Dans une récente lettre de recherche publiée dans la revue Maladies infectieuses émergentes, Les chercheurs utilisent la génomique pathogène de l’ADN ancien récupéré à partir de dents d’orangs-outans conservées dans des musées pour déterminer la cause de la mort jusqu’ici inexpliquée de plusieurs grands singes hébergés dans des zoos aux Pays-Bas en 1965. Le séquençage par fusil de chasse en tandem avec des ensembles d’appâts de capture par hybridation sensibles à un spectre d’agents viraux. Les génomes ont révélé que ces spécimens de musée étaient des orangs-outans de Sumatra (je mets abelii) est décédé des suites d’une infection par le virus de la variole du singe (MPXV).
Les résultats de l’étude fournissent de nouvelles informations sur la façon dont le MPXV s’est déplacé depuis son origine potentielle à Sumatra jusqu’au zoo de Rotterdam, où l’épidémie s’est produite. En outre, ces résultats mettent en évidence la capacité unique des techniques muséologiques modernes à identifier les agents pathogènes responsables d’événements épidémiologiques historiques et leurs voies de dispersion afin de mieux se préparer aux futurs événements zoonotiques et pandémiques.
Étude: Lien entre les génomes du virus de la variole du singe provenant de spécimens de musée et l’épidémie de zoo de 1965. Crédit d’image : junrong/Shutterstock.com
Qu’est-ce que MPXV ?
Le MPXV peut infecter un large éventail de mammifères, notamment les humains et les primates non humains. De plus, le MPXV est un virus à ADN double brin enveloppé appartenant à la Orthopoxvirus genre (famille Poxviridés) et est étroitement liée aux agents pathogènes de la variole (variole), de la variole et de la vaccine.
Découvert pour la première fois chez des singes de laboratoire au Danemark en 1958, le MPXV est endémique d’Afrique centrale, où de plus en plus de preuves de l’existence de réservoirs de petits mammifères ont été découvertes. Malgré plus de trois décennies de recherche dans le domaine, la prévalence du MPXV et d’autres maladies zoonotiques augmente dans le monde entier, la plus récente épidémie mondiale de MPXV de 2022-2023 représentant la pire de l’histoire enregistrée.
La génomique des agents pathogènes a le potentiel d’identifier le MPXV dans l’ADN conservé dans les musées, permettant ainsi aux chercheurs d’extrapoler leurs voies historiques de dispersion et de transmission. Bien que l’on suppose que l’origine du MPVX se trouve en Afrique centrale, le lien entre son origine en Afrique et sa découverte ultérieure en Europe reste flou.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont utilisé de l’ADN ancien extrait des dents de quatre échantillons d’orangs-outans conservés dans un musée (Pongo sp.) pour élucider la cause de leur décès. L’ADN ancien a ensuite été utilisé pour créer des bibliothèques génomiques des grands singes et de leur agent pathogène viral potentiel.
Des techniques ultérieures de séquençage au fusil de chasse, utilisées en tandem avec des ensembles d’appâts de capture par hybridation optimisés pour cibler un large spectre de génomes viraux, ont été utilisées pour identifier les relations entre l’agent pathogène responsable de la mort des échantillons actuels du musée et ceux isolés de mammifères morts précédents.
Résultats de l’étude
Les analyses génomiques ont révélé que deux des quatre échantillons inclus étaient je mets abelii (Orangs-outans de Sumatra). En combinaison avec des archives de musée faisant allusion aux spécimens provenant d’un zoo aux Pays-Bas en 1965, la présente étude a révélé que les génomes isolés du MPXV correspondaient étroitement à d’autres génomes de grands singes précédemment séquencés lors d’épidémies de primates non humains dans les années 1950 et 1960.
Les génomes viraux isolés des orangs-outans du musée appartenaient au clade IIa du MPXV et étaient presque identiques à un génome isolé de l’épidémie du zoo de Rotterdam en 1965. Bien que plus de 50 ans se soient écoulés depuis la mort de ces singes, ce qui représente une période de temps importante pour des virus à évolution rapide comme le MPVX, les seules différences génétiques observées entre les agents pathogènes actuels et ceux du zoo de Rotterdam étaient deux mutations.
D’autres comparaisons génomiques avec d’autres génomes de MPXV dérivés de grands singes précédemment séquencés révèlent que les orangs-outans de Sumatra, qui étaient déjà infectés par le MPXV depuis leur domaine vital, ont été capturés, transportés en Europe, puis vendus à des zoos et à d’autres programmes de captivité dans les années 1950 et 1960. . Compte tenu du taux rapide de transmission du MPXV entre primates, les singes étudiés dans la présente étude pourraient avoir été responsables, en partie, de l’épidémie du zoo de Rotterdam en 1965, au cours de laquelle six des dix grands singes hébergés sont morts d’une maladie. maladie virale jusqu’à présent non identifiée.
Nos travaux reliant l’infection par le MPXV de ces orangs-outans à une épidémie spécifique soulignent en outre l’importance des spécimens de musée pour l’étude de la diversité et de l’évolution du virus… Si les collections d’histoire naturelle ont régulièrement acquis des spécimens provenant de telles épidémies, ces spécimens pourraient représenter non seulement une un trésor de biodiversité mais aussi une source alternative d’échantillons pathologiques et de matériel génomique d’agents infectieux.
Référence du journal :
- Hämmerle, M., Rymbekova, A., Gelabert, P., et autres. (2024). Lien entre les génomes du virus de la variole du singe provenant de spécimens de musée et l’épidémie de zoo de 1965. Maladies infectieuses émergentes. est ce que je:10.3201/eid3004.231546
2024-03-13 05:54:00
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