Une équipe de chercheurs américains a mis au point un test Covid-19 rapide qui pourrait aider à identifier différentes variantes du SRAS-CoV-2 en quelques heures seulement.
Après avoir développé «CoVarScan», un test Covid-19 rapide qui détecte les signatures de huit points chauds sur le virus SARS-CoV-2, l’année dernière, l’équipe l’a maintenant testé sur plus de 4 000 échantillons de patients.
Les chercheurs ont rapporté que leur test est aussi précis que les autres méthodes utilisées pour diagnostiquer Covid et peut différencier avec succès toutes les variantes actuelles du SRAS-CoV-2.
“Grâce à ce test, nous pouvons déterminer très rapidement quelles variantes se trouvent dans la communauté et si une nouvelle variante émerge”, a déclaré le chercheur Jeffrey SoRelle de l’Université du Texas Southwestern aux États-Unis. “Cela a également des implications pour les patients individuels lorsque nous avons affaire à des variantes qui répondent différemment aux traitements”, a ajouté SoRelle.
Par rapport au séquençage du génome entier, CoVarScan avait une sensibilité de 96% et une spécificité de 99%, ont déclaré les chercheurs, dans une étude publiée dans la revue Clinical Chemistry Il a identifié et différencié les variantes Delta, Mu, Lambda et Omicron de Covid-19 , y compris la version BA.2 d’Omicron, autrefois connue sous le nom de “stealth Omicron” car elle n’apparaissait pas sur certains tests conçus pour détecter uniquement la souche Omicron.
Bien que plusieurs autres tests pour Covid-19 existent, ils détectent généralement soit un fragment de matériel génétique du SRAS-CoV-2, soit de petites molécules trouvées à la surface du virus et ne fournissent pas d’informations pour identifier la variante. De plus, de nombreux chercheurs craignent que ces tests ne soient pas précis pour détecter certaines variantes ou qu’ils manquent de futures souches. Pour déterminer quelle variante de Covid-19 un patient a, les scientifiques doivent généralement utiliser le séquençage du génome entier, qui prend du temps et coûte cher, en s’appuyant sur un équipement et une analyse sophistiqués pour épeler toute la séquence d’ARN contenue dans les virus, a déclaré l’équipe. .
Au début de 2021, SoRelle et son équipe ont voulu suivre dans quelle mesure les tests actuels détectaient les variantes émergentes du SRAS-CoV-2. Mais ils ont réalisé que le séquençage d’un grand nombre d’échantillons ne serait ni rapide ni rentable, ils ont donc conçu leur propre test.
Une critique courante de ce type de test est qu’il nécessite un ajustement constant pour les nouvelles variantes, mais CoVarScan n’a eu besoin d’aucun ajustement depuis plus d’un an ; il fonctionne toujours très bien », a déclaré SoRelle. “À l’avenir, si nous devions l’ajuster, nous pourrions facilement ajouter jusqu’à 20 ou 30 points chauds supplémentaires au test”, a-t-il ajouté.
