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Détection rapide de champignons pathogènes dans la population côtière souffrant d’infections respiratoires grâce à la technologie des puces microfluidiques | Maladies infectieuses BMC

Détection rapide de champignons pathogènes dans la population côtière souffrant d’infections respiratoires grâce à la technologie des puces microfluidiques |  Maladies infectieuses BMC

Alors que la puce microfluidique a été utilisée pour la détection rapide des infections fongiques [12], le test d’échantillons cliniques spéciaux via des tests à haut débit reste un problème de goulot d’étranglement. Pour détecter les champignons de faible densité dans les fluides corporels, nous avons personnalisé le système de puce microfluidique qui permet la détection rapide de champignons pathogènes à large spectre, notamment C. albicans, C. tropicalis, C. glabrata, C. parapsilosis, C. krusei, C. auris, A. fumigatus, A. flavus, A. niger, C. neoformans, T. asahii, etc. Il est démontré que les champignons pathogènes détectés par la méthode de culture et la technologie des puces étaient principalement constitués de Candidas, mais le taux de détection de la technologie des puces microfluidiques était supérieure à celle de la méthode de culture (Fig. 1). Les résultats de détection moléculaire de Candidas à l’aide de la puce microfluidique ont été validés par qPCR en temps réel et ont montré un bon accord (Fig. 2). De plus, l’examen sanguin de routine implique que le nombre de plaquettes peut être réduit chez les patients atteints d’infections à Candida et même associé à la gravité de l’infection (Tableaux 2 et 3).

Les infections fongiques invasives sont les causes les plus fréquentes de mortalité élevée en soins intensifs, et un traitement antifongique rapide est un déterminant essentiel pour de bons résultats cliniques. [13]. Cependant, le traitement des infections fongiques est souvent retardé en raison de l’insensibilité et de la lenteur des étapes de culture microbienne. Par conséquent, le développement et la validation de diagnostics hors culture ciblant les champignons pathogènes sont de la plus haute priorité en médecine. Alors que la détection commerciale par PCR a été largement appliquée à l’examen fongique, l’utilisation de puces à ADN devient la méthode de choix pour profiler l’expression des gènes fongiques. [14, 15]. Les résultats de la culture microbienne n’ont montré que des infections fongiques chez 16 des 64 patients, dont une était négative par puce microfluidique et validation qPCR (Fig. 1 et 2 ; Tableau 1). En revanche, 36 cas de test Candida positif par puce microfluidique étaient cohérents avec la validation qPCR (Fig. 1 et 2; Tableau 1), ce qui suggère que la sensibilité et la précision de la technologie des puces microfluidiques pour la détection fongique sont supérieures à celles des méthodes de culture. De plus, la puce microfluidique peut détecter simultanément 20 espèces de champignons pathogènes, ce qui suggère qu’elle présente l’avantage d’une détection à haut débit par rapport aux méthodes PCR conventionnelles.

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Candida spp. C. albicans, en particulier, joue un rôle essentiel dans les infections fongiques invasives. Le développement de méthodes de diagnostic et de traitement augmente le risque d’infections à Candida [16,17,18], par exemple, l’utilisation d’antibiotiques à large spectre, d’immunosuppresseurs, de nutrition parentérale totale et de ventilation mécanique conduit à une dysbiose microbienne. Selon le bon sens, les infections par des micro-organismes pathogènes provoquent des changements dans les routines sanguines. Cependant, nous avons constaté que le nombre de globules blancs n’était pas significativement différent entre les patients infectés par Candida spp. et des contrôles fongiques négatifs (Tableau 2), probablement en raison d’infections bactériennes supplémentaires.

En tant qu’acteurs multiples de l’immunité innée, les plaquettes interagissent avec Candida spp. et peut contribuer à l’issue fatale des infections invasives à Candida [19, 20]. Une thrombocytopénie, un facteur de risque important d’infections fongiques, a également été observée chez les patients infectés par Candidas (Tableau 3). Il est suggéré que Candidas améliore l’adhérence plaquettaire [19]. Les plaquettes ne peuvent pas refléter directement les infections à Candida, mais peuvent favoriser la survie des Candidas invasifs présents dans le sang. [21]. Nous avons constaté que le nombre de plaquettes diminuait chez certains patients atteints d’infections à Candida dans les voies respiratoires (Tableau 3), ce qui concorde avec les rapports antérieurs de la littérature. [22, 23], ce qui suggère que Candida spp. peuvent également être présents dans leur sang et ainsi provoquer l’agrégation et la destruction des plaquettes. Le mécanisme par lequel les plaquettes adhèrent à Candidas dépend de l’espèce de Candidas. [20]. Une étude a montré que C. albicans était capable d’échapper à la destruction médiée par le complément sans adhérence plaquettaire et qu’il survivait ainsi dans le sang pendant la période d’infection. [24]. De plus, il a été démontré que la thrombocytopénie chez les patients co-infectés par C. albicans et d’autres Candidas était plus sévère que chez ceux infectés par C. albicans seul (Tableau 3). Ces résultats suggèrent que la numération plaquettaire peut être utilisée comme paramètre pour étudier la gravité des infections invasives à Candida. Cependant, le nombre de patients dans chaque groupe est faible. Par conséquent, les études futures devraient élargir la taille de l’échantillon pour observer et explorer la relation entre les plaquettes et les infections à Candida.

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2024-03-18 19:37:22
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