Malgré l’échantillonnage de centaines de nouveaux coronavirus, la pandémie de COVID-19 s’est développée d’un ordre de grandeur au-delà de son homologue du SRAS de 2003
Après COVID-19il y a une augmentation soudaine des efforts mondiaux pour identifier de nouveaux virus qui pourraient déclencher futures pandémies. L’année dernière a vu le lancement d’au moins trois initiatives majeures de ce type, dont le premier effort mené par l’industrie par la société de soins de santé Abbott.
L’Abbott Pandemic Defense Coalition (APDC) a délégué ses chasseurs de virus en Jamaïque, en Colombie, au Brésil, en Afrique du Sud, au Sénégal, en Thaïlande et en Inde, et en recrute davantage.
La Fondation philanthropique américaine Rockefeller a également créé le Pandemic Prevention Institute en collaboration avec le Hub for Pandemic and Epidemic Intelligence de l’Organisation mondiale de la santé (OMS) à Berlin et le Global Pandemic Radar du Royaume-Uni.
La troisième initiative de ce type est celle de l’Agence américaine pour le développement international (USAID). Seront-ils capables de prévenir de futures pandémies ? Les scientifiques n’ont pas de réponse définitive, bien que la recherche sur l’émergence de virus zoonotiques soit en cours depuis plus d’une décennie maintenant.
En 2009, suite à la Alerte à la grippe aviaire H5N1l’USAID a lancé PREDICT pour accélérer et coordonner la découverte et la surveillance mondiales des virus.
Jusqu’en 2019, lorsque le gouvernement a cessé de financer les programmes, il avait identifié au moins 931 nouvelles espèces de virus à partir de 145 000 échantillons d’animaux sauvages, de bétail et d’humains de plus de 60 pays.
Mais un article préimprimé publié sur le référentiel en ligne SSRN en février 2022, affirme que PREDICT n’a conduit qu’à une seule découverte concluante d’une zoonose, le virus du Bas-Congo. Le potentiel zoonotique des autres virus identifiés est quasiment impossible à évaluer.
Pourtant, les données de base sur les agents pathogènes sont importantes pour la préparation et la vigilance. Ainsi, en 2018, un groupe de scientifiques de diverses parties du monde s’est réuni pour créer le Global Virome Project.
Son objectif est de parcourir la planète à la recherche de ses millions de virus inconnus, de les identifier et de les caractériser, et de construire en une décennie un atlas mondial des virus zoonotiques à potentiel épidémique ou pandémique.
Bien qu’il soit trop tôt pour évaluer son résultat, le projet est déjà confronté à une tâche formidable de lever les 4 milliards de dollars nécessaires pour atteindre l’objectif, ce qui met en évidence le scepticisme à l’égard de tels efforts scientifiques.
“L’histoire nous dit que la découverte virale ne suffit pas à prévenir les pandémies”, un éditorial de mars 2020 dans Le Lancet argumente.
Entre les épidémies de SRAS (syndrome respiratoire aigu sévère) en 2003 et MERS (syndrome respiratoire du Moyen-Orient) en 2012, des centaines de nouvelles espèces de coronavirus ont été échantillonnées.
“Malgré ces réalisations scientifiques, la pandémie actuelle de SRAS-CoV-2 a encore augmenté d’un ordre de grandeur au-delà de son homologue de 2003”, note l’éditorial.
Approche parallèle
Selon l’OMS, environ 70 % de toutes les maladies infectieuses émergentes chez l’homme sont d’origine animale. Une étude publiée dans La nature en 2022 soutient que le changement climatique pourrait faciliter la transmission interspécifique de quelque 4 000 virus d’ici 2070.
Ainsi, on reconnaît de plus en plus que l’identification des espèces exotiques virus zoonotiques ne peut à elle seule aider à prévenir les pandémies. Cela nécessite également la Approche One Health. Développée par l’ONU, l’approche reconnaît l’interdépendance des humains, des animaux et de l’environnement partagé.
“Le risque ne vient pas seulement des agents pathogènes connus, mais aussi des plus de 1,5 million de virus inconnus qui se cachent dans les régions riches en biodiversité”, a déclaré Peter Daszak, président de l’association américaine à but non lucratif EcoHealth Alliance, qui a créé une carte mondiale des points chauds des maladies émergentes.
La carte montre, pour la première fois, que l’émergence mondiale de maladies est liée à des facteurs induits par l’homme comme le changement d’affectation des terres et aux interactions homme-faune dans les régions riches en biodiversité. Cela indique que des endroits comme l’Inde sont les plus à risque de signaler de futurs événements majeurs de maladie.
L’Inde a lancé son premier consortium One Health en octobre 2021 dirigé par l’Institut national de biotechnologie animale d’Hyderabad, constitué de 27 organisations. Debanjana Dey, chercheuse postdoctorale en politique à l’Indian Institute of Science de Bengaluru, affirme que le concept est encore naissant.
L’Inde a également annoncé Pradhan Mantri AtmaNirbhar Swasth Bharat Yojna et affecté Rs 64 180 crore en 2021-2022 pour lutter contre les maladies nouvelles et émergentes. En avril 2021, le ministère de la Santé a publié une version améliorée de la plateforme intégrée d’informations sur la santé pour permettre des réponses rapides grâce à des données en temps quasi réel.
Bien que ceux-ci soient cruciaux pour atténuer les épidémies, l’Inde devrait se concentrer sur la surveillance de la faune, a déclaré Abi Vanak, chercheur principal à l’organisation à but non lucratif Ashoka Trust for Research in Ecology and the Environment de Bengaluru.
“Le monde a réalisé que la faune est la source des agents pathogènes viraux et que les animaux domestiques sont l’interface. Mais l’Inde n’a pas encore résolu ce problème. Les instituts de haute sécurité pour les maladies animales, la virologie et l’épidémiologie existent mais uniquement dans des silos, ce qui va à l’encontre de l’idée de One Health », a-t-il ajouté.
Victoires mineures
Les initiatives gouvernementales et privées visant à identifier les virus qui présentent un risque pour l’homme ont connu peu de succès
Organisme | Frais | An | Réalisations |
Coalition de défense contre la pandémie Abbott | Entièrement financé par Abbott, chiffres non disponibles | 2021 | Identifié trois variantes de COVID-19 (Beta, Gamma, Omicron), surveillé les séquences génétiques du virus qui ont montré qu’il provenait de la moins virulente des deux souches de monkeypox endémiques à l’Afrique, et que les vaccins existants seraient efficaces |
DEEP-VZN de l’USAID | 125 millions de dollars | 2021 | Pas encore de réalisations |
Institut de prévention des pandémies | 150 millions de dollars | 2021 | Pas encore de réalisations |
Projet mondial de virome | 1 à 4 milliards de dollars | 2018 | Vise à créer un atlas mondial de la plupart des virus potentiellement zoonotiques d’origine naturelle de la planète |
PREDICT de l’USAID | 200 millions de dollars | 2009 | Identification de 931 nouvelles espèces de virus dans plus de 60 pays. Découverte du virus Bombali chez des chauves-souris en Sierra Leone en 2018, pas encore de cas humains. Découverte du virus de Marburg chez des chauves-souris en Afrique en 2020 ; cependant, les retombées enregistrées auparavant également |
Ceci a été publié pour la première fois dans l’édition du 1er au 15 octobre 2022 de Terre à terre
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