Libération anticipée – Décès de marsouins communs associés à Erysipelothrix rhusiopathiae, Pays-Bas, 2021 – Volume 29, Numéro 4—Avril 2023 – Revue des maladies infectieuses émergentes

Érysipélothrix les bactéries provoquent des infections chez les humains et d’autres espèces après un contact avec des animaux infectés ou des sources environnementales (1). La maladie varie de légère à systémique, pouvant inclure la septicémie et l’endocardite. Érysipélothrix peuvent survivre pendant de longues périodes dans l’environnement, y compris les écosystèmes marins (1) associés aux poissons marins, mollusques et crustacés. Érysipélothrix l’infection affecte les crustacés en captivité et en liberté et est liée à une septicémie mortelle (2). À notre connaissance, les rapports d’événements de mortalité à grande échelle causés par Érysipélothrix l’infection chez les mammifères marins sont absents de la littérature, et Érysipélothrix n’a pas été détecté chez les marsouins échoués le long de la côte néerlandaise depuis le début de notre programme de recherche sur les échouages ​​de marsouins communs en 2008.

Fin août 2021, un total de 190 marsouins communs morts (Allez allez) ont été trouvés sur les îles néerlandaises des Wadden ; la moyenne annuelle des marsouins communs échoués sur l’ensemble du littoral néerlandais est de 600. Aucune activité anthropique dans le sud ou le centre de la mer du Nord pouvant expliquer cet événement de mortalité n’a été signalée au gouvernement des Pays-Bas dans les 4 à 6 semaines précédant l’événement.

La plupart des marsouins ont été trouvés dans un état avancé de décomposition. Vingt-deux animaux ont été collectés pour examen à la Faculté de médecine vétérinaire de l’Université d’Utrecht (tableau 1 en annexe). Nous en avons immédiatement autopsié 2, et les autres ont été temporairement congelés en attendant l’enquête post-mortem et les tests auxiliaires.

En raison de la décomposition avancée, nous n’avons pu effectuer que des examens pathologiques macroscopiques et des prélèvements pour des tests auxiliaires, en suivant un protocole international standardisé (LL IJsseldijk et al., données inédites, https://doi.org/10.31219/osf.io/zh4ra). Les marsouins femelles adultes étaient pour la plupart dans un état nutritionnel bon à modéré avec des infections parasitaires légères à modérées de divers organes et avaient été reproductrices actives (tableau 1 en annexe). Sur les 21 estomacs examinés (1 n’a pas été examiné en raison de dommages importants causés par des charognards), aucun ne contenait de débris marins ; 10 contenaient les restes de quelques proies, reflétant une prise de nourriture non récente, et les estomacs restants étaient vides.

Des échantillons de 3 marsouins présentant des modifications importantes (glande mammaire, poumon, moelle épinière) ont été cultivés sur gélose au sang (bioTrading, https://biotrading.com) à 37°C pendant 48h. Les résultats de la culture étaient positifs pour Erysipelothrix rhusiopathiae. Par la suite, nous avons testé des échantillons de foie de 21 animaux pour E. rhusiopathiae; et 16 étaient positifs (tableau annexe 2). Pour étudier la parenté des isolats, les génomes de 18 isolats ont été séquencés à l’aide d’Illumina NextSeq (https://www.illumina.com) et assemblé à l’aide de SPAdes version 3.14.1 (3); nous avons inclus 11 génomes de référence accessibles au public provenant de différents E. rhusiopathiae clades (4). Un alignement central du génome a été réalisé avec Parsnp version 1.2 (5) et visualisé en utilisant iTol version 4 (6).

Les génomes de cette étude ont été positionnés phylogénétiquement entre le clade 2 E. rhusiopathiae génomes de référence et formé 2 clusters distincts montrant ≈3 400 différences de polymorphisme mononucléotidique (SNP) et une diversité limitée de <6 SNP au sein des clusters (Figure). Ce schéma suggère la dissémination de 2 lignées clonales de E. rhusiopathiaesoit par exposition à une source commune, soit par contact entre individus.

