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Deux cas de monkeypox en Inde non liés à l’Europe

Les séquences génétiques du virus du monkeypox suggèrent fortement qu’il y a eu deux épidémies distinctes de monkeypox

Les séquences génétiques du virus du monkeypox suggèrent fortement qu’il y a eu deux épidémies distinctes de monkeypox

Les séquences génomiques des deux premiers cas importés de monkeypox détectés au Kerala montrent clairement qu’ils appartiennent à un petit groupe – A.2 – qui était très différent de celui qui a été détecté pour la première fois au Royaume-Uni le 6 mai de cette année et s’est depuis propagé dans plus de 75 pays. Les génomes de la principale épidémie de cas de monkeypox en Europe et dans le reste du monde appartiennent à la lignée B.1.

Les génomes du virus collectés à partir des deux premiers cas au Kerala ont été séquencés par le laboratoire nodal de l’ICMR, l’Institut national de virologie de Pune et déposés sans délai dans la base de données mondiale GISAID.

Deux épidémies distinctes

Au cours de la première semaine de juin, le CDC a découvert que trois des 10 génomes séquencés à partir de virus collectés aux États-Unis étaient différents des virus séquencés en Europe. Les séquences génétiques des cas de monkeypox suggèrent fortement qu’il y a eu deux épidémies distinctes de monkeypox en dehors des pays d’endémie en Afrique. Les deux groupes distincts ont indiqué que la transmission interhumaine en dehors de l’Afrique se produisait depuis plus longtemps que ce qui avait été supposé initialement. Le petit cluster principalement observé aux États-Unis, en Thaïlande et maintenant en Inde est le cluster A.2.

Les trois cas importés détectés au Kerala concernaient des hommes arrivés du Moyen-Orient. Écrire dans STATHelen Branswell a noté que les trois génomes des virus collectés aux États-Unis qui appartenaient au groupe A.2 appartenaient à des personnes qui avaient été infectées dans différentes parties du globe – un au Nigeria, un ailleurs en Afrique de l’Ouest et le troisième au Moyen-Orient ou en Afrique de l’Est.

Sur la base de la large propagation géographique du virus appartenant au cluster A.2, Inger Damon, directeur de la division des agents pathogènes et pathologies à hautes conséquences du CDC, a déclaré STAT que le virus se propage silencieusement en dehors des pays d’endémie depuis plus longtemps.

Alors que les trois cas importés détectés au Kerala concernaient des personnes arrivées du Moyen-Orient, certains des cas détectés ailleurs et appartenant également à ce groupe proviennent de personnes ayant voyagé au Moyen-Orient ou en Afrique de l’Est.

Événements de grande diffusion

La grande épidémie qui a commencé en Europe au début du mois de mai de cette année et qui a depuis atteint plus de 21 000 cas dans le monde s’est propagée principalement par transmission interhumaine. La transmission soutenue parmi les humains a été principalement parmi les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes (HSH) et s’est propagée à travers l’Europe en quelques jours en raison de deux événements de grande propagation. Le petit cluster A.2 est très différent du grand cluster B.1 qui représente le virus qui a commencé à se propager en Europe.

Selon le Dr Vinod Scaria, chercheur principal à l’Institut de génomique et de biologie intégrative de Delhi (CSIR-IGIB), le petit cluster A.2 contenant très peu de génomes et datant de juillet 2021 ne montre aucun signe de propagation. par n’importe quel événement de grande diffusion.

“Le premier échantillon du groupe en provenance des États-Unis date en effet de 2021, ce qui suggère que le virus est en circulation depuis un certain temps, et plus tôt que les événements européens”, a déclaré le Dr Scaria. tweeté.

“L’A.2 semble avoir une origine assez distincte et n’est pas lié à la grande épidémie en Europe”, a déclaré le Dr Scaria. L’Hindou. “Le cluster A.2 a une longue queue suggérant qu’il est né il y a un certain temps. Le virus appartenant au cluster A.2 se propageait peut-être silencieusement. Mais il n’y a pas de génomes intermédiaires [sequenced at regular and short intervals between July 2021 and early June 2022] disponible, cependant.

