Face à la menace croissante des superbactéries, des scientifiques explorent des sources inattendues pour découvrir de nouveaux antibiotiques. Des vestiges génétiques de Néandertaliens aux fossiles d’animaux disparus, en passant par la terre de nos jardins, l’espoir renaît dans des endroits insolites.

L’Urgence de la Découverte

L’antibiorésistance est un défi majeur de notre époque. L’antibiorésistance est l’un des plus grands défis auxquels nous sommes confrontés en tant que société, affirme César de la Fuente, bioingénieur à l’Université de Pennsylvanie, impliqué dans la découverte de la mammuthusine.

Sans de nouveaux médicaments, l’antibiorésistance pourrait causer environ 39 millions de décès d’ici 2050, selon une étude de l’année dernière.

Nouvelles Approches pour une Industrie en Crise

L’industrie pharmaceutique, confrontée à la capacité des bactéries à développer rapidement des défenses, adopte des approches novatrices. La plupart des antibiotiques actuels, qui ont sauvé des millions de vies, ont été découverts dans la nature, souvent par hasard. L’exemple le plus célèbre est la découverte de la pénicilline par Alexander fleming en 1928.

L’Intelligence Artificielle au Service de la Recherche

César de la Fuente mise sur l’intelligence artificielle pour relancer la découverte d’antibiotiques. Son équipe a développé des algorithmes d’apprentissage profond pour analyser d’immenses bases de données génétiques et identifier des peptides aux propriétés antibactériennes. cette méthode a permis d’explorer les venins d’animaux, le microbiome humain et les archées. Ils ont également exploré les codes génétiques de fossiles d’animaux et d’humains disparus, tels que les Néandertaliens et les Dénisoviens. Ce modèle d’apprentissage profond a ouvert une fenêtre sur le passé, explique de la Fuente.

Peptides : La Prochaine Révolution Médicale

Les antibiotiques actuels sont principalement des petites molécules, souvent dérivées de bactéries et de champignons.Les peptides, constitués de chaînes d’acides aminés, sont plus grands et complexes. Bien que traditionnellement moins stables et difficiles à administrer sous forme de pilules, des progrès récents ont amélioré leur absorption et leur utilisation par l’organisme.Les peptides sont la prochaine grande nouveauté en médecine, affirme de la Fuente, qui a lancé une startup pour explorer le potentiel antibiotique de la mammuthusine et d’autres peptides.

La Mammuthusine : Un Antibiotique Ressuscité du Passé

Parmi les centaines de peptides testés, la mammuthusine, identifiée dans le code génétique de *Mammuthus primigenius*, un mammouth disparu il y a environ 4 000 ans, s’est révélée prometteuse. Découverte grâce à l’exploration d’une base de données de séquençage d’ADN de fossiles,la mammuthusine s’est avérée aussi puissante que la polymyxine B,un antibiotique de dernier recours. Elle a efficacement éradiqué un type de bactérie désigné comme pathogène critique par l’Organisation Mondiale de la santé en raison de sa résistance aux antibiotiques courants.

Élargir l’Horizon Chimique

Le travail avec les espèces disparues élargit l’espace chimique que nous pourrions explorer, déclare James Collins, bioingénieur au Massachusetts Institute of Technology. Ce sont des molécules qui ont évolué dans un temps et un contexte différents.

Le laboratoire de Collins utilise également des algorithmes pour analyser des bases de données chimiques et concevoir de nouvelles molécules antibactériennes. en 2024, ils ont identifié des antibiotiques structurellement uniques après avoir analysé plus de 12 millions de composés chimiques.

Retour aux Sources : La Richesse Cachée de la Terre

Les techniques scientifiques modernes pourraient révéler de nouvelles opportunités dans d’anciens terrains de chasse. La façon dont les gens trouvaient des antibiotiques dans le passé était d’aller chercher quelque chose dans la terre, explique Gerry Wright, biochimiste à l’Université McMaster au Canada, faisant référence aux champignons et aux bactéries dont la plupart des antibiotiques sont dérivés. Les microbes se livrent une guerre depuis des éons et ont développé d’excellentes défenses les uns contre les autres. Il n’y a pas eu de composés meilleurs que ceux fabriqués dans la nature, ajoute Wright.

Surmonter les Obstacles et Innover

Dans les années 1990,la recherche d’antibiotiques dans les environnements naturels a atteint une impasse,les scientifiques retrouvant sans cesse les mêmes composés. Cependant, en utilisant le séquençage génétique et la chromatographie, les chercheurs du laboratoire de Wright ont pu analyser des microbes connus et découvrir des molécules antibactériennes moins évidentes, auparavant négligées.

La Patience Récompensée

La patience s’est également avérée payante. Une chercheuse du laboratoire de Wright a prélevé de la terre dans un jardin en Ontario et en a extrait un liquide qu’elle a conservé dans une boîte de Pétri sous son banc pendant une année entière. au lieu d’ajouter des nutriments et de vérifier la croissance rapide d’organismes, elle les a affamés et a attendu l’apparition d’organismes plus rares.

L’une de ces espèces à croissance lente s’est avérée produire un antibiotique courant, mais une analyze plus approfondie a révélé qu’elle produisait également un peptide antibactérien inconnu. Ce peptide, considéré comme un antibiotique structurellement nouveau, a éradiqué les bactéries résistantes aux médicaments chez les souris, selon un article publié en mars dans la revue *Nature*.

Nous revenons avec des yeux différents et des techniques différentes et découvrons qu’il y a encore beaucoup de richesses à trouver, conclut Wright.

FAQ sur la recherche d’Antibiotiques

• Qu’est-ce qu’une superbactérie ? Une bactérie résistante aux antibiotiques courants, rendant les infections difficiles à traiter.
• Pourquoi la recherche de nouveaux antibiotiques est-elle importante ? L’antibiorésistance menace de rendre les infections courantes mortelles.
• Qu’est-ce que la mammuthusine ? Un peptide aux propriétés antibactériennes découvert dans le code génétique du mammouth laineux.
• Comment l’IA aide-t-elle dans la recherche d’antibiotiques ? Elle permet d’analyser rapidement d’énormes quantités de données génétiques pour identifier des composés prometteurs.
• Où trouve-t-on de nouveaux antibiotiques ? Dans des sources variées,allant des fossiles d’animaux disparus à la terre de nos jardins.