Tests virologiques sur 14 échantillons fécaux, 15 échantillons sanguins et 17 échantillons spléniques et séquençage métagénomique avec VirCapSeq-VERT (5) n’a révélé aucune séquence virale d’intérêt. De plus, nous avons testé 20 échantillons de poumons et 20 échantillons de cerveau pour le virus de la grippe A, les paramyxovirus (y compris les morbillivirus), les coronavirus (y compris le SRAS-CoV-2) et les herpèsvirus. Seuls 2 échantillons de cerveau ont été testés positifs pour P. phocoena alphaherpesvirus (tableau annexe 1), décrit comme une cause fortuite de décès chez les marsouins (7). Nos résultats indiquent que les virus étaient un facteur peu probable dans cet événement de mortalité.

Nous avons regroupé 20 échantillons de contenu stomacal et 21 échantillons de foie en trois exemplaires et les avons analysés avec un Spectromètre de masse à chromatographe en phase liquide triple quadripôle (LC-MS/MS) (McCrone Associates, https://www.mccrone.com) pour l’acide domoïque, les saxitoxines, la tétrodotoxine et les toxines marines lipophiles. Seule la saxitoxine a été détectée; c’était dans 1 échantillon de foie regroupé (concentration estimée à 15 μg/kg). Par la suite, nous avons analysé les foies individuellement et la saxitoxine n’a été confirmée dans aucun des échantillons individuels. Nous concluons donc que les algues nuisibles étaient un facteur peu probable dans cet événement de mortalité.

L’évaluation pathologique globale a révélé une condition physique modérée à bonne pour la plupart des marsouins, mais aucun ne s’était nourri récemment. Cette découverte suggère une cause subaiguë de décès dû à une maladie soudaine et excessive. Aucun virus cliniquement pertinent n’a été détecté. Des phycotoxines ont été détectées dans un nombre limité de marsouins. En revanche, E. rhusiopathiae a été isolé de la plupart des marsouins étudiés. Par conséquent, nous considérons E. rhusiopathiae être la cause la plus probable de décès. L’autolyse avancée des carcasses a permis de détecter des lésions distinctives associées à Érysipélothrix contamination impossible. Le faible nombre de SNP différant entre les isolats suggère une exposition commune, peut-être une source de nourriture, une transmission entre marsouins, ou les deux.

Nos résultats attirent l’attention sur une possible augmentation de la sensibilité des cétacés à E. rhusiopathiaeaux sources nouvelles ou émergentes de Érysipélothrix dans le milieu marin, ou les deux. Érysipélothrix reste viable dans une carcasse jusqu’à 12 jours en plein soleil, jusqu’à 4 mois dans de la chair putréfiée et jusqu’à 9 mois dans une carcasse enterrée (8). Cette nouvelle source émergente et la longue durée de survie dans les carcasses démontrent la nécessité de n’avoir que du personnel formé pour manipuler les animaux échoués, l’élimination appropriée des carcasses et une sensibilisation accrue à la présence et à la transmission potentielles de cette bactérie zoonotique chez les cétacés.

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Nous remercions tous les bénévoles et organisations du Dutch Stranding Network pour leurs efforts et leur travail considérables pour documenter les marsouins échoués pendant l’événement. Les nécropsies ont été assistées par Louis van den Boom, Natashja Ennen-Buijs, Olle Juch, Darryl Leydekkers, Immelie Coenen Morales, Jan Mosterd, Eva Schotanus et Ruby Wagensveld. Nous remercions également Judith van den Brand pour sa contribution aux discussions sur les tests auxiliaires. La virologie a été menée à Erasmus MC, avec des remerciements particuliers à Marco van de Bildt, Irina Chestakova, Marjan Boter, Babette Weller, Reina Sikkema et Marion Koopmans. La bactériologie a été effectuée au Centre de diagnostic microbiologique vétérinaire, pour laquelle nous remercions tout le personnel impliqué. Des enquêtes sur l’estomac ont été menées à Wageningen Marine Research avec l’aide de Guido Keijl et Eva Schotanus. La recherche sur les toxines des algues a été menée par Wageningen Food Safety Research avec l’aide de Domenique van der Horst.

La recherche a été financée par le ministère de l’Agriculture, de la Nature et de la Qualité alimentaire (projet n° 1400012118), pour lequel nous remercions particulièrement Anne-Marie Svoboda et Sandra van der Graaf.