Recherche par abréviation / forme longue dans les sciences de la vie Haut

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Allie : Recherche par abréviation / forme longue dans les sciences de la vie Haut

■ Recherche d’abréviation et de forme longue


Qu’est-ce qu’Allie ?

Allie est un service de recherche d’abréviations et de formes longues utilisées dans les sciences de la vie. Il fournit une solution au problème que de nombreuses abréviations sont utilisées dans la littérature et que des abréviations polysémiques ou synonymes apparaissent fréquemment, ce qui rend difficile la lecture et la compréhension des articles scientifiques qui ne sont pas pertinents pour l’expertise du lecteur. Allie recherche des abréviations et leurs formes longues correspondantes à partir de titres et de résumés dans l’ensemble de PubMed®, une base de données de la National Library of Medicine des États-Unis. PubMed stocke plus de 30 millions d’informations bibliographiques en sciences de la vie et convient à l’extraction d’abréviations spécifiques à un domaine et de leurs formes longues apparaissant dans la littérature actuelle.

Que peuvent faire les utilisateurs avec Allie ?

  • Les utilisateurs peuvent rechercher les formes longues des abréviations ou les abréviations des formes longues.
  • Les données bibliographiques qui incluent l’abréviation demandée ou la forme longue dans les titres ou les résumés peuvent être obtenues.
  • Les utilisateurs peuvent également obtenir des abréviations concomitantes dans les titres et les résumés.
  • Des interfaces SPARQL/REST/SOAP sont disponibles qui permettent aux utilisateurs de faire appel à Allie à partir de leurs scripts, programmes, etc.

Didacticiel vidéo

Tu peux apprendre Allie ici (tuto vidéo).

Publication connexe

Veuillez vous référer à la publication suivante :
Y. Yamamoto, A. Yamaguchi, H. Bono et T. Takagi, “Allie : une base de données et un service de recherche d’abréviations et de formes longues.”, Database, 2011:bar03.
Entrée PubMed | Texte intégral disponible

Allie utilise ALICE pour extraire les paires d’abréviations et de formes longues ainsi que l’identifiant PubMed des données PubMed. Les détails de cet outil sont décrits dans la publication suivante :
H. Ao et T. Takagi, “ALICE : un algorithme pour extraire les abréviations de MEDLINE.”, J Am Med Inform Assoc., 2005 Sep-Oct;12(5):576-86.
Entrée PubMed | Texte intégral disponible

Mettre à jour

Dernière mise à jour de l’index : 6 octobre 2021 (mise à jour mensuelle)

Télécharger

Vous pouvez télécharger et utiliser la base de données utilisée pour Allie (Mise à jour hebdomadaire) dans les conditions générales d’utilisation.
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S’il vous plaît contactez ici si vous avez des questions ou des suggestions.


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