Pourquoi les chats et les chiens sont moins sensibles à Omicron

L’ancêtre de la variante Omicron pourrait avoir émergé chez la souris puis s’être propagé à l’homme

L’ancêtre de la variante Omicron pourrait avoir émergé chez la souris puis s’être propagé à l’homme

Outre les troubles à grande échelle à Shanghai à la suite du verrouillage prolongé de millions de personnes, plusieurs clips vidéo d’animaux de compagnie de personnes infectées par le virus SARS-CoV-2 tués par des personnes portant des combinaisons de matières dangereuses sont devenus viraux ces derniers jours. Ce n’est pas la première fois que la Chine tue des animaux de compagnie de personnes atteintes d’une infection virale confirmée et même des animaux de compagnie de personnes qui n’étaient que des contacts de personnes testées positives. En septembre et novembre de l’année dernière, des informations ont fait état de personnes en tenue de protection contre les matières dangereuses entrant dans les maisons des gens et tuant leurs animaux de compagnie sans le consentement ou la connaissance des propriétaires qui étaient en quarantaine. Alors que la Chine s’accroche toujours à la stratégie Zero COVID, les gouvernements locaux ne prennent aucun risque car il y a une crainte perçue que les chiens et les chats de compagnie infectés puissent entraîner la propagation du virus.

Mais le résultats d’une petite étude réalisée en Espagne et publiée sur un serveur de préimpression medRxiv, qui n’a pas encore été évalué par des pairs, a constaté que les chiens et les chats ne sont pas facilement infectés par la variante Omicron. Ceci malgré les propriétaires ayant eu des contacts fréquents avec leurs animaux de compagnie et le prélèvement effectué au « meilleur moment pour la détection de la maladie ». Et même lorsqu’ils sont infectés, la charge virale est moindre et l’excrétion d’ARN viral ne dure que pendant une brève période. Même les chiens et les chats de compagnie qui ont été testés positifs pour Omicron n’ont montré aucun symptôme. Les auteurs notent qu’il y avait peu de chances de propagation des chiens et des chats aux humains.

L’étude a été menée sur 50 chiens, 28 chats et un lapin lorsque les propriétaires d’animaux étaient en quarantaine entre le 15 décembre 2021 et le 23 mars 2022. Cette période a coïncidé avec la prévalence la plus élevée de la variante Omicron en Espagne. Sur les 78 chiens et chats testés pour le virus, seuls sept chats et un chien ont été testés positifs pour la variante Omicron, soit 10,13 % du nombre total d’animaux testés.

De plus, les chercheurs n’ont pu isoler la variante du virus Omicron pour aucun des animaux de compagnie testés positifs, ce qui, selon les chercheurs, est une forte indication de la faible charge virale. Étonnamment, les anticorps neutralisants n’ont été détectés chez aucun des animaux de compagnie testés positifs pour le virus.

La faible sensibilité des chiens et des chats à la variante Omicron contraste de manière frappante avec la sensibilité aux variantes Alpha et Delta et l’absence de symptômes chez les animaux de compagnie testés positifs pour la variante Omicron contrairement aux deux autres variantes.

L’une des raisons pour lesquelles les chiens et les chats sont moins sensibles à la variante Omicron pourrait être la faible capacité de liaison du virus aux cellules. Selon un étude publiée dans le Journal de génétique et de génomique, la variante Omicron pourrait avoir émergé chez la souris puis se propager à l’homme. Les auteurs de l’Académie chinoise des sciences de Pékin citent trois scénarios possibles dans lesquels la variante Omicron aurait pu émerger.

La première hypothèse est l’évolution et la propagation dans une petite population qui n’a été ni vaccinée ni testée et dont les génomes ont été séquencés. La deuxième hypothèse est un individu immunodéprimé fournissant un environnement parfait pour que le virus persiste dans l’hôte et subisse de nombreuses mutations. Le troisième est l’origine possible chez les souris avant de passer aux humains.

La preuve

Les chercheurs de l’Académie chinoise des sciences citent quelques raisons pour étayer la possibilité d’une origine chez la souris. La première est que la séquence de la protéine de pointe a fait l’objet d’une sélection positive plus forte que dans d’autres variantes apparues chez l’homme. Deuxièmement, le spectre moléculaire des mutations acquises par le progéniteur d’Omicron est très différent du spectre des variants apparus chez l’homme. Dans le même temps, le spectre moléculaire des mutations observées dans Omicron ressemble étroitement aux spectres associés à l’évolution du virus dans un environnement cellulaire de souris. Troisièmement, les mutations observées dans la protéine de pointe Omicron “se chevauchent de manière significative avec les mutations du SRAS-CoV-2 connues pour favoriser l’adaptation aux souris hôtes”. En particulier, les mutations qui augmentent l’affinité de liaison du virus avec le récepteur cellulaire montrent un fort chevauchement.

Selon les chercheurs, sur la base d’une analyse génétique, l’ancêtre d’Omicron est passé pour la première fois des humains aux souris “très probablement au milieu de 2020” et a collecté un grand nombre de mutations tout en se propageant au sein de la population de souris pendant plus d’un an avant de revenir aux humains. fin 2021.

« Collectivement, nos résultats suggèrent que l’ancêtre d’Omicron est passé des humains aux souris, a rapidement accumulé des mutations propices à l’infection de cet hôte, puis est revenu aux humains, indiquant une trajectoire évolutive inter-espèces pour l’épidémie d’Omicron », écrivent-ils. Dans le même temps, ils déclarent que la possibilité que la variante d’Omicron ait émergé chez un individu immunodéprimé est “l’hypothèse la plus populaire concernant les origines proximales d’Omicron”.

Instances antérieures

Il existe des preuves que le virus SARS-CoV-2 était effectivement passé d’une autre espèce à l’homme au cours de la pandémie. Fin 2020, le virus était passé des humains aux visons au Danemark et s’est propagé parmi les visons élevés dans des fermes pour la fourrure. Les éclosions ou cas de SRAS-CoV-2 chez des visons d’élevage ont été signalés dans de nombreux pays, en particulier en Europe. Plus tard, aux Pays-Bas, un virus muté a été transmis des visons aux humains.

Plus récemment, des hamsters de compagnie que Hong Kong a importés des Pays-Bas ont probablement transporté la variante Delta dans le pays, entraînant une épidémie dans une animalerie qui a conduit à la propagation du virus à des dizaines de personnes. Une étude publiée dans Le Lancet a trouvé huit des 16 hamsters syriens dans l’animalerie et sept des 12 hamsters dans l’entrepôt ont été testés positifs pour la variante Delta. Tous les 15 hamsters testés positifs pour le virus contenaient une variante de Delta qui n’avait pas été détectée auparavant à Hong Kong et qui pourrait provenir de la même source.

Selon l’étude, les hamsters ont été infectés par la variante Delta vers le 21 novembre 2021 et il y a eu deux événements de transmission distincts de la variante Delta des hamsters aux humains, l’un conduisant à la propagation dans les ménages. Cela a conduit à l’abattage de plus de 2 000 hamsters à Hong Kong l’année dernière. Au 3 février 2022, il y avait 82 patients dans le groupe lié au hamster.

Les hamsters sont facilement infectés par le virus. Mais les infections chez les hamsters étaient jusqu’à présent limitées aux laboratoires où les hamsters étaient intentionnellement infectés. Mais l’expérience de Hong Kong suggère que les hamsters peuvent être infectés par des humains dans un environnement naturel, puis se propager d’un hamster à un autre avant de revenir aux humains.

Facebook
Twitter
LinkedIn
Pinterest

Leave a Reply

Your email address will not be published.

This site uses Akismet to reduce spam. Learn how your comment data is processed.

ADVERTISEMENT