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Les scientifiques commencent à comprendre le mystérieux gène des virus du sol : ce qu’il fait pour nous

Le sol est un écosystème florissant de vie et de mort, les insectes et les plantes l’utilisant pour les maintenir jusqu’à leur mort, moment auquel les bactéries et les champignons les prennent en charge et les dégradent dans le sol. Au sein de ce système complexe, les virus utilisent des gènes spéciaux qui sont cruciaux pour leurs processus métaboliques mais n’interfèrent pas avec la réplication, appelés gènes métaboliques auxiliaires (AMG).

Les scientifiques pensaient que ces gènes pourraient être impliqués dans des processus cruciaux dans sol, mais les comprendre est extrêmement difficile. C’est jusqu’à une étude récente.

Une travailler publié dans la revue Nature Communications, une équipe de chercheurs du Stanford Synchrotron Radiation Lightsource (SSRL) a pu révéler la structure d’une protéine exprimée par un AMG dans les virus du sol, offrant un aperçu sans précédent de sa fonction.

À l’aide des rayons X de la source lumineuse, les chercheurs ont essentiellement créé un balayage aux rayons X – enfin, plus de 5 000 balayages individuels de la protéine, qui ont ensuite été cousus ensemble – au fur et à mesure de sa cristallisation, produisant une structure précise.

Quel rôle jouent les virus du sol ?

Cela a permis aux chercheurs d’approfondir enfin ce qui compose cette famille de gènes insaisissable, y compris la façon dont ils peuvent être liés à d’autres gènes bactériens et viraux et à de nouvelles régions non encore connues – dans cette protéine spécifique, ils en ont découvert de complètement nouveaux.

“Nous avons vu l’emplacement de chaque atome dans la protéine virale, ce qui nous aide à comprendre comment cela fonctionne”, a déclaré le chercheur principal et co-auteur du SSRL, Clyde Smith, dans un communiqué.

“Nous avons été étonnés de voir que la protéine ressemblait aux structures atomiques connues des familles d’enzymes bactériennes et fongiques apparentées, mais contenait également des parties complètement nouvelles.”

Selon l’étude, la protéine en question est probablement une chitosanase, responsable de la décomposition de la chitine structurelle qui compose les exosquelettes et les parois cellulaires des insectes. champignon. Une grande quantité d’insectes meurent et pénètrent dans le sol chaque jour, et la destruction des exosquelettes durs nécessite des outils spécialisés. Cette protéine peut préparer le sol pour les plantes, le rendant prêt pour une nouvelle vie.

Cependant, comme la fonction des nouvelles régions de la protéine est encore inconnue, des recherches supplémentaires seront nécessaires pour bien comprendre pourquoi les AMG existent et leur rôle dans écosystème le sol.

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