Nouveaux virus, superbactéries trouvées dans l'étude des souris domestiques de New York

Nouveaux virus, superbactéries trouvées dans l'étude des souris domestiques de New York

Une évaluation d’une année de la population résidentielle de souris de la ville a révélé que beaucoup de ces rongeurs sont des virus invisibles et des bactéries capables de causer des maladies humaines mortelles. Certaines bactéries étaient même résistantes aux antibiotiques. «Les fientes de souris peuvent contenir des bactéries nocives difficiles à traiter avec des antibiotiques courants», a déclaré le Dr W. Ian Lipkin, auteur principal des deux articles issus de l’étude et professeur d’épidémiologie à la Mailman School of Public Health de l’Université Columbia. “Les zones contaminées doivent être soigneusement nettoyées et les aliments contaminés doivent être jetés.” La recherche de Lipkin a été publiée mardi dans mBio, le journal de l’American Society for Microbiology. Sur une période d’environ un an, Lipkin et ses collègues ont recueilli 416 souris à partir de bâtiments résidentiels sur sept sites dans quatre des cinq arrondissements de New York (Staten Island a été exclu). Principalement, les scientifiques ont attrapé les souris dans ou autour des zones d’élimination des déchets dans les sous-sols, bien que cinq souris ont été piégées dans les zones de préparation / stockage des aliments d’un immeuble commercial, et une seule souris a été emprisonnée dans un appartement privé. Pour un des deux documents Lipkin et son équipe ont recherché et analysé des bactéries dans les fientes des souris capturées. Exécutant des tests génétiques, les chercheurs ont défini 235 genres distincts et 149 espèces distinctes de bactéries, y compris les causes les plus fréquentes de troubles gastro-intestinaux: C. difficile , E. coli , Shigella et Salmonella . L’une des principales causes de l’intoxication alimentaire bactérienne, Salmonella à elle seule cause 1,2 million de cas déclarés, dont 450 décès, aux États-Unis chaque année. Une analyse plus approfondie des bactéries identifiées a mis en évidence des gènes indiquant une résistance antimicrobienne à plusieurs antibiotiques courants. UNE deuxième papier concernait la charge virale des déjections de souris. Ici, les chercheurs ont découvert 36 virus distincts, dont six nouveaux. Aucun des virus identifiés par les chercheurs n’est connu pour infecter les humains, cependant, les séquences génétiques correspondaient à celles connues pour infecter les chiens, les poulets et les porcs. Cela suggère que certains des virus pourraient avoir croisé d’autres espèces. Bien que les New-Yorkais aient tendance à être plus méfiants à propos des rats, «les souris sont plus inquiétantes parce qu’elles vivent à l’intérieur et sont plus susceptibles de contaminer notre environnement», a déclaré Lipkin, directeur du Centre des maladies infectieuses et immunitaires de Mailman. “A notre connaissance, c’est la première enquête de ce type à New York”, a-t-il dit, ajoutant que le travail de laboratoire était “substantiel”. Souris, pays, souris ville Professeur John Baines , un biologiste évolutionniste travaillant à l’Institut Max Planck pour la biologie évolutive en Allemagne et à l’Université de Kiel en Allemagne, apprécie «l’approche à plusieurs niveaux» utilisée par Lipkin et ses collègues pour rechercher des agents pathogènes dans les fientes. Baines, qui n’était pas impliqué dans la recherche, a expliqué que dans certains groupes de bactéries, il y a beaucoup de membres différents, certains pathogènes (ou pathogènes), d’autres inoffensifs. En utilisant différentes méthodes d’analyse, les chercheurs ont pu en apprendre plus sur les microbes. “Plus vous regardez, plus vous pouvez potentiellement trouver”, a déclaré Baines. “C’est une belle approche combinée.” Les échantillons étudiés, rassemblés seulement à New York, sont “relativement limités dans un contexte géographique”, a-t-il dit. Les souris de pays portent-elles les mêmes bactéries et virus que les souris citadines? “Il faudrait vraiment faire les mêmes expériences dans la ville et à la campagne pour avoir une comparaison directe”, a déclaré Baines, qui, pour ses recherches les plus récentes, “a posé des pièges dans et autour des fermes” pour trouver des souris malades dans le sauvage. “Nous étions essentiellement à la recherche d’une pathologie chez les souris et ensuite essayer de retracer ce qui causait la pathologie”, a-t-il dit. Les pathogènes «rendant les souris malades dans des environnements plus ruraux sont également connus pour rendre les humains malades.» Il y a donc un certain chevauchement. Le professeur Mark Viney, biologiste à l’Université de Bristol, a déclaré que les résultats «seraient probablement similaires dans toutes les villes du monde, car ce que vous avez dans les villes, c’est beaucoup de gens, de rats et de souris, etc. ” Viney mène des recherches connexes, mais n’a pas participé à la présente étude. A la campagne, cela pourrait être différent, a dit Viney, “car alors la densité de population est moindre, donc les souris seraient en contact plus étroit avec les animaux sauvages, peut-être le bétail, les vaches et les moutons et les cochons.” “Bien sûr, nous ne le savons pas, nous devons donc faire de futures études pour comprendre cela”, a-t-il ajouté. “Au cours des dernières années, il est devenu très clair que tous les animaux vivants sont pleins de bactéries et de virus”, a déclaré Viney. “C’est l’état normal des animaux, et c’est aussi vrai pour les humains, et la grande majorité de ces bactéries et virus sont inoffensifs.” La résistance aux antibiotiques trouvée par les chercheurs est, “encore une fois, absolument comme on pourrait s’y attendre”, a-t-il dit. “Et c’est parce qu’il y a beaucoup de résistance antibactérienne dans les bactéries que les gens et beaucoup d’animaux ont, et bien sûr ces gènes sont donc répandus dans l’environnement bactérien plus large”, at-il dit. Viney, qui étudie les réponses immunitaires de souris sauvages , a noté que “une énorme quantité est connue sur les réponses immunitaires des souris de laboratoire.” Cependant, ils vivent des «vies très différentes» que les souris sauvages, qui ne sont pas si bien nourries ou qui font leur maison dans des conditions presque «stériles». Souris sauvages ont des réponses immunitaires très élevées par rapport aux souris de laboratoire, a déclaré Viney. “C’est parce que les souris sauvages sont exposées à des infections tout le temps, des bactéries et des virus et parfois des vers et quelques puces et tiques.” En ce qui concerne les souris de la ville, la question est: d’où viennent ces insectes, et quelles sont les conséquences? “Nous n’en avons aucune idée”, a déclaré Viney. Une possibilité est que les souris domestiques ramassent les bactéries et les virus qui passent à travers les déchets humains et les excréments dans les égouts. “Si ce sont une source d’infection pour les humains: Qui sait?” il a dit. “Je pense que les autres sont la plus grande source d’infection pour les gens aussi.” Il a déclaré que d’autres études sont nécessaires. Les deux Baines et Lipkin sont d’accord. “La prochaine étape consiste à déterminer si les épidémies [humaines] d’infection par des bactéries peuvent être attribuées à l’exposition à des souris”, a déclaré Lipkin.

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