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Les bactéries sont vaccinées contre les virus et les virus sont vaccinés contre d’autres virus.

Les bactéries sont vaccinées contre les virus et les virus sont vaccinés contre d’autres virus.

Dans un combat entre bactéries et virus, sur qui faut-il parier ? Le résultat dépendra de l’arsenal de guerre que chacun possède à chaque instant.

Et c’est que, alors que l’être humain présente un nombre constant de gènes dans son génome tout au long de sa vie, chez les bactéries, c’est très différent. Il existe des bactéries fabriquées avec des gènes exclusifs, dont certains sont de véritables armes de guerre. Parfois, l’une de ces armes leur permet de “s’inoculer” contre les virus qui les attaquent et ainsi de s’immuniser contre leurs attaques.

De leur côté, les virus peuvent transporter d’autres dispositifs de guerre différents, certains conçus pour empêcher les vaccins bactériens de remplir leur mission.

Quelles sont les armes des bactéries ?

Les bactéries sont attaquées par des virus spécifiques appelés bactériophages (mangeurs de bactéries). Les bactéries peuvent lutter contre ces virus de différentes manières. D’une part, ils peuvent marquer leur propre génome avec un motif caractéristique, de sorte qu’ils peuvent dire quand un génome inconnu entre. C’est ce qu’on appelle les systèmes de restriction-modification, présents dans plus de 80% des bactéries.

Une autre stratégie de défense trouvée chez les bactéries est le suicide altruiste ou l’infection avortée. Dans ce cas, la bactérie se tue, empêchant le virus de progresser davantage. Ces systèmes apparaissent chez moins de 20% des bactéries, et bien qu’ils ne sauveraient pas in fine l’individu, ils protégeraient la population.

Enfin, nous avons les systèmes de «vaccination» CRISPR-Cas, présents dans 40% des bactéries, très populaires ces derniers temps en raison de leur utilisation révolutionnaire en biotechnologie. Dans ce cas, lorsqu’un virus entre, le système découpe son génome et enregistre des fragments dans le génome de la bactérie. Ces fragments fonctionnent comme un vaccin, lui permettant de reconnaître et d’attaquer plus efficacement le même virus la prochaine fois qu’il le rencontrera.

Et quelles sont les armes des virus ?

Bien sûr, les virus se défendent toujours. Il existe des virus qui modifient leur génome pour tromper les systèmes de restriction-modification et les systèmes d’infection avortés. Il y a aussi ceux qui ont des armes telles que les gènes anti-CRISPR, qui interagissent avec les systèmes CRISPR-Cas pour empêcher leur fonctionnement. De cette façon, ils empêchent le vaccin de les arrêter.

De plus, il y a une autre bataille entre “frères”: les virus se battent également contre d’autres virus. Par exemple, il existe des virus défectueux ou défectueux appelés satellites, qui manquent de gènes pour fabriquer l’enveloppe de leur génome ou capside. Cette capside leur permet de voyager pour trouver de nouvelles bactéries à infecter. Le manque d’enveloppe de ces virus satellites est résolu en profitant de l’enveloppe produite par d’autres virus appelés auxiliaires, qu’ils parasitent. Ils lui ont donné un tel visage que, souvent, le petit virus satellite modifie l’enveloppe de l’assistant, de sorte que seul son génome tient à l’intérieur et non celui de l’assistant lui-même. Eh bien, le virus auxiliaire ne reste pas toujours inactif : il a parfois recours à un système de vaccination CRISPR-Cas, qui reconnaît le virus satellite et l’empêche d’en profiter.

Comment se construit l’arsenal bactérien

La question clé est : qu’est-ce qui fait qu’une bactérie ou un virus possède ou non ces armes ? Cela dépend du reste du répertoire de gènes qu’il contient. Chez les soi-disant superbactéries, qui provoquent des infections intrahospitalières et sont super résistantes aux antibiotiques, comme Acinetobacter baumannii ou Pseudomonas aeruginosa, nous avons récemment découvert que celles qui acquièrent des systèmes CRISPR-Cas ont généralement des portes d’entrée à leur surface pour certains virus.

Si la bactérie possède une protéine unique à sa surface qui lui permet, par exemple, d’expulser plus efficacement un certain antibiotique, ce sera un avantage pour elle. Mais si cette protéine est à son tour une porte d’entrée pour un virus spécifique, la bactérie devra être protégée par un système de vaccination.

Qui gagne alors ?

Une fois vu que ni la bactérie ni le virus ne chôment, et évoluent constamment pour s’attaquer et se défendre, il devient plus difficile de parier sur un combat entre les deux. Je dirais donc que le plus grand bénéficiaire de ce combat serait le spectateur lui-même. Oui, oui, le lecteur, moi-même et le reste des êtres humains.

En observant les combats entre bactéries et virus, nous pouvons connaître tout l’arsenal d’armes des deux. Et cela nous permet de lutter plus efficacement contre les superbactéries.

Parce que les virus bactériens n’infectent pas les cellules humaines, ils ont longtemps été étudiés comme une alternative aux antibiotiques. En fait, dans les pays d’Europe de l’Est, ils sont utilisés depuis près d’un siècle dans ce qu’on appelle la phagothérapie. Ainsi, la baisse actuelle de l’efficacité des antibiotiques a fait de cette stratégie une alternative actuelle à prendre en compte, comme le décrit le livre The Perfect Predator, dans lequel un cas réel est raconté.

En conclusion, les batailles entre bactéries et virus sont un spectacle qui nous surprend toujours et dont la science est toujours prête à apprendre pour apporter des solutions aux grands problèmes de l’être humain.

Cet article a été publié dans ‘

La conversation‘.

Dans un combat entre bactéries et virus, sur qui faut-il parier ? Le résultat dépendra de l’arsenal de guerre que chacun possède à chaque instant.

Et c’est que, alors que l’être humain présente un nombre constant de gènes dans son génome tout au long de sa vie, chez les bactéries, c’est très différent. Il existe des bactéries fabriquées avec des gènes exclusifs, dont certains sont de véritables armes de guerre. Parfois, l’une de ces armes leur permet de “s’inoculer” contre les virus qui les attaquent et ainsi de s’immuniser contre leurs attaques.

De leur côté, les virus peuvent transporter d’autres dispositifs de guerre différents, certains conçus pour empêcher les vaccins bactériens de remplir leur mission.

Quelles sont les armes des bactéries ?

Les bactéries sont attaquées par des virus spécifiques appelés bactériophages (mangeurs de bactéries). Les bactéries peuvent lutter contre ces virus de différentes manières. D’une part, ils peuvent marquer leur propre génome avec un motif caractéristique, de sorte qu’ils peuvent dire quand un génome inconnu entre. C’est ce qu’on appelle les systèmes de restriction-modification, présents dans plus de 80% des bactéries.

Une autre stratégie de défense trouvée chez les bactéries est le suicide altruiste ou l’infection avortée. Dans ce cas, la bactérie se tue, empêchant le virus de progresser davantage. Ces systèmes apparaissent chez moins de 20% des bactéries, et bien qu’ils ne sauveraient pas in fine l’individu, ils protégeraient la population.

Enfin, nous avons les systèmes de «vaccination» CRISPR-Cas, présents dans 40% des bactéries, très populaires ces derniers temps en raison de leur utilisation révolutionnaire en biotechnologie. Dans ce cas, lorsqu’un virus entre, le système découpe son génome et enregistre des fragments dans le génome de la bactérie. Ces fragments fonctionnent comme un vaccin, lui permettant de reconnaître et d’attaquer plus efficacement le même virus la prochaine fois qu’il le rencontrera.

Et quelles sont les armes des virus ?

Bien sûr, les virus se défendent toujours. Il existe des virus qui modifient leur génome pour tromper les systèmes de restriction-modification et les systèmes d’infection avortés. Il y a aussi ceux qui ont des armes telles que les gènes anti-CRISPR, qui interagissent avec les systèmes CRISPR-Cas pour empêcher leur fonctionnement. De cette façon, ils empêchent le vaccin de les arrêter.

De plus, il y a une autre bataille entre “frères”: les virus se battent également contre d’autres virus. Par exemple, il existe des virus défectueux ou défectueux appelés satellites, qui manquent de gènes pour fabriquer l’enveloppe de leur génome ou capside. Cette capside leur permet de voyager pour trouver de nouvelles bactéries à infecter. Le manque d’enveloppe de ces virus satellites est résolu en profitant de l’enveloppe produite par d’autres virus appelés auxiliaires, qu’ils parasitent. Ils lui ont donné un tel visage que, souvent, le petit virus satellite modifie l’enveloppe de l’assistant, de sorte que seul son génome tient à l’intérieur et non celui de l’assistant lui-même. Eh bien, le virus auxiliaire ne reste pas toujours inactif : il a parfois recours à un système de vaccination CRISPR-Cas, qui reconnaît le virus satellite et l’empêche d’en profiter.

Comment se construit l’arsenal bactérien

La question clé est : qu’est-ce qui fait qu’une bactérie ou un virus possède ou non ces armes ? Cela dépend du reste du répertoire de gènes qu’il contient. Chez les soi-disant superbactéries, qui provoquent des infections intrahospitalières et sont super résistantes aux antibiotiques, comme Acinetobacter baumannii ou Pseudomonas aeruginosa, nous avons récemment découvert que celles qui acquièrent des systèmes CRISPR-Cas ont généralement des portes d’entrée à leur surface pour certains virus.

Si la bactérie possède une protéine unique à sa surface qui lui permet, par exemple, d’expulser plus efficacement un certain antibiotique, ce sera un avantage pour elle. Mais si cette protéine est à son tour une porte d’entrée pour un virus spécifique, la bactérie devra être protégée par un système de vaccination.

Qui gagne alors ?

Une fois vu que ni la bactérie ni le virus ne chôment, et évoluent constamment pour s’attaquer et se défendre, il devient plus difficile de parier sur un combat entre les deux. Je dirais donc que le plus grand bénéficiaire de ce combat serait le spectateur lui-même. Oui, oui, le lecteur, moi-même et le reste des êtres humains.

En observant les combats entre bactéries et virus, nous pouvons connaître tout l’arsenal d’armes des deux. Et cela nous permet de lutter plus efficacement contre les superbactéries.

Parce que les virus bactériens n’infectent pas les cellules humaines, ils ont longtemps été étudiés comme une alternative aux antibiotiques. En fait, dans les pays d’Europe de l’Est, ils sont utilisés depuis près d’un siècle dans ce qu’on appelle la phagothérapie. Ainsi, la baisse actuelle de l’efficacité des antibiotiques a fait de cette stratégie une alternative actuelle à prendre en compte, comme le décrit le livre The Perfect Predator, dans lequel un cas réel est raconté.

En conclusion, les batailles entre bactéries et virus sont un spectacle qui nous surprend toujours et dont la science est toujours prête à apprendre pour apporter des solutions aux grands problèmes de l’être humain.

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