Considérant que le cluster A.2 trouvé aux États-Unis et maintenant en Inde est très petit avec seulement une poignée de génomes, il est possible que la propagation du virus appartenant au cluster A.2 n’ait pas été présente dans le réseau HSH ; la lignée B.1 se trouve principalement dans les réseaux MSM. Il est basé sur la prémisse que si le cluster A.2 avait également été trouvé dans les réseaux MSM, alors le nombre de personnes infectées par le virus du cluster A.2 et la propagation géographique auraient été comparables à la lignée B.1.

Le Dr Scaria, cependant, met en garde contre le fait de tirer de telles conclusions sur la base de quelques échantillons séquencés. “Le cluster A.2 aurait pu être trouvé dans les réseaux MSM mais ne se serait pas répandu aussi largement que la lignée B.1 en raison de l’absence d’événements de super-propagation”, dit-il. “Il est trop tôt pour tirer des conclusions car nous n’avons pas suffisamment d’informations sur les séquences du génome.”

Les États-Unis en tête des cas

Depuis le 28 juillet, 4 907 cas de monkeypox ont été détectés aux États-Unis, de loin le nombre le plus élevé de tous les pays. Et 37 pays d’Europe ont au total signalé 13 043 cas du monkeypox au 26 juillet.

Sur la base des résultats d’une série de cas au Royaume-Uni publiés dans Le BMJ le 28 juillet, près de 99 % des cas sont limités aux réseaux HSH, le contact sexuel avec une personne infectée étant le principal moteur de la propagation du virus. Et une proportion importante des cas sont des personnes vivant avec le VIH.

“Bien que l’épidémie se concentre actuellement sur les HSH, à mesure que le nombre de cas augmente, nous verrons des cas dans d’autres groupes démographiques. Il y a eu des cas chez les enfants et les femmes, mais relativement peu nombreux jusqu’à présent. C’est pourquoi il est si important d’agir rapidement pour contenir cela », a tweeté le Dr Boghuma Titanji de l’École de médecine de l’Université Emory à Atlanta. Cela dit, il n’y a eu jusqu’à présent aucun cas de transmission ultérieure parmi des personnes extérieures aux réseaux HSH.

Arguant que le virus monkeypox n’est pas hautement transmissible par rapport au virus SARS-CoV-2 et qu’il nécessite un contact étroit et intime pour se propager d’une personne à l’autre, le Dr François Balloux de l’Institut de génétique de l’UCL a tweeté que le virus ne peut que maintenir dans la démographie où les gens ont de nombreux partenaires sexuels, comme les réseaux HSH.

« Le virus de la variole du singe n’est pas un agent pathogène qui a le potentiel de devenir une MST dans la population hétérosexuelle. La raison en est que les personnes infectées peuvent la transmettre efficacement à d’autres pendant environ quatre semaines au maximum, puis l’éliminer et devenir essentiellement immunisées à vie », a-t-il déclaré. tweeté.

Cependant, le Dr Titanji n’est pas d’accord. « Je ne suis pas d’accord pour dire que la transmission facilitée par le sexe ne peut pas se produire dans la population hétérosexuelle. Cela peut certainement se produire et se produit probablement, bien que cela ne soit peut-être pas aussi soutenu que dans des réseaux sexuels plus denses qui ont un plus grand nombre de contacts », a-t-elle tweeté.

Risque croissant

Alors que les scientifiques se demandent si le virus peut se propager dans la population hétérosexuelle et dans quelle mesure, il est tout à fait clair que plus le virus continue de circuler et d’infecter un plus grand nombre de personnes, le virus acquerra la capacité de devenir plus transmissible et d’évoluer pour se propager. plus facilement par plusieurs voies.

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