Les selles des bébés sont particulièrement riches en virus, comme le révèle une étude danoise qui a identifié plus de 10 000 virus appartenant au microbiote intestinal des nourrissons. La plupart de ces virus étaient jusqu’alors inconnus. Le microbiote intestinal, c’est-à-dire l’ensemble des bactéries, virus, parasites et champignons qui constituent notre système digestif, représente un vaste champ de recherche car il est complexe et influe sur notre santé. Les micro-organismes en association symbiotique avec notre corps jouent un rôle dans la digestion, le métabolisme ou notre système immunitaire. Les dérèglements du microbiote peuvent être responsables de maladies chroniques, auto-immunes ou neurologiques. Dans une étude publiée dans la revue Nature Microbiology, des chercheurs ont trouvé plus de 10 000 virus dans les selles de bébés danois, dont certains étaient encore inconnus.
Les chercheurs de l’hôpital universitaire de Copenhague ont étudié le virome, c’est-à-dire l’ensemble des virus, contenus dans la matière fécale de 647 enfants âgés de 1 an. Ils ont identifié 10 021 espèces virales appartenant à 248 groupes de virus, dont 232 étaient jusqu’alors inconnus. En comparant cette diversité virale à celle présente chez l’adulte, les chercheurs ont remarqué qu’environ 70% des espèces trouvées dans les intestins du nourrisson n’étaient pas présentes chez l’adulte. La plupart de ces virus, dont une majorité était inconnue, appartient à la classe des Caudoviricètes, qui font partie de l’ordre des Caudovirales. Ce sont des bactériophages à queue, qui n’infectent que des bactéries et peuvent jouer un rôle dans la composition bactérienne du microbiote intestinal, mais aussi provoquer des maladies.
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