Comment les éléments transposables de l’ADN peuvent affecter la gravité de la maladie après une infection virale

Un autre facteur important est la biologie moléculaire au sein de vos cellules. L’ADN se présente sous la forme d’un long brin en double hélice. Par conséquent, vous pourriez vous attendre à ce que la cellule lise toujours les informations génétiques dans l’ordre, en commençant par une extrémité et en allant à l’autre. Mais ce n’est pas le cas. L’ADN contient des éléments transposables, parfois appelés “ADN indésirable”, qui peuvent modifier les régions du génome qui sont lues à un moment donné.

Une équipe internationale dirigée par le Dr Guillaume Bourque a étudié le rôle de ces éléments transposables sur la sévérité de la maladie après une infection par le virus de la grippe A, comme cela a été publié dans Génomique cellulaire.

En examinant les données de 39 individus avant et après l’infection par le virus de la grippe A, les chercheurs ont pu identifier des changements dans l’accessibilité (c’est-à-dire la “lisibilité”) des éléments transposables. Pour ce faire, ils ont utilisé une approche combinant différents ensembles de données multiomiques, qui caractérisent et quantifient des collections de biomolécules dans des cellules ou des organismes. L’un était le transcriptome, qui se compose de toutes les copies d’ARN transcrites à partir de l’ADN dans la cellule. L’autre était l’épigénome, qui est l’ensemble des modifications chimiques de l’ADN qui modifient l’expression des gènes. Un avantage de cette approche multiomique est qu’ils ont pu identifier des familles d’éléments transposables avec des changements d’accessibilité, ce qui aurait probablement été manqué par les approches précédentes.

En considérant ces changements dans les éléments transposables après une infection virale, ils pourraient identifier plusieurs facteurs de transcription (protéines qui activent ou désactivent des gènes spécifiques) qui contribuent probablement à la réponse d’une personne à l’infection. Grâce à ces résultats, les chercheurs ont été en mesure de créer un modèle capable de prédire la charge virale d’un individu après une infection par la grippe A.

“Un certain nombre de questions demeurent, par exemple que le lien entre les éléments transposables et la charge virale soit réellement causal et que ces changements seraient cohérents dans le temps”, explique l’auteur principal, Xun Chen. “Mais ces découvertes sont une étape importante pour comprendre le rôle que ces facteurs jouent dans la variabilité de la gravité de la maladie chez les individus.”

Les auteurs de l’étude proviennent de l’Université de Kyoto au Japon, de l’Université McGill et de l’Université de Montréal au Canada et de l’Université de Chicago aux États-Unis.