Découverte, redécouverte et réaffectation : redéfinir la biodiversité fongique

Bien que les champignons soient parmi les organismes les plus importants au monde, la diversité de leurs espèces reste mal comprise. La taxonomie est la base des études sur la biodiversité. Maintenant, non seulement des chercheurs japonais ont étudié une espèce de champignon jusque-là non décrite, mais ils ont également réaffecté une autre espèce à un genre différent et redécouvert une autre espèce au Japon.

Des chercheurs dirigés par l’Université de Tsukuba ont étudié des espèces de deux genres fongiques (classifications biologiques qui regroupent étroitement espèces apparentées), Sirobasidium et Sirotrema, en étudiant relations évolutives entre leurs gènes (appelés Analyse phylogénétique), en observant leur forme et leurs caractéristiques structurelles (ou morphologie), et en analysant leurs caractéristiques physiologiques pour déterminer leur statut taxonomique (la taxonomie étant la science de nommer, décrire et classer les organismes vivants) et leur type d’accouplement. Les enquêtes précédentes sur les genres se sont concentrées uniquement sur la morphologie des structures reproductrices (souvent des fructifications), et les informations génomiques sur leur état asexué unicellulaire sont rares.

“Sirobasidium et Sirotrema appartiennent tous deux à l’ordre des Tremellales”, explique l’auteur principal de l’étude, le professeur Yousuke Degawa. “En raison des similitudes dans leurs structures reproductives connues sous le nom de basides, qui se trouvent dans les deux genres, il a été suggéré que les deux sont étroitement liés, mais leur relation phylogénétique n’a pas été entièrement déterminée en raison d’un manque de données sur les souches et les séquences génétiques. pour Sirotrema.”

Afin de combler cette lacune dans les données, les chercheurs ont recueilli des échantillons de basidiocarpes (fructifications qui produisent des spores reproductrices) poussant sur des branches tombées ou des aiguilles de pin. Ils ont identifié des espèces de Sirobasidium japonicum et Sirotrema translucens et une autre nouvelle espèce de Sirobasidium. De plus, les résultats des analyses morphologiques ont fourni de nouvelles informations sur la relation entre Sirotrema et Sirobasidium.

“Il a été précédemment établi que Sirotrema translucens est apparenté à Sirobasidium car ses basides forment parfois des structures en forme de chaîne”, explique le professeur Degawa. “Cependant, ces chaînes n’ont pas été observées lors de nos analyses morphologiques, et nos résultats suggèrent que Sirotrema translucens devrait, en fait, être réaffecté au genre Phaeotremella.” En raison de la forme apiculée (ou pointue) des basides de l’espèce précédemment non décrite, les chercheurs l’ont nommée “Sirobasidium apiculatum”.

L’identification de cette nouvelle espèce, la redécouverte de Sb. japonicum au Japon, et le changement de nom de Sirotrema translucens en Phaeotremella translucens marquent d’énormes progrès dans la compréhension de la diversité fongique et l’élucidation de la taxonomie des basidiomycètes. champignons au Japon. Ces découvertes importantes ont des applications étendues dans de multiples domaines scientifiques comme la cellule et biologie moléculairele génie génétique, la médecine et les sciences de l’environnement.

L’étude est publiée dans Antoine van Leeuwenhoek.