Omicron.
Le fragment neutralise le SRAS-CoV-2 en se fixant à l’épitope sur la protéine de pointe et en empêchant le virus de pénétrer dans les cellules humaines.
En cartographiant la structure moléculaire de chaque protéine de pointe, l’équipe a recherché des zones de vulnérabilité qui pourraient éclairer de nouveaux traitements.
“L’épitope que nous décrivons dans cet article est principalement retiré des points chauds pour les mutations, c’est pourquoi ses capacités sont préservées à travers les variantes”, a déclaré Subramaniam.
“Maintenant que nous avons décrit la structure de ce site en détail, il ouvre un tout nouveau domaine de possibilités de traitement”, a-t-il déclaré.
Subramaniam a déclaré que cette vulnérabilité clé peut désormais être exploitée par les fabricants de médicaments, et parce que le site est relativement exempt de mutations, les traitements résultants pourraient être efficaces contre les variantes existantes, et même futures